| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | CP009273 | 2,709,656 | IS2 (–) +5 bp | 100% | coding (149‑153/384 nt) | grcA ← | autonomous glycyl radical cofactor |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 2709656 = | 2 (0.010) | 233 (0.830) | 135/278 | NT | 99.1% | coding (153/384 nt) | grcA | autonomous glycyl radical cofactor |
| ? | CP009273 | = 2991050 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| * | ? | CP009273 | = 2709660 | 2 (0.010) | 298 (1.060) | 163/278 | NT | 99.3% | coding (149/384 nt) | grcA | autonomous glycyl radical cofactor |
| ? | CP009273 | 2989720 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 590 total aligned reads displayed.
GATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAAT > CP009273/2709507‑2709805 | gATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATg > 1:1856774/1‑150 (MQ=255) tACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTc > 1:4795533/1‑150 (MQ=255) tcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCa < 1:53185‑M1/4‑1 (MQ=255) acacGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCa > 1:2733152/1‑150 (MQ=255) tttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCAccc > 2:3628588‑M1/144‑150 (MQ=255) ggATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtgg > 2:2233840‑M1/1‑147 (MQ=255) aTGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggat > 2:124781‑M1/1‑145 (MQ=255) tGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatt > 1:776110‑M1/1‑144 (MQ=255) tGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatt < 2:3573483‑M1/150‑7 (MQ=255) gtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTg > 1:1967504‑M1/138‑150 (MQ=255) cAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcc < 1:4040174‑M1/150‑11 (MQ=255) cTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccct > 2:672433‑M1/1‑137 (MQ=255) gCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctat < 1:4145691‑M1/150‑16 (MQ=255) cGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctata < 2:2749236‑M1/150‑17 (MQ=255) ggATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatat > 2:781672‑M1/1‑133 (MQ=255) gccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCa > 1:3043349‑M1/129‑150 (MQ=255) tctgcgtttctcctgccctaagacatcaatcatcttttatcaaatgaatagtctaaaaactattattaagactatcacttatttcagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCa > 1:1201460‑M1/125‑150 (MQ=255) ctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCAc > 2:440124‑M1/124‑150 (MQ=255) tttCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccaga > 1:33379‑M1/1‑126 (MQ=255) cgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTc > 2:3315285‑M1/121‑150 (MQ=255) gtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCa < 1:1656455‑M1/31‑1 (MQ=255) gtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCa < 1:2503966‑M1/31‑1 (MQ=255) tttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCAt > 2:3041647‑M1/119‑150 (MQ=255) tAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatca > 2:57113‑M1/1‑114 (MQ=255) aaCTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGCTGTAGACCACCTTCAACGCGAACTACTGGTTTCACTACTACTGGACCTTCACGGAAGTCAATGTCACtggatatgcccctatatttccagacatctgatatcac > 2:1022010‑M1/1‑113 (MQ=255) aagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAAcc < 1:1940091‑M1/45‑1 (MQ=255) agacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCt > 2:1297213‑M1/105‑150 (MQ=255) cATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaac > 2:2087367‑M1/1‑108 (MQ=255) aTCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGTACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGATCTTCTGGTTTCACTTCTACTTGCACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacc < 1:2811852‑M1/150‑44 (MQ=255) tcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCttt > 1:2373970‑M1/100‑150 (MQ=255) ccAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccatta > 2:4258127‑M1/1‑102 (MQ=255) acgcctctgttctccaatgactagtctcacaacgagtagtaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGGTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTg > 2:5096412‑M1/98‑150 (MQ=255) agagTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattaca < 2:1921067‑M1/150‑51 (MQ=255) catctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCaa < 2:175958‑M1/56‑1 (MQ=255) ttCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagccc > 2:877619‑M1/1‑95 (MQ=255) tgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGAt > 1:2060399‑M1/91‑150 (MQ=255) tgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGAt > 1:3904701‑M1/91‑150 (MQ=255) tCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCACTGTCACtggatttgcccctctatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccg > 2:4078017‑M1/1‑94 (MQ=255) gttatccaattactagtctaaaaactagtattaagtctatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATg > 1:932573‑M1/90‑150 (MQ=255) aCGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCGTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgcc < 2:4324455‑M1/150‑62 (MQ=255) aatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAAcgcg < 2:4007073‑M1/68‑1 (MQ=255) gAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcaga > 2:3393948‑M1/1‑84 (MQ=255) actagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTc > 1:1714852‑M1/79‑150 (MQ=255) ctagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCg > 2:2000246‑M1/78‑150 (MQ=255) aacgttCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattccc < 1:4613533‑M1/150‑74 (MQ=255) aaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCttttt < 1:4425134‑M1/80‑1 (MQ=255) aaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTc > 2:2386702‑M1/70‑150 (MQ=255) aactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGc < 1:3646213‑M1/83‑1 (MQ=255) actagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCt > 1:3848662‑M1/67‑150 (MQ=255) aGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcga < 1:4550596‑M1/150‑81 (MQ=255) aGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcga < 2:1617887‑M1/150‑81 (MQ=255) aGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcga < 1:644977‑M1/150‑81 (MQ=255) tattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCca > 1:3727141‑M1/62‑150 (MQ=255) ttGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgat > 1:1445264‑M1/1‑65 (MQ=255) tGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgata > 1:832192‑M1/1‑64 (MQ=255) gACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatatgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataa > 2:3734711‑M1/1‑63 (MQ=255) accaccTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataac > 2:2146870‑M1/1‑62 (MQ=255) ccaccTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccactgccgcagatattcccgtggcgagcgataacc > 1:3412853‑M1/1‑61 (MQ=255) caccTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataaccc > 2:4438105‑M1/1‑60 (MQ=255) ccTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccag < 2:2567994‑M1/150‑93 (MQ=255) tatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGa > 2:2952815‑M1/53‑150 (MQ=255) aaCGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcac > 2:698661‑M1/1‑53 (MQ=255) aaCGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcac > 2:4866695‑M1/1‑53 (MQ=255) aaCGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcac < 2:4139924‑M1/150‑98 (MQ=255) ttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGt < 1:3318815‑M1/104‑1 (MQ=255) cgcgAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcacta < 1:2234594‑M1/150‑100 (MQ=255) tatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGtt > 1:4971617‑M1/46‑150 (MQ=255) gAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgc > 2:4540733‑M1/1‑48 (MQ=255) cTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcgga > 2:2326546‑M1/1‑45 (MQ=255) agtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTcagcag < 1:213056‑M1/111‑1 (MQ=255) tCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatagtcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatg < 1:2646749‑M1/150‑108 (MQ=255) tGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgcc < 1:2895634‑M1/150‑110 (MQ=255) ggTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactctgcggatgcca > 2:1339170‑M1/1‑40 (MQ=255) tttCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccatt < 2:1539080‑M1/150‑113 (MQ=255) ttggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGAtcgtcg < 2:4646903‑M1/118‑1 (MQ=255) tggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATcgtcgt < 2:347767‑M1/119‑1 (MQ=255) gttgtctggagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTa < 2:4766112‑M1/121‑1 (MQ=255) ttCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttat < 2:3665716‑M1/150‑119 (MQ=255) cTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataa < 1:1032556‑M1/150‑121 (MQ=255) cTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataa > 1:3695555‑M1/1‑30 (MQ=255) tGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgct > 2:3131429‑M1/1‑26 (MQ=255) tGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgct < 2:1827478‑M1/150‑125 (MQ=255) gagattcagggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCttt > 2:3842611‑M1/22‑150 (MQ=255) ggAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctc < 2:2892583‑M1/150‑126 (MQ=255) gAACTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcg < 2:619153‑M1/150‑127 (MQ=255) cTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaac > 2:2491033‑M1/1‑21 (MQ=255) cTTCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaac < 1:2772981‑M1/150‑130 (MQ=255) ttCACGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacg < 1:5085991‑M1/150‑131 (MQ=255) gggggccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCt > 1:4878440‑M1/14‑150 (MQ=255) aCGGTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcct < 2:1472200‑M1/150‑134 (MQ=255) ggTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgctgatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctct < 1:1359657‑M1/150‑136 (MQ=255) ggTATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctct < 1:886085‑M1/150‑136 (MQ=255) tATTCAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgc > 1:3519182‑M1/1‑13 (MQ=255) ccagtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATa > 1:3249230‑M1/9‑150 (MQ=255) gtctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCt > 2:4605449‑M1/6‑150 (MQ=255) tctaGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTg > 2:3296018‑M1/5‑150 (MQ=255) cAATGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaagg < 2:1132383‑M1/150‑142 (MQ=255) taGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTa < 1:4285715‑M1/148‑1 (MQ=255) aTGTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggtt > 1:107146‑M1/1‑7 (MQ=255) aGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTaa > 1:3127570‑M1/2‑150 (MQ=255) | GATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCATCTTCTGCATAACCTGCTTTTGCAACGATGCAACGCGCTTCGCCTTTTTCGCTGTCCAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAAT > CP009273/2709507‑2709805 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |