Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,410,964 | A→C | 100% | I390L (ATC→CTC) | ulaA → | L‑ascorbate‑specific enzyme IIC permease component of PTS |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,410,964 | 0 | A | C | 98.7% | 1156.9 / ‑0.9 | 297 | I390L (ATC→CTC) | ulaA | L‑ascorbate‑specific enzyme IIC permease component of PTS |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (3/1); new base C (170/123); total (173/124) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.43e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 302 total aligned reads displayed.
GTTGGCATCCTGGTCGCCTGCGGCTCCTCGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGATCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCACCGCCGATGATGCAAGGCTTCTTCTCCATCGGTATCGCCTTTATGGCCGTCATCATTGTAATT > CP009273/4410817‑4411110 | ccTGGTCGCCTGCGGCTCCTCGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCtt > 2:3143749/1‑150 (MQ=255) cTGGTCGCCTGCGGCTCCTCGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCttt > 1:2111915/1‑150 (MQ=255) tGGTCGCCTGCGGCTCCTCGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTg > 2:4953515/1‑150 (MQ=255) gTCGCCTGCGGCTCCTCGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGt < 1:2007607/150‑1 (MQ=255) gTCGCCTGCGGCTCCTCGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGATCGAAATCTTTGGt < 1:4483432/150‑1 (MQ=255) cGCCTGCGGCTCCTCGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTg > 1:3453884/1‑150 (MQ=255) tcTGCGGCTCCTCGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCg > 1:4740063/2‑150 (MQ=255) tGCGGCTCCTCGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTc < 1:4953839/150‑1 (MQ=255) tGCGGCTCCTCGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGATCGAAATCTTTGGTTGCGTc > 1:1886314/1‑150 (MQ=255) ggCTCCTCGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTgg < 1:3513545/150‑1 (MQ=255) ctcctcGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGc > 1:2543746/1‑150 (MQ=255) ctcctcGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGc > 1:644230/1‑150 (MQ=255) tcctcGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTTGGCg < 2:214067/150‑1 (MQ=255) tcctcGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCg > 1:212122/1‑150 (MQ=255) tcctcGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCg > 2:1179024/1‑150 (MQ=255) cctcGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCgg > 1:2787008/1‑150 (MQ=255) ctcGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGt > 1:3216349/1‑150 (MQ=255) ctcGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGt < 1:4414047/150‑1 (MQ=255) tGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCa > 1:3141485/1‑150 (MQ=255) gATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCAc > 1:2376141/1‑150 (MQ=255) attattCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCAcc < 2:4342675/150‑1 (MQ=255) tattCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCgg > 1:3790028/1‑150 (MQ=255) tattCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCgg < 1:23187/150‑1 (MQ=255) ttCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTa < 1:2388820/150‑1 (MQ=255) ttCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTa < 2:2486277/150‑1 (MQ=255) ccTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGAGTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATg > 2:2815685/1‑150 (MQ=255) cTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGc > 2:889501/1‑150 (MQ=255) tttATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGcc > 1:5151392/1‑150 (MQ=255) tttATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGcc > 2:180370/1‑150 (MQ=255) ttATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCt > 1:112495/1‑150 (MQ=255) tATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTg > 2:1204715/1‑150 (MQ=255) tATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTg < 2:3109196/150‑1 (MQ=255) cgcccGATGTTCTTCTCTCACGCCACCATCGGCGGGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTgg < 2:2743516/148‑1 (MQ=255) ccGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATg < 2:2983258/150‑1 (MQ=255) cGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATgg > 2:580833/1‑150 (MQ=255) gaagTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGCAATCTATGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACACACCGGTATGAGTGCCTGGATggg > 2:162893/4‑150 (MQ=255) gATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATggg < 2:4867636/150‑1 (MQ=255) gATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATggg > 2:801010/1‑150 (MQ=255) tGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCa < 2:473931/150‑1 (MQ=255) tGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCa < 2:4112635/150‑1 (MQ=255) gTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCAt > 1:98073/1‑150 (MQ=255) ttcttcTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCTGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATg < 1:2212230/150‑1 (MQ=255) ttcttcTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATg < 1:5002588/150‑1 (MQ=255) ttcttcTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACCTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCCCCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATg > 1:2736249/1‑150 (MQ=255) ctctAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGa > 2:1920095/1‑150 (MQ=255) ctAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACt > 2:505870/1‑150 (MQ=255) ctAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACt > 2:3842102/1‑150 (MQ=255) cgaaCGCCCCCCTCGGCGTGTTCGCGAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGACACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACt < 2:4969568/148‑1 (MQ=255) aCGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGt > 1:3978818/1‑150 (MQ=255) aTCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTg < 2:2932131/150‑1 (MQ=255) tCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTgg < 2:2655518/150‑1 (MQ=255) ggCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCa < 2:1338711/150‑1 (MQ=255) gCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCAc < 2:502239/150‑1 (MQ=255) cGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGTAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAAACTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCAcc < 2:4169964/150‑1 (MQ=255) gtTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGCTTCTGGCAccgcc > 2:4761909/1‑150 (MQ=255) gtTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCAccgcc < 2:3750663/150‑1 (MQ=255) gtTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCAccgcc < 1:3850311/150‑1 (MQ=255) gcgaaCCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCGGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAACCTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCACCGCCgatg < 2:4631166/147‑1 (MQ=255) 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ctaCTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCACCGCCGATGATGCa > 1:1761731/3‑150 (MQ=255) ccACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCACCGCCGATGATGCa > 2:232568/1‑150 (MQ=255) aCTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCACCGCCGATGATGCaaa < 1:194970/150‑2 (MQ=255) cTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCACCGCCGATGATGCAAgg > 1:3482390/1‑150 (MQ=255) ttCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCACCGCCGATGATGCAAGGc > 1:1649410/1‑150 (MQ=255) 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ggCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCACCGCCGATGATGCAAGGCTTCTTCTCCa < 2:150463/150‑1 (MQ=255) gTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCACCGCCGATGATGCAAGGCTTCTTCTCCATCg < 2:2428483/150‑1 (MQ=255) gTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCACCGCCGATGATGCAAGGCTTCTTCTCCATCg < 1:2923598/150‑1 (MQ=255) tGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCACCGCCGATGATGCAAGGCTTCTTCTCCATCgg < 2:4467333/150‑1 (MQ=255) gcggcgCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCACCGCCGATGATGCAAGGCTTCTTCTCCATCGGt < 1:1059278/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |