Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,785,915 | G→T | 100% | intergenic (‑4/+271) | kbl ← / ← yibB | glycine C‑acetyltransferase/YibB family protein, function unknown |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,785,915 | 0 | G | T | 100.0% | 859.6 / NA | 254 | intergenic (‑4/+271) | kbl/yibB | glycine C‑acetyltransferase/YibB family protein, function unknown |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (125/129); total (125/129) | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 254 total aligned reads displayed.
ACAAAAGTTAATGACGTGGCTTCCATCAGCCACAGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCGATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGCGACGAGATAACGCGTTAACACTTCTGCAAAATTCAGGATAAATAACGTGTAACTTGATGTCTCTCAACACCTACAGATAGTAGAAAAACTGTAC > CP009273/3785768‑3786061 | acaAAAGTTAATGACGTGGCTTCCATCAGCCACAGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTAt < 2:2092008/150‑1 (MQ=255) caAAAGTTAATGACGTGGCTTCCATCAGCCACAGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTAtt > 1:3386568/1‑150 (MQ=255) aaaaGTTAATGACGTGGCTTCCATCAGCCACAGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAATCAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATtc > 1:4261471/1‑150 (MQ=255) aaaGTTAATGACGTGGCTTCCATCAGCCACAGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATtct > 2:2631700/1‑150 (MQ=255) aaGTTAATGACGTGGCTTCCATCAGCCACAGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATtctc > 2:1424579/1‑150 (MQ=255) aGTTAATGACGTGGCTTCCATCAGCCACAGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTcc > 2:2365603/1‑150 (MQ=255) gTTTATGACGTGGCTTCAATCAGCCACAGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCa < 1:2901252/150‑1 (MQ=255) gTTAATGACGTGGCTTCCATCAGCCACAGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCa > 1:141396/1‑150 (MQ=255) gTTAATGACGTGGCTTCCATCAGCCACAGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCa < 1:3514208/150‑1 (MQ=255) tAATGACGTGGCTTCCATCAGCCACAGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGa < 2:193474/150‑1 (MQ=255) aaTGACGTGGCTTCCATCAGCCACAGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGAc > 2:1026685/1‑150 (MQ=255) aTGACGTGGCTTCCATCAGCCACAGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACa < 2:3408027/150‑1 (MQ=255) tGACGTGGCTTCCATCAGCCACAGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGAccg > 2:2386457/1‑148 (MQ=255) gACGTGGCTTCCATCAGCCACAGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAgg < 2:3006281/150‑1 (MQ=255) gTGGCTTCCATCAGCCACAGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCa < 1:3171448/150‑1 (MQ=255) tGGCTTCCATCAGCCACAGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCaa < 2:4118477/150‑1 (MQ=255) cTTCCATCAGCCACAGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAAtt < 2:2293496/150‑1 (MQ=255) ttCCATCAGCCACAGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTc > 1:244384/1‑150 (MQ=255) 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tCAGCCACAGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGca < 2:4887198/150‑1 (MQ=255) cAGCCACAGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGcac > 1:1018393/1‑150 (MQ=255) aGCCACAGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGcaca > 1:1280330/1‑150 (MQ=255) cacaGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACatat > 2:4306631/1‑150 (MQ=255) cacaGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACatat < 1:155470/150‑1 (MQ=255) gATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCa > 1:723072/1‑150 (MQ=255) gATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCa < 1:4852010/150‑1 (MQ=255) atatCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCaa > 1:2724668/1‑150 (MQ=255) tgcttgctGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTta < 1:1627826/150‑1 (MQ=255) gcttgctGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTtat < 2:4088826/150‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAgg > 1:2263209/1‑150 (MQ=255) ctgcGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTc < 1:3718488/150‑1 (MQ=255) tgcGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTcg > 2:1696346/1‑150 (MQ=255) tgcGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTcg > 2:3468623/1‑150 (MQ=255) tgcGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTcg < 2:1906770/150‑1 (MQ=255) gcgcAGTCGTAATAATGCGATCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTACACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTcgc < 2:1601496/150‑1 (MQ=255) cAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGcgac < 2:778890/150‑1 (MQ=255) cAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGcgac < 1:866274/150‑1 (MQ=255) aGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGcgacg > 2:1047112/1‑150 (MQ=255) aCGTAATAATGCTCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCTTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCTTTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGCGACgag < 1:3743129/150‑1 (MQ=255) ataatGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGCGACGAGATAAc < 1:4289785/150‑1 (MQ=255) ataatGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGCGACGAGATAAc > 1:4786382/1‑150 (MQ=255) atGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGCGACGAGATAAcgcg < 1:2110133/150‑1 (MQ=255) atGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGCGACGAGATAAcgcg > 2:2647910/1‑150 (MQ=255) atGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATGACCCAAACTTATAGGTCGCGACGAGATAAcgcg > 2:2648120/1‑150 (MQ=255) cgcTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGCGACGAGATAACGCGTTa < 1:4497252/150‑1 (MQ=255) gcTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGCGACGAGATAACGCGTTaa > 2:40169/1‑150 (MQ=255) gcTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGCGACGAGATAACGCGTTaa > 2:3353773/1‑150 (MQ=255) ctctTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGCGACGAGATAACGCGTTAac < 2:1473386/150‑1 (MQ=255) tcttctTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGCGACGAGATAACGCGTTAaca > 2:3689135/1‑150 (MQ=255) tcttctTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGCGACGAGATAACGCGTTAaca > 1:2505639/1‑150 (MQ=255) tcttctTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGCGACGAGATAACGCGTTAaca < 2:1499183/150‑1 (MQ=255) cttcttTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGCGACGAGATAACGCGTTAacac > 1:4190835/1‑150 (MQ=255) cttTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGCGACGAGATAACGCGTTAACACTTc > 1:1054909/1‑150 (MQ=255) tttAAACTCCCTTTCCGCCCGTGCGTTTTTCATTTAGTTGGTTAAATGCTGATAAATTTCTCCACGCATTGCTATTATCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGCGACGAGATAACGCGTTAACACTTCt < 2:4831713/150‑1 (MQ=255) tttAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGCGACGAGATAACGCGTTAACACTTCt < 1:3134674/150‑1 (MQ=255) tttAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGCGACGAGATAACGCGTTAACACTTCt > 1:1247529/1‑150 (MQ=255) acaacCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGCGACGAGATAACGCGTTAACACTTCTGCaaa > 1:4035856/1‑150 (MQ=255) caacCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGCGACGAGATAACGCGTTAACACTTCTGCaaaa > 1:967334/1‑150 (MQ=255) aacCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGCGACGAGATAACGCGTTAACACTTCTGCAAAAt > 2:3586346/1‑150 (MQ=255) 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ttCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGCGACGAGATAACGCGTTAACACTTCTGCAAAATTCAgg > 1:4633131/1‑150 (MQ=255) ttCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGCGACGAGATAACGCGTTAACACTTCTGCAAAATTCAgg < 2:3201072/150‑1 (MQ=255) ttCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGCGACGAGATAACGCGTTAACACTTCTGCAAAATACAgg > 1:1382879/1‑150 (MQ=255) tCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGCGACGAGATAACGCGTTAACACTTCTGCAAAATTCTGGa < 2:3088848/150‑1 (MQ=255) tCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGCGACGAGATAACGCGTTAACACTTCTGCAAAATTCAGGa > 2:3762804/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |