Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 108,648 | Δ1 bp | 100% | coding (439/744 nt) | zapD ← | FtsZ stabilizer |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 108,648 | 0 | G | . | 95.5% | 1296.0 / 51.7 | 269 | coding (439/744 nt) | zapD | FtsZ stabilizer |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (5/7); new base . (127/130); total (132/137) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.70e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.43e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Polymorphic indel expands or contracts a homopolymer stretch. |
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
GCCACCGTTATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTGGGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCG > CP009273/108499‑108797 | ccACCGTTATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTgg > 2:1325396/1‑150 (MQ=255) cACCGTTATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTggg < 2:499613/150‑1 (MQ=255) aCCGTTATCCTGATAAAAACAATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTgggt < 1:391467/150‑2 (MQ=255) ccGTTATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTgggta < 2:3836460/150‑3 (MQ=255) ccGTTATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTgggta < 1:4687126/150‑3 (MQ=255) ttATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGAt < 2:5043488/150‑1 (MQ=255) tATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATg > 2:1724091/1‑150 (MQ=255) ccTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTGGGGTAGATGCa > 2:2022683/1‑150 (MQ=255) tGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGcc < 2:3578237/150‑1 (MQ=255) tGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGcc > 1:3047211/1‑150 (MQ=255) tAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCaaa > 1:1639265/1‑150 (MQ=255) aaaaCCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAAtg > 2:4026557/1‑150 (MQ=255) aaaaCCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAAtg > 2:156161/1‑150 (MQ=255) aaaCCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAAtgt < 2:1876917/150‑1 (MQ=255) aTTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAAt < 2:3944448/150‑1 (MQ=255) aGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAg > 1:4405256/1‑150 (MQ=255) tGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTaa > 2:5097629/1‑150 (MQ=255) ggTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTaaa > 1:1931962/1‑150 (MQ=255) ggTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTaaa < 1:1562344/150‑1 (MQ=255) gtttgtttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAAt > 2:463521/1‑150 (MQ=255) tttgtttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATc < 2:1803325/150‑1 (MQ=255) tttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTTGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAg < 2:1352287/150‑1 (MQ=255) ttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGc > 1:755081/1‑150 (MQ=255) ttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGc > 1:3686557/1‑150 (MQ=255) tACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCt > 2:345979/1‑150 (MQ=255) tACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCt < 1:1674581/150‑1 (MQ=255) tACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCt < 2:2798914/150‑1 (MQ=255) cGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGc < 1:3385873/150‑1 (MQ=255) ggAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCa > 1:4562948/1‑150 (MQ=255) aaGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAAc > 1:4643119/1‑150 (MQ=255) aaGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAAc > 2:827528/1‑150 (MQ=255) gggCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAgcc > 2:1629802/1‑150 (MQ=255) gggCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAgcc < 2:39661/150‑1 (MQ=255) cGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCt < 1:4842030/150‑1 (MQ=255) cGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCt < 1:2718359/150‑1 (MQ=255) ggCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGAt < 1:1261804/150‑1 (MQ=255) gAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCt > 2:5143039/1‑150 (MQ=255) gAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCt > 1:2086655/1‑150 (MQ=255) aaTTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTc > 2:2399495/1‑150 (MQ=255) aaTTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTc < 1:3495431/150‑1 (MQ=255) aTTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCa > 1:1015212/1‑150 (MQ=255) aTTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCa < 1:1366721/150‑1 (MQ=255) aTTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCa > 1:287046/1‑150 (MQ=255) 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tCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCt > 2:62360/1‑150 (MQ=255) cAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGa > 2:4130375/1‑150 (MQ=255) aCCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCa > 1:2193409/1‑150 (MQ=255) aCCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCa > 2:2497375/1‑150 (MQ=255) ggTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGATCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCaga < 2:265866/150‑1 (MQ=255) aaGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCa > 2:3691434/1‑150 (MQ=255) tGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATc > 1:5130437/1‑150 (MQ=255) ccTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCaa < 1:2546010/150‑1 (MQ=255) cTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCaaa > 1:407202/1‑150 (MQ=255) cTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCaaa > 1:4748246/1‑150 (MQ=255) gggTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTGGGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAAc > 2:2946159/1‑150 (MQ=255) gggTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACg > 1:1122559/1‑150 (MQ=255) gggTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACg > 1:1122854/1‑150 (MQ=255) gTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGAt > 2:1796305/1‑150 (MQ=255) tGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATc < 2:3312308/150‑1 (MQ=255) 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cAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTGGGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATa < 1:4339318/150‑1 (MQ=255) cAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATAc < 1:1819625/150‑1 (MQ=255) cAGGGTTCTCCCGGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGCTGCAGCCAAAGGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATAc < 2:2670813/150‑1 (MQ=255) aGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATAcg > 2:4554884/1‑150 (MQ=255) ttCGACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATAcgcggc < 1:3610018/150‑1 (MQ=255) 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cgcCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTcccc < 1:3559819/150‑1 (MQ=255) cgcCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTccac < 1:2775165/150‑3 (MQ=255) | GCCACCGTTATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTGGGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCG > CP009273/108499‑108797 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |