Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,207,552 | G→T | 100% | M172I (ATG→ATT) | aceA → | isocitrate lyase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,207,552 | 0 | G | T | 98.0% | 1105.2 / 10.1 | 344 | M172I (ATG→ATT) | aceA | isocitrate lyase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/4); new base T (135/202); total (138/206) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.73e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 346 total aligned reads displayed.
GATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATGAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTCTGGCAGCTGA > CP009273/4207405‑4207698 | gATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTaa > 1:3840574/1‑150 (MQ=255) gATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTaa < 1:295976/150‑1 (MQ=255) caacaaCACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGc < 1:4792332/150‑1 (MQ=255) aacaacACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCACTGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCg < 2:1751579/150‑1 (MQ=255) aacaacACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCg < 2:1687716/150‑1 (MQ=255) aacaacACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCg > 2:2160337/1‑150 (MQ=255) aacaacACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCg < 2:3218029/150‑1 (MQ=255) caacaCCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCgat < 2:3699008/150‑1 (MQ=255) acacCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCgatga < 1:3170112/150‑1 (MQ=255) cacCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCgatgat > 1:3517171/1‑150 (MQ=255) cacCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCgatgat > 1:726168/1‑150 (MQ=255) acCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGAtt > 1:3052741/1‑150 (MQ=255) tCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAg < 2:3442499/150‑1 (MQ=255) gtcgtGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCg < 2:906743/150‑1 (MQ=255) tcgtGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCgg > 1:2310949/1‑150 (MQ=255) cgtGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGt < 2:3638165/150‑1 (MQ=255) gtGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTg > 2:298952/1‑150 (MQ=255) gtGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTg < 2:354516/150‑1 (MQ=255) tGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGc < 2:4356721/150‑1 (MQ=255) cGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGc > 2:4442685/1‑150 (MQ=255) gATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCg > 1:2404493/1‑150 (MQ=255) gATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGt > 1:4182781/1‑150 (MQ=255) aTCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGtt < 2:2739937/150‑1 (MQ=255) ccAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCa < 2:1548207/150‑1 (MQ=255) cAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCAc > 2:3586607/1‑150 (MQ=255) cAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCCGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCAc > 2:4127183/1‑150 (MQ=255) ttGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACtt > 2:4800393/2‑150 (MQ=255) ggTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCg > 2:3083134/1‑150 (MQ=255) gTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGa > 2:507085/1‑150 (MQ=255) gTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGa > 2:2413993/1‑150 (MQ=255) ccGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAg < 2:1345073/150‑1 (MQ=255) cgcgGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGa < 2:5898/150‑1 (MQ=255) cgcgGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGa < 1:973115/150‑1 (MQ=255) cgcgGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGa < 2:3114596/150‑1 (MQ=255) cgGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATc > 2:2650384/1‑150 (MQ=255) cgGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATc > 2:317672/1‑150 (MQ=255) cgGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATc > 2:803826/1‑150 (MQ=255) gggCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCa < 2:1552010/150‑1 (MQ=255) gggCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCa < 2:4295004/150‑1 (MQ=255) ggCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAg > 1:965229/1‑150 (MQ=255) cATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCt > 1:1307852/1‑150 (MQ=255) aTTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTg < 1:4977660/150‑1 (MQ=255) gAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATGAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCg > 1:2587752/1‑150 (MQ=255) aGCCGGGCGATCCTCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGTACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGt < 2:448499/150‑1 (MQ=255) aGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGt < 1:4725848/150‑1 (MQ=255) ggCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTg < 2:4690703/150‑1 (MQ=255) gCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTga < 2:2045449/150‑1 (MQ=255) cGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTgaa < 1:3876889/150‑1 (MQ=255) cgcTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGc < 1:771532/150‑1 (MQ=255) cgcTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGc < 2:1849063/150‑1 (MQ=255) tATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGt < 2:3501175/150‑1 (MQ=255) tGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTca > 2:2506290/1‑150 (MQ=255) aTTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATgg < 2:1044712/150‑1 (MQ=255) aTTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATgg < 2:3832419/150‑1 (MQ=255) ttACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATggg < 1:2009221/150‑1 (MQ=255) ttACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATggg < 1:278816/150‑1 (MQ=255) aCTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGggcg < 2:1422269/150‑1 (MQ=255) ttCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGggcggc < 1:2545302/150‑1 (MQ=255) ccTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCaa < 2:2843119/150‑1 (MQ=255) ccGATCGGTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGtt < 2:1193365/150‑1 (MQ=255) gATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGtttt < 2:1635352/150‑1 (MQ=255) aTCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTa < 2:2878400/150‑1 (MQ=255) aTCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTa < 1:1410202/150‑1 (MQ=255) aTCGGTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTa < 1:3469418/150‑1 (MQ=255) gCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCa < 1:1143979/150‑1 (MQ=255) gCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCa < 1:2938859/150‑1 (MQ=255) ccGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCaa > 2:426361/1‑150 (MQ=255) gATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACt < 2:4986824/150‑1 (MQ=255) gATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACt < 2:4991158/150‑1 (MQ=255) aTGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTc < 1:1015639/150‑1 (MQ=255) tGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCa > 2:683409/1‑150 (MQ=255) tGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCa < 1:2498182/150‑1 (MQ=255) cGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAgg > 1:1594519/1‑150 (MQ=255) ggAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGa < 1:1687860/150‑1 (MQ=255) ggAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGa < 2:337527/150‑1 (MQ=255) gAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGaa < 1:2876288/150‑1 (MQ=255) gAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGaa > 1:4500788/1‑150 (MQ=255) ccGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTa < 1:367678/150‑1 (MQ=255) cGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTAt > 1:206300/1‑150 (MQ=255) ggTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTAtt > 1:4342619/1‑150 (MQ=255) ggTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTAtt < 2:1317359/150‑1 (MQ=255) ttttGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCa < 1:4587360/150‑1 (MQ=255) ttttGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCa < 1:1794352/150‑1 (MQ=255) tttGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAg > 1:3393539/1‑150 (MQ=255) tttGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAg > 1:1342942/1‑150 (MQ=255) tGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGaa < 1:4253905/150‑1 (MQ=255) tgtCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGt < 2:4728360/150‑1 (MQ=255) gtCCTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTc < 1:3091959/150‑1 (MQ=255) cTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTcgcg < 2:540191/150‑1 (MQ=255) cTGAATGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTcgcg < 1:2473286/150‑1 (MQ=255) tGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGcgcg < 1:1123240/150‑1 (MQ=255) tGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGcgcg < 1:2212786/150‑1 (MQ=255) tGCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGcgcg < 2:3740365/150‑1 (MQ=255) gCCTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGt > 2:2431214/1‑150 (MQ=255) cTTTGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTCt < 1:3982250/150‑1 (MQ=255) ttGAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGGGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTCTgg < 1:3337439/150‑1 (MQ=255) gAACTGATTAAAGCGATGCTTGAAGCCGGTTCAGCGGCAGTTCACTTCCAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAACGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGTTCGCGGCGAGTCTGGCa > 2:3017484/1‑150 (MQ=255) gAACTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTCTGGCa > 2:1585712/1‑150 (MQ=255) aaCTGATTAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTCTGGCAg < 2:2401875/150‑1 (MQ=255) tgattaAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTCTGGCAGCtg > 1:538422/1‑150 (MQ=255) | GATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGAAGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATGAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAGTTTTAGTGCCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCGCGTCTGGCAGCTGA > CP009273/4207405‑4207698 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |