New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 360652 = | 321 (1.140) | 4919 (26.240) +AATTAATGTAAGTTAGCGCGAATTTATCTGGTTTGACAGCTTATCA |
186/186 | NT | 96.1% | intergenic (‑586/+9) | lacZ/lacI | pseudogene, truncated/DNA‑binding transcriptional repressor |
? | CP009273 | = 1317577 | 274 (0.970) | coding (101/882 nt) | yciV | PHP domain protein |
Only 100 of 26587 total aligned reads displayed.
ACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAGATGCGCGTCGGCACCCTGGCGATCACCGACCATGACACCACAGCTGCAATCGCGCCAGCAAGAGAGGAAATTTCACGTTCGGGACTGGCGTTGAATCTTATTCCCGGCGTGGAAATTTCCACGGTCTGGGAAAATCATGAAATTCATA > CP009273/1317428‑1317726 | ccGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAt > 1:1382505‑M2/1‑149 (MQ=255) cGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAta > 2:3524419‑M2/1‑148 (MQ=255) gatgTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagc < 1:724034‑M2/150‑9 (MQ=255) atgTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagct < 1:45665‑M2/150‑10 (MQ=255) gTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgt < 2:334163‑M2/150‑12 (MQ=255) tCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtc < 1:2737184‑M2/150‑13 (MQ=255) tCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtc > 1:300705‑M2/1‑138 (MQ=255) cgcAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaac > 1:2449798‑M2/1‑134 (MQ=255) cAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGCtgataagctgtcaaacca < 1:4110839‑M2/150‑19 (MQ=255) cAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaacca < 1:2164711‑M2/150‑19 (MQ=255) aaaaaaCATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCATTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccag > 1:992840‑M2/1‑131 (MQ=255) cATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTACCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaat < 1:1555527‑M2/150‑26 (MQ=255) aTTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaatt > 2:2869962‑M2/1‑124 (MQ=255) tATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCATGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcg > 1:4026478‑M2/1‑122 (MQ=255) ccAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgc < 1:4837864‑M2/150‑32 (MQ=255) ataacgTGAGTGCGCCTTGAGAGACACGAATTATTCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgcta > 2:2679779‑M2/3‑117 (MQ=255) aGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgcta < 2:4061373‑M2/150‑34 (MQ=255) aGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgcta > 2:915190‑M2/1‑117 (MQ=255) aGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaaatcgcgcta < 2:4812481‑M2/150‑34 (MQ=255) gAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaa < 2:541419‑M2/150‑35 (MQ=255) gAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaa > 2:4719732‑M2/1‑116 (MQ=255) aaCGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaac > 1:1091294‑M2/1‑115 (MQ=255) gggAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaactta < 2:2394864‑M2/150‑39 (MQ=255) ggAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCAGTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttac < 1:1654506‑M2/150‑40 (MQ=255) gAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgatacgctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttaca > 1:3836283‑M2/1‑110 (MQ=255) aGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacat < 1:1463982‑M2/150‑42 (MQ=255) aGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacat > 2:3611132‑M2/1‑109 (MQ=255) tGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacatta > 1:4928252‑M2/1‑107 (MQ=255) tGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacatta < 2:3965544‑M2/150‑44 (MQ=255) gcgcCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaa < 2:2775673‑M2/150‑45 (MQ=255) gcCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaatt > 1:3564202‑M2/1‑104 (MQ=255) gcCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaatt < 2:1084410‑M2/150‑47 (MQ=255) cTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgc > 2:723492‑M2/1‑102 (MQ=255) ttGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcg < 1:12777‑M2/150‑50 (MQ=255) tGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCAGTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattcattgcgt < 1:3389083‑M2/150‑51 (MQ=255) aGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttg > 1:3191224‑M2/1‑98 (MQ=255) gCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgc < 2:824189‑M2/150‑54 (MQ=255) gCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgc > 2:4632959‑M2/1‑97 (MQ=255) cGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCAGACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcg > 2:1745871‑M2/1‑96 (MQ=255) cGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcac > 2:1445584‑M2/1‑91 (MQ=255) gAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcact > 1:438143‑M2/1‑90 (MQ=255) aaTTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactg < 2:1266332‑M2/150‑62 (MQ=255) aTTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgc > 2:4335434‑M2/1‑88 (MQ=255) ttATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcc > 1:3658‑M2/1‑87 (MQ=255) tATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgccc > 2:644426‑M2/1‑86 (MQ=255) aTGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccg > 2:1938499‑M2/1‑85 (MQ=255) aGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgcttt < 2:117917‑M2/150‑70 (MQ=255) aGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgcttt > 1:283209‑M2/1‑81 (MQ=255) gATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttcca > 1:1752117‑M2/1‑78 (MQ=255) aTTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccag > 1:4652453‑M2/1‑77 (MQ=255) tttACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagt < 1:813087‑M2/150‑75 (MQ=255) ttACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtc < 2:4531300‑M2/150‑76 (MQ=255) tACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcg < 2:4904752‑M2/150‑77 (MQ=255) tACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCAGTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcg < 1:2922183‑M2/150‑77 (MQ=255) aCGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgg < 2:3782887‑M2/150‑78 (MQ=255) gACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcggga > 2:5096167‑M2/1‑71 (MQ=255) ccTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaa < 1:4293095‑M2/150‑82 (MQ=255) tGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacc > 2:296551‑M2/1‑67 (MQ=255) gCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacct > 2:3435979‑M2/1‑66 (MQ=255) cacaGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctg > 2:248346‑M2/1‑65 (MQ=255) acaGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgt > 1:3290343‑M2/1‑64 (MQ=255) caGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtc > 1:2256717‑M2/1‑63 (MQ=255) caGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtc > 1:2548926‑M2/1‑63 (MQ=255) aGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGGGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcg > 1:5007452‑M2/1‑62 (MQ=255) gCCAGACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacatttattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgt > 1:4756293‑M2/1‑61 (MQ=255) ccATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtg > 1:2358575‑M2/1‑60 (MQ=255) cATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtga < 1:2642885‑M2/150‑92 (MQ=255) aTACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgcc > 2:1840347‑M2/1‑58 (MQ=255) taaaccagcgtcCGATGGCTGCCTGACGACAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagagaaattcgcgctaactgtcattaattgcgttgcgctcacggcccgctttccagtctggaaacctgtcgtgcca > 2:2202532‑M2/6‑57 (MQ=255) ccACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagc < 2:202272‑M2/150‑96 (MQ=255) cacaGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagct < 1:2062397‑M2/150‑97 (MQ=255) gCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcat < 1:1000367‑M2/150‑101 (MQ=255) cTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcatt > 1:3923505‑M2/1‑49 (MQ=255) ttCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcatta > 2:3141784‑M2/1‑48 (MQ=255) gATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatga > 1:5096378‑M2/1‑44 (MQ=255) ggCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatc < 1:3098767‑M2/150‑110 (MQ=255) cTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcgg < 1:907010‑M2/150‑112 (MQ=255) gCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggcc < 1:3468935‑M2/150‑114 (MQ=255) ccTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggcca > 2:4157961‑M2/1‑36 (MQ=255) tGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaac < 2:3045577‑M2/150‑117 (MQ=255) tGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaac > 1:1178631‑M2/1‑34 (MQ=255) gACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacg > 2:4435362‑M2/1‑33 (MQ=255) aCGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgc < 2:1649866‑M2/150‑119 (MQ=255) gAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcgggg < 2:2294210‑M2/150‑125 (MQ=255) aGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggag < 2:3235810‑M2/150‑127 (MQ=255) gCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggaga > 1:4474994‑M2/1‑23 (MQ=255) cATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagag < 1:1958383‑M2/150‑129 (MQ=255) ttGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggc > 1:4209181‑M2/1‑20 (MQ=255) ttGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggc < 1:3756176‑M2/150‑131 (MQ=255) ttGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggc > 2:2112998‑M2/1‑20 (MQ=255) tGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcg < 2:4240194‑M2/150‑132 (MQ=255) ggTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcgg < 2:136014‑M2/150‑133 (MQ=255) gTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggt > 1:536789‑M2/1‑17 (MQ=255) ccGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggtttgcg > 2:3872831‑M2/1‑12 (MQ=255) cGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggtttgcgt < 2:2571526‑M2/150‑140 (MQ=255) gCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggtttgcgtatt > 2:1541417‑M2/1‑8 (MQ=255) gCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggtttgcgtatt > 1:1856421‑M2/1‑8 (MQ=255) cGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggtttgcgtattgggcg > 2:5002622‑M2/1‑3 (MQ=255) cGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggtttgcgtattgggcg > 2:3700501‑M2/1‑3 (MQ=255) atgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggtttgcgtattgggcgcc < 1:628889‑M2/150‑150 (MQ=255) | ACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAGATGCGCGTCGGCACCCTGGCGATCACCGACCATGACACCACAGCTGCAATCGCGCCAGCAAGAGAGGAAATTTCACGTTCGGGACTGGCGTTGAATCTTATTCCCGGCGTGGAAATTTCCACGGTCTGGGAAAATCATGAAATTCATA > CP009273/1317428‑1317726 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |