| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2871150 | 382 (1.360) | 3 (0.010) | 3/242 | NT | 0.96% | intergenic (+173/+778) | iap/ygbF | aminopeptidase in alkaline phosphatase isozyme conversion/CRISPR adaptation ssRNA endonuclease |
| ? | CP009273 | 2871334 = | 285 (1.170) | intergenic (+357/+594) | iap/ygbF | aminopeptidase in alkaline phosphatase isozyme conversion/CRISPR adaptation ssRNA endonuclease | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 463 total aligned reads displayed.
AGTTCTACCGCAGAGGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGC > CP009273/2871001‑2871299 | ttCTACCGCAGAGGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCg > 2:4942281/1‑150 (MQ=255) cTACCGCAGAGGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGt < 2:2594801/150‑1 (MQ=255) aCCGCAGAGGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTc > 2:2859238/1‑150 (MQ=255) cGCAGAGGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTccg > 2:825634/1‑148 (MQ=255) cAGAGGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGc > 2:1505077/1‑150 (MQ=255) cAGAGGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGc > 1:2872045/1‑150 (MQ=255) agagGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCg < 2:1918802/150‑1 (MQ=255) agagGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCg > 2:1716312/1‑150 (MQ=255) agGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGGTTATCACTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGtt > 2:1284274/1‑150 (MQ=255) cGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCa < 2:4770114/150‑1 (MQ=255) cGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCa > 1:308437/1‑150 (MQ=255) ggggAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCaaa < 2:4876527/150‑1 (MQ=255) ggAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAAcc > 2:961282/1‑150 (MQ=255) aaCTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTg < 2:444256/150‑1 (MQ=255) atatCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCg < 1:3758014/150‑1 (MQ=255) tatCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCgg > 2:240366/1‑150 (MQ=255) ccATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGttt > 1:2707178/1‑150 (MQ=255) atcatcGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTAt > 1:3803453/1‑150 (MQ=255) atcatcGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTAt < 1:118173/150‑1 (MQ=255) catcGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATcc > 1:1222587/1‑150 (MQ=255) tcGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGCTGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTAGCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTACcccc < 1:920593/150‑1 (MQ=255) cGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCg < 1:3889296/150‑1 (MQ=255) cATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCt < 1:4942963/150‑1 (MQ=255) aTCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTa > 1:2523166/1‑150 (MQ=255) tCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTaa < 1:3691126/150‑1 (MQ=255) tCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTaa < 1:1417642/150‑1 (MQ=255) ccAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGGTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAAc > 1:2733121/1‑150 (MQ=255) aGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAAcgc > 2:1152856/1‑150 (MQ=255) aGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAAcgc > 2:3787652/1‑150 (MQ=255) gTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAAcgcg < 2:3825433/150‑1 (MQ=255) gccGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGaa < 2:79779/149‑1 (MQ=255) cccGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTAGCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGaa < 2:2009415/150‑1 (MQ=255) ccGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAAc > 2:4059142/1‑150 (MQ=255) ccGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAAc > 1:4114111/1‑150 (MQ=255) ggTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTc > 2:703443/1‑150 (MQ=255) ggTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTc < 1:21379/150‑1 (MQ=255) ggTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTc < 1:2923059/150‑1 (MQ=255) gTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatc < 1:3030242‑M1/129‑41 (MQ=255) tttATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGt > 2:2964405/1‑150 (MQ=255) aTCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGt < 1:290368/150‑1 (MQ=255) cccGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGACCTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCca > 1:2434407/1‑150 (MQ=255) ccGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTTCCGGTTTATACCTTCAGGCGCGGGGAAATCTATGTTCAGGCGATTCCAACAAGTCTAACGGGCGGTGTATCCCCGCTAACTCGGGGAACTCGTAGTCaat > 1:2093143/1‑150 (MQ=255) ccGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCcat < 1:657039/150‑1 (MQ=255) 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1:3976619/150‑1 (MQ=255) gctgGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATaa < 1:1242016/150‑1 (MQ=255) ctgGCGCGGGGAACTCTgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcggggaactcaagctggctggcaatctctttcggggtgagtccggtttatccccgctggcgcggggaactctagtttccgtat < 2:3455446‑M1/150‑134 (MQ=255) tgGCGCGGGGAACTCTgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcggggaactcaagctggctggcaatctctttcggggtgagtccggtttatccccgctggcgcggggaactctagtttccgtatc > 2:3111300‑M1/1‑16 (MQ=255) tgGCGCGGGGAACTCTgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcggggaactcaagctggctggcaatctctttcggggtgagtccggtttatccccgctggcgcggggaactctagtttccgtatc > 1:3384475‑M1/1‑16 (MQ=255) tgGCGCGGGGAACTCTgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcggggaactcaagctggctggcaatctctttcggggtgagtccggtttatccccgctggcgcggggaactctagtttccgtatc > 2:2079932‑M1/1‑16 (MQ=255) ggCGCGGGGAACTCTgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcggggaactcaagctggctggcaatctctgtcggggtgagtccggtttatccccgctggcgcggggaactctagtttccgtatct > 1:68373‑M1/1‑15 (MQ=255) gcgGGGAACTCTgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcggggaactcaagctggctggcaatctctttcggggtgagtccggtttatccccgctggcgcggggaactctagtttccgtatctccg < 2:185733‑M1/150‑139 (MQ=255) cgGGGAACTCTgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtgtatccccgctggcgcggggaactcaagctggctggcaatctctttcggggtgagtccggtttatccccgctggcgcggggaactctagtttccgtatctccgg < 2:4827858‑M1/150‑140 (MQ=255) ggggAACTCTgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcggggaactccagctggctggcaatctctttcggggagagtccggtttatccccgctggcgcggggaactctagtttccgtatctccgga > 1:567209‑M1/1‑10 (MQ=255) ggggAACTCTgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcggggaactcaagctggctggcaatctctttcggggtgagtccggtttatccccgctggcgcggggaactctagtttccgtatctccgga < 2:1221363‑M1/150‑141 (MQ=255) 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tcGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATgcgc < 1:1716312/150‑1 (MQ=255) | AGTTCTACCGCAGAGGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGC > CP009273/2871001‑2871299 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |