| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,458,254 | T→A | 100% | V271V (GTT→GTA) | mgtA → | magnesium transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,458,254 | 0 | T | A | 100.0% | 1042.2 / ‑6.7 | 318 | V271V (GTT→GTA) | mgtA | magnesium transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); major base A (166/150); minor base C (1/0); total (167/151) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 318 total aligned reads displayed.
CGCTACCACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTTAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTGGGAAGCGGCGCTGTT > CP009273/4458107‑4458400 | gCTACCACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGt < 1:555276/150‑1 (MQ=255) tACCACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGa > 2:1297850/1‑150 (MQ=255) tcACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGc > 2:3811896/2‑150 (MQ=255) aCTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAg < 1:2373303/150‑1 (MQ=255) tCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGa < 1:210638/150‑1 (MQ=255) cGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGaa < 2:4164661/150‑1 (MQ=255) cAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGc > 2:3962462/1‑150 (MQ=255) ccGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAg > 1:324026/1‑150 (MQ=255) ccGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAg < 2:4880378/150‑1 (MQ=255) gAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCg < 2:313129/150‑1 (MQ=255) aGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGa < 2:3392616/150‑1 (MQ=255) aGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGa > 1:4383699/1‑150 (MQ=255) aGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGa < 2:1187862/150‑1 (MQ=255) gCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGaa > 2:5160545/1‑150 (MQ=255) cacaGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAAt > 2:4786151/1‑150 (MQ=255) gcaGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCACCTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATg > 1:259028/2‑150 (MQ=255) aGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGcc > 1:2723233/1‑150 (MQ=255) cAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCtt < 2:1633355/150‑1 (MQ=255) aaTCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCttt > 2:3870845/1‑150 (MQ=255) aaTCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCttt > 1:1366384/1‑150 (MQ=255) tCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTATAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCa < 2:2171248/150‑1 (MQ=255) tGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAg < 1:2011889/150‑1 (MQ=255) tGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAg > 1:4859253/1‑150 (MQ=255) tgACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAg > 2:2814400/2‑150 (MQ=255) cGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAg < 1:2837826/150‑1 (MQ=255) gACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGc > 1:2829090/1‑150 (MQ=255) acGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCcgc < 2:4522868/150‑1 (MQ=255) gCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGt > 2:3680016/1‑150 (MQ=255) gCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGt < 2:565849/150‑1 (MQ=255) cTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTc > 2:1926211/1‑150 (MQ=255) tgtTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAga < 1:3560050/150‑2 (MQ=255) gtTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTa < 2:777693/150‑1 (MQ=255) tATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACGGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTAtgct < 2:1801753/150‑1 (MQ=255) aTGGGCACCTCCGTGGTGAGCGGCTCGGCACAAGCTATGGTGTTTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTTAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCTAGGGATCAGCCGCGTCAGTAtgctg < 1:2454303/150‑1 (MQ=255) tGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTAtgctgc > 2:4496328/1‑150 (MQ=255) tGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTAtgctgc < 1:4678084/150‑1 (MQ=255) tGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTAtgctgc > 2:4447966/1‑150 (MQ=255) gggCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATgctgct < 2:1004080/150‑1 (MQ=255) gggCACCACAGTGGTGAGAGGCACGTCACAAGCTCTGGTGATTGCTACATGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCATTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATgctgct < 1:3830531/150‑1 (MQ=255) gaaccaccGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCAGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAAAGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGa > 2:4405894/3‑150 (MQ=255) caccacCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGAt < 1:3751350/150‑1 (MQ=255) ccaccGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTc < 1:1007518/150‑1 (MQ=255) ccaccGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTc < 1:5118285/150‑1 (MQ=255) ccaccGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTc > 1:1546499/1‑150 (MQ=255) ccaccGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGAGTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTc < 2:332067/150‑1 (MQ=255) accGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGc > 1:3888561/1‑150 (MQ=255) ccGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCt < 1:4195187/150‑1 (MQ=255) gtggtgAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCttt > 1:841254/1‑150 (MQ=255) tggtggGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTa > 1:3391714/1‑150 (MQ=255) tggtgAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTa > 2:2463661/1‑150 (MQ=255) tggtgAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTa < 2:2550463/150‑1 (MQ=255) tgAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGc > 2:4279305/1‑150 (MQ=255) tgAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGc < 2:4152591/150‑1 (MQ=255) gAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCt > 2:2942121/1‑150 (MQ=255) aGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTg < 2:3463948/150‑1 (MQ=255) ggcacggcacAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTg > 1:1315024/1‑150 (MQ=255) gcacggcacAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGa < 1:1272477/150‑1 (MQ=255) acggcacAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATg > 2:1731847/1‑150 (MQ=255) gcacAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCa < 2:817766/150‑1 (MQ=255) cacaAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCAc > 1:5134794/1‑150 (MQ=255) aaGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCgg < 1:4002938/150‑1 (MQ=255) cAATGGTGATTGCTACATGTTCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCTGGGCGTTTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGACTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGAATGCTTCTGATTAGCTTTAGGCTGGTGATGGCACCtgtgg > 1:3094372/1‑150 (MQ=255) cAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCggtgg > 1:5045102/1‑150 (MQ=255) aaTGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCggtggt < 1:4315858/150‑1 (MQ=255) tGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGTCACCGGTGGTGc > 1:410138/1‑150 (MQ=255) tGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGc < 1:2512571/150‑1 (MQ=255) gTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTg < 2:4005218/150‑1 (MQ=255) gTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTg < 1:1872173/150‑1 (MQ=255) gTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTg < 2:463775/150‑1 (MQ=255) gTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACGGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTg > 1:286531/1‑150 (MQ=255) tGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAAt < 2:3061271/150‑1 (MQ=255) gCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATc > 1:730137/1‑150 (MQ=255) cTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCa < 1:2666513/150‑1 (MQ=255) cAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATg > 1:3326231/1‑150 (MQ=255) aGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATgg > 2:1108625/1‑150 (MQ=255) tGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTa > 1:2620449/1‑150 (MQ=255) tGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTa < 2:3925445/150‑1 (MQ=255) tGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTa > 1:1172935/1‑150 (MQ=255) cAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTacac > 2:361183/1‑150 (MQ=255) aaTACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACAcc > 2:4661477/1‑150 (MQ=255) tACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCaa > 1:1034885/1‑150 (MQ=255) tACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCaa > 1:776386/1‑150 (MQ=255) ccaggTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCAGAATGCCTTTAAGCAATGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGATGTTAATCAATGGTTACACCaaat > 1:530154/4‑149 (MQ=255) ccTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAg > 2:5019409/1‑150 (MQ=255) tGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGc < 2:615209/150‑1 (MQ=255) tgTTTGTTCAACTGGAGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGTATCAGCCGCGTCAGTATTCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGTCg < 2:2260916/149‑1 (MQ=255) tttGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGAc < 1:4045591/150‑1 (MQ=255) ttGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACt < 1:4534294/150‑1 (MQ=255) gTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACtggt < 2:862501/150‑1 (MQ=255) gTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACtggt > 1:1938830/1‑150 (MQ=255) gTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACtggt < 1:2726632/150‑1 (MQ=255) cAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACtggtgg > 2:404481/1‑150 (MQ=255) aaCTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTggg < 1:893501/150‑1 (MQ=255) aCTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTGGGa < 2:4962525/150‑1 (MQ=255) gCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTGGGAAgcg < 2:23581/150‑1 (MQ=255) gCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTGGGAAgcg < 1:1702049/150‑1 (MQ=255) cGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTGGGAAgcgg > 2:2770047/1‑150 (MQ=255) cGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTGGGAAGCGGCGCTg > 2:2026893/1‑150 (MQ=255) tgtAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTGGGAAGCGGCGCTGtt < 2:1546499/150‑1 (MQ=255) tgtAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTGGGAAGCGGCGCTGtt > 2:649337/1‑150 (MQ=255) | CGCTACCACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTTAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTGGGAAGCGGCGCTGTT > CP009273/4458107‑4458400 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |