| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,173,179 | G→T | 100% | P669P (CCG→CCT) | rpoB → | RNA polymerase, beta subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,173,179 | 0 | G | T | 99.7% | 1123.8 / ‑5.0 | 334 | P669P (CCG→CCT) | rpoB | RNA polymerase, beta subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base T (158/175); minor base A (1/0); total (159/175) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.76e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 338 total aligned reads displayed.
CTCCAACTTGGATGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAGC > CP009273/4173032‑4173325 | tCCAACTTGGATGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTc > 1:3616362/1‑150 (MQ=255) tCCAACTTGGATGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTc > 2:4034407/1‑150 (MQ=255) tCCAACTTGGATGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTc < 2:4163790/150‑1 (MQ=255) aaCTTGGATGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTg < 1:3929536/150‑1 (MQ=255) cTTGGATGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGa > 1:3005179/1‑150 (MQ=255) cTTGGATGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGa < 2:39804/150‑1 (MQ=255) cTTGGATGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGa > 1:3720410/1‑150 (MQ=255) ttGGATGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGaa > 2:3803176/1‑150 (MQ=255) aTGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACg > 2:330257/1‑150 (MQ=255) tGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGa > 1:239621/1‑150 (MQ=255) tGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGa > 2:314359/1‑150 (MQ=255) gaagaaGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGAt < 2:232332/150‑1 (MQ=255) aagaagGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATg < 1:3150660/150‑1 (MQ=255) agaagGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGa > 1:2429739/1‑150 (MQ=255) agGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGc > 2:4583909/1‑150 (MQ=255) gCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCa < 2:2418064/150‑1 (MQ=255) cACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAAc > 2:4945809/1‑150 (MQ=255) cGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGc > 2:2739851/1‑150 (MQ=255) gTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCa < 1:2243072/150‑1 (MQ=255) gTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCa < 1:3765930/150‑1 (MQ=255) agaagaCCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCAtt > 1:1233826/1‑150 (MQ=255) aagaCCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGa < 2:318913/150‑1 (MQ=255) agaCCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGAt < 2:2967621/150‑1 (MQ=255) cTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGt > 1:4819678/1‑150 (MQ=255) tGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTg > 2:590074/1‑150 (MQ=255) tGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTg > 2:1645791/1‑150 (MQ=255) gTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCg < 2:756054/150‑1 (MQ=255) gTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCg > 1:5066511/1‑150 (MQ=255) cTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACa > 1:1447366/1‑150 (MQ=255) gCCTTAGCAATGGCTATTCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCTGGTTGACTACATGGACGTTTCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCTTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACTATGACGCAAACCGTGAATTTATGGGTGCGAACATGc < 2:5095476/150‑1 (MQ=255) gCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGc < 2:1596970/150‑1 (MQ=255) cGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCaa > 1:640212/1‑150 (MQ=255) gTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAAc > 2:4131988/1‑150 (MQ=255) gTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAAc > 2:132199/1‑150 (MQ=255) tAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACg < 2:4639728/150‑1 (MQ=255) tAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACg > 2:805032/1‑150 (MQ=255) cAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCa < 2:4499458/150‑1 (MQ=255) aaaGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAg < 2:1962761/150‑1 (MQ=255) aaGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAgg > 2:1345896/1‑150 (MQ=255) ggCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCATGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGcc < 1:3631823/150‑1 (MQ=255) ggCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGcc > 2:3056841/1‑150 (MQ=255) ggCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCATTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGcc > 2:1805503/1‑150 (MQ=255) gAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGtt > 1:2651597/1‑150 (MQ=255) gAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGtt < 2:3526873/150‑1 (MQ=255) gAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGtt > 2:2101237/1‑150 (MQ=255) aaTCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGTTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTc < 2:289570/150‑1 (MQ=255) aTCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTcc < 1:4034407/150‑1 (MQ=255) tCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATTCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCg < 2:1941590/150‑1 (MQ=255) tCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCg > 1:2743341/1‑150 (MQ=255) ccAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGa < 2:1068569/150‑1 (MQ=255) cTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGActct < 1:751402/150‑1 (MQ=255) cAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCCgcgcgc > 1:4966814/1‑150 (MQ=255) cAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACATATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTgcgcgc > 1:2780891/1‑150 (MQ=255) gCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTg < 2:2142059/150‑1 (MQ=255) cgcgACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGACAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGAt > 1:1741711/1‑150 (MQ=255) aCCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGc > 1:873391/1‑150 (MQ=255) aCCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCGGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGc < 2:2534471/150‑1 (MQ=255) aGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGc > 2:1415327/1‑150 (MQ=255) ggTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCt < 1:205349/150‑1 (MQ=255) gTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCTGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCATCCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGGAAGGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtg < 2:4418040/150‑1 (MQ=255) tACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtggttggt < 1:1633114/150‑1 (MQ=255) aCATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTa < 2:3696928/150‑1 (MQ=255) cATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTAc > 1:1141613/1‑150 (MQ=255) aTGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACt > 2:2218627/1‑150 (MQ=255) aTGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACt > 2:3573652/1‑150 (MQ=255) gACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGt < 1:3453889/150‑1 (MQ=255) gACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGt > 2:498614/1‑150 (MQ=255) aCGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTa < 2:1480350/150‑1 (MQ=255) cGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTAt > 1:4519972/1‑150 (MQ=255) cGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTAt > 2:788889/1‑150 (MQ=255) gTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATg < 2:1715220/150‑1 (MQ=255) aTCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGa > 1:4860852/1‑150 (MQ=255) tCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCAGTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGaa > 1:579313/1‑150 (MQ=255) 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ggtATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGt > 2:2383322/1‑150 (MQ=255) gtATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGtt < 1:1537924/150‑1 (MQ=255) gtATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGtt < 2:5154411/150‑1 (MQ=255) gtATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGtt < 2:2293064/150‑1 (MQ=255) aTCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGTTGa > 1:4683771/1‑150 (MQ=255) 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cccTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAGc > 1:4646137/1‑150 (MQ=255) cccTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAGc > 1:993767/1‑150 (MQ=255) | CTCCAACTTGGATGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAGC > CP009273/4173032‑4173325 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |