| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 42 | G→T | 5.6% | intergenic (–/‑148) | – / → thrL | –/thr operon leader peptide |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 42 | 0 | G | T | 5.6% | 886.2 / 19.0 | 249 | intergenic (–/‑148) | –/thrL | –/thr operon leader peptide |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (122/113); new base T (9/5); total (131/118) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.20e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.62e-01 | |||||||||||
Only 100 of 261 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACTTTAACCAATATAGGCATAGCGCACAGACAGATAAAAATTACAGAGTACACAACATCC > CP009273/1‑189 | caacgcctggggcttttagagcaacgagacacggcaatgttgcaccgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCtgtgtg > 2:275734‑M1/109‑150 (MQ=255)caacgcctggggcttttagagcaacgagacacggcaatgttgcaccgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCtgtgtg < 2:4481379‑M1/42‑1 (MQ=255) aacgcctggggcttttagagcaacgagacacggcaatgttgcaccgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTgg < 1:2380974‑M1/43‑1 (MQ=255) gcctggggcttttagagcaacgagacacggcaatgttgcaccgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGAtt > 1:291483‑M1/105‑150 (MQ=255) cctggggcttttagagcaacgagacacggcaatgttgcaccgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTa > 1:2494650‑M1/104‑150 (MQ=255) ctggggcttttagagcaacgagacacggcaatgttgcaccgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTaa < 2:5035355‑M1/48‑1 (MQ=255) tggggcttttagagcaacgagacacggcaatgttgcaccgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTaaa < 2:1559901‑M1/49‑1 (MQ=255) gggcttttagagcaacgagacacggcaatgttgcaccgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTaaaaa < 2:2980461‑M1/51‑1 (MQ=255) ggcttttagagcaacgagacacggcaatgttgcaccgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTaaaaaa < 2:2125534‑M1/52‑1 (MQ=255) ttagagcaacgagacacggcaatgttgcaccgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAgt < 1:627069‑M1/57‑1 (MQ=255) gagcaacgagacacggcaatgttgcaccgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTc > 1:3842361‑M1/91‑150 (MQ=255) tcaacgagacactgcaatgttgcaccgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaatacaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTg > 2:4689675‑M1/89‑150 (MQ=255) caacgagacacggcaatgttgcaccgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGa > 1:4560094‑M1/88‑150 (MQ=255) aacgagacacggcaatgttgcaccgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTTGATTAAAAAAAGAGTGTCTGAt > 1:2808301‑M1/87‑150 (MQ=255) acgagacacggcaatgttgcaccgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATa < 1:886994‑M1/65‑1 (MQ=255) acgagacacggcaatgttgcaccgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATa > 1:2606349‑M1/86‑150 (MQ=255) cgagacacggcaatgttgcaccgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATag < 1:3672691‑M1/66‑1 (MQ=255) gagacacggcaatgttgcaccgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATagc < 1:745232‑M1/67‑1 (MQ=255) cacggcaatgttgcaccgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTTGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCt < 1:593061‑M1/71‑1 (MQ=255) cacggcaatgttgcaccgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCt < 1:4183063‑M1/71‑1 (MQ=255) cggcaatgttgcaccgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTc < 2:2548313‑M1/73‑1 (MQ=255) cggcaatgttgcaccgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTc > 1:2234892‑M1/78‑150 (MQ=255) cggcaatgttgcaccgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTc > 2:3419525‑M1/78‑150 (MQ=255) caatgttgcaccgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGa < 1:4517111‑M1/76‑1 (MQ=255) tgttgcaccgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACt > 1:2055473‑M1/72‑150 (MQ=255) gcaccgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGtt < 1:3629875‑M1/83‑1 (MQ=255) caccgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTa > 1:739635‑M1/67‑150 (MQ=255) accgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTAc < 1:3583957‑M1/85‑1 (MQ=255) accgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTAc < 1:2806913‑M1/85‑1 (MQ=255) cgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCt < 2:4322922‑M1/87‑1 (MQ=255) cgtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCt > 1:5010138‑M1/64‑150 (MQ=255) gtttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTg > 2:3379048‑M1/63‑150 (MQ=255) ttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGcc < 1:3723338‑M1/90‑1 (MQ=255) ttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGcc > 2:4219281‑M1/61‑150 (MQ=255) ttgctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGcc < 1:2672268‑M1/90‑1 (MQ=255) ctgcatgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTg < 1:1366372‑M1/93‑1 (MQ=255) catgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGt < 2:1574732‑M1/96‑1 (MQ=255) tgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTaa > 1:1719102‑M1/53‑150 (MQ=255) tgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTaa > 1:4735300‑M1/53‑150 (MQ=255) tgatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTaa > 1:4797617‑M1/53‑150 (MQ=255) gatattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTaaa > 2:173216‑M1/52‑150 (MQ=255) atattgaaaaaaatatcaccaaataacaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAAt > 1:154720‑M1/51‑150 (MQ=255) atattgaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAAt > 2:1131110‑M1/51‑150 (MQ=255) gaaaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTaaaa < 2:1546524‑M1/105‑1 (MQ=255) aaaaaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAAtt < 1:1006177‑M1/107‑1 (MQ=255) aaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTa < 1:2885430‑M1/110‑1 (MQ=255) aaatatcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTa < 1:231287‑M1/110‑1 (MQ=255) atcaccaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGa > 1:4824494‑M1/37‑150 (MQ=255) tcaccaaataaaaaacgccgtagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCACCGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGAc < 1:800290‑M1/115‑1 (MQ=255) accaaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACtt > 1:344265‑M1/34‑150 (MQ=255) caaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAg < 2:1000964‑M1/119‑1 (MQ=255) aaataaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTTGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAgg < 2:3680505‑M1/120‑1 (MQ=255) taaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCa < 2:244757‑M1/123‑1 (MQ=255) taaaaaacgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCa > 1:122239‑M1/28‑150 (MQ=255) acgccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAAt < 2:3468568‑M1/129‑1 (MQ=255) gccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTTGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATAc < 2:837911‑M1/131‑1 (MQ=255) ccttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACt < 1:4858522‑M1/132‑1 (MQ=255) ttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACttt < 2:1311959‑M1/134‑1 (MQ=255) ttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACttt > 1:3302029‑M1/17‑150 (MQ=255) ttagtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACttt < 2:1648463‑M1/134‑1 (MQ=255) agtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACTTTaa < 1:1324528‑M1/136‑1 (MQ=255) agtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACTTTaa < 1:1465718‑M1/136‑1 (MQ=255) gtaagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACTTTAAc > 2:3264895‑M1/14‑150 (MQ=255) taagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACtttatcc < 2:4141410‑M1/138‑4 (MQ=255) aagtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACTTTAACCa > 2:1858672‑M1/12‑150 (MQ=255) gtatttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACTTTAACCAat < 2:2156415‑M1/141‑1 (MQ=255) tttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACTTTAACCAAtata > 1:682165‑M1/7‑150 (MQ=255) tttttcAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACTTTAACCAAtata < 1:671362‑M1/144‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |