Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 320,920 | 0 | G | A | 100.0% | 575.8 / NA | 174 | S52S (AGC→AGT) | ykgH | putative inner membrane protein |
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Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
TATTTCTCTGTTCTTGACATCTGGGCTGGTGTGAAAAAATGTAGTAATTCGCTGAATAACATCTTCAGTCATTGTAGTCTGACAGGCAAAATTATTATTGCTATCACAGCTAACAAGTATACCTGGCGTTGTCTGGTTTATTTTTAGGCTGTAAATCACTTTTATATTGTCTTTATTGATATACAGAAACAACAGCACCATAGCCATACATATAGCCATAATAAAAAGGATAACACGAATCTTTTTCTTCAGATAAAATAAAATCTCAATCAGATCGATATCCTGTTTGATTTG > CP009273/320773‑321066 | aTTTCTCTGTTCTTGACATCTGGGCTGGTGTGAAAAAATGTAGTAATTCGCTGAATAACATCTTCAGTCATTGTAGTCTGACAGGCAAAATTATTATTGCTATCACAGCTAACAAGTATACCTGGCGTTGTCTGGTTTATTTTTAGACTg > 1:3798778/1‑150 (MQ=255) ttCTCTGTTCTTGACATCTGGGCTGGTGTGAAAAAATGTAGTAATTCGCTGAATAACATCTTCAGTCATTGTAGTCTGACAGGCAAAATTATTATTGCTATCACAGCTAACAAGTATACCTGGCGTTGTCTGGTTTATTTTTAGACTGTa > 1:365809/1‑150 (MQ=255) ctctGTTCTTGACATCTGGGCTGGTGTGAAAAAATGTAGTAATTCGCTGAATAACATCTTCAGTCATTGTAGTCTGACAGGCAAAATTATTATTGCTATCACAGCTAACAAGTATACCTGGCGTTGTCTGGTTTATTTTTAGACTGTaaa > 2:691604/1‑150 (MQ=255) 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ttAGACTGTAAATCACTTTTATATTGTCTTTATTGATATACAGAAACAACAGCACCATAGCCATACATATAGCCATAATAAAAAGGATAACACGAATCTTTTTCTTCAGATAAAATAAAATCTCAATCAGATCGATATCCTGTTTGAttt > 2:285661/1‑150 (MQ=255) tAGACTGTAAATCACTTTTATATTGTCTTTATTGATATACAGAAACAACAGCACCATAGCCATACATATAGCCATAATAAAAAGGATAACACGAATCTTTTTCTTCAGATAAAATAAAATCTCAATCAGATCGATATCCTGTTTGATTTg > 1:4276623/1‑150 (MQ=255) | TATTTCTCTGTTCTTGACATCTGGGCTGGTGTGAAAAAATGTAGTAATTCGCTGAATAACATCTTCAGTCATTGTAGTCTGACAGGCAAAATTATTATTGCTATCACAGCTAACAAGTATACCTGGCGTTGTCTGGTTTATTTTTAGGCTGTAAATCACTTTTATATTGTCTTTATTGATATACAGAAACAACAGCACCATAGCCATACATATAGCCATAATAAAAAGGATAACACGAATCTTTTTCTTCAGATAAAATAAAATCTCAATCAGATCGATATCCTGTTTGATTTG > CP009273/320773‑321066 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |