Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 546,491 | G→T | 100% | V199V (GTG→GTT) | ybcF → | putative carbonate kinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 546,491 | 0 | G | T | 99.3% | 926.9 / ‑4.1 | 288 | V199V (GTG→GTT) | ybcF | putative carbonate kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/0); new base T (145/139); total (148/140) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.48e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 297 total aligned reads displayed.
TTTGCGCCGGGTGGTGGCGTCTCCGCAACCGCGTAAAATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTGATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAGCAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGC > CP009273/546344‑546637 | tttGCGCCGGGTGGTGGCGTCTCCGCAACCGCGTAAAATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGttat > 2:316278/1‑150 (MQ=255) ttGCGCCGGGTGGTGGCGTCTCCGCAACCGCGTAAAATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGttatt < 2:2671983/150‑1 (MQ=255) tGCGCCGGGTGGTGGCGTCTCCGCAACCGCGTAAAATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGTGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGttattg > 2:33384/1‑150 (MQ=255) tGCGCCGGGTGGTGGCGTCTCCGCAACCGCGTAAAATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGttattg > 1:592573/1‑150 (MQ=255) gcCGGGTGGTGGCGTCTCCGCAACCGCGTAAAATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATa < 1:2347983/150‑1 (MQ=255) gcCGGGTGGTGGCGTCTCCGCAACCGCGTAAAATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATa < 2:2967848/150‑1 (MQ=255) cGGGTGGTGGCGTCTCCGCAACCGCGTAAAATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATaaa > 1:1723017/1‑150 (MQ=255) gggTGGTGGCGTCTCCGCAACCGCGTAAAATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAg < 1:1036878/150‑1 (MQ=255) tggCGTCTCCGCAACCGCGTAAAATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTcg > 1:4356212/1‑150 (MQ=255) cGTCTCCGCAACCGCGTAAAATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTcgccg < 2:2777574/150‑1 (MQ=255) cGTCTCCGCAACCGCGTAAAATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTcgccg > 1:449213/1‑150 (MQ=255) tctcCGCAACCGCGTAAAATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCt < 1:1346786/150‑1 (MQ=255) tctcCGCAACCGCGTAAAATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCt < 2:1111035/150‑1 (MQ=255) ctcCGCAACCGCGTAAAATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTg > 2:5161464/1‑150 (MQ=255) ctcCGCAACCGCGTAAAATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTg > 1:2645334/1‑150 (MQ=255) ctcCGCAACCGCGTAAAATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTg > 1:526042/1‑150 (MQ=255) tcCGCAACCGCGTAAAATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGc > 2:4662887/1‑150 (MQ=255) tcCGCAACCGCGTAAAATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGc > 1:417280/1‑150 (MQ=255) ccGCAACCGCGTAAAATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCg < 1:1906096/150‑1 (MQ=255) gCAACCGCGTAAAATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGtt > 2:4989887/1‑150 (MQ=255) cAACCGCGTAAAATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTg > 1:2581163/1‑150 (MQ=255) aCCGCGTAAAATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCt < 1:4866327/150‑1 (MQ=255) aCCGCGTAAAATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCt < 1:4803658/150‑1 (MQ=255) ccGCGTAAAATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTc < 1:901403/150‑1 (MQ=255) tAAAATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGa < 1:5051661/150‑1 (MQ=255) tAAAATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGa < 1:4787330/150‑1 (MQ=255) aaaTTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGc > 2:1671828/1‑150 (MQ=255) aaTTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCa < 2:1799769/150‑1 (MQ=255) agtctcGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAg < 2:1566105/148‑1 (MQ=255) aTTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGAGAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAg < 1:335727/150‑1 (MQ=255) ctcGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGAtt > 1:1025702/1‑150 (MQ=255) tcGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTa > 1:430100/1‑150 (MQ=255) tcGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTa > 1:2929695/1‑150 (MQ=255) gACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAAt > 2:4167149/1‑150 (MQ=255) aCAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATg < 2:1367019/150‑1 (MQ=255) aCAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATg > 2:2853095/1‑150 (MQ=255) aGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCa > 2:614317/1‑150 (MQ=255) gAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGAt < 1:3464548/150‑1 (MQ=255) 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aTCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTg > 2:2566897/1‑150 (MQ=255) aTCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTg < 2:1471582/150‑1 (MQ=255) tCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTgg > 2:2411675/1‑150 (MQ=255) tCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTgg < 2:4600826/150‑1 (MQ=255) gAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGta < 2:4111723/150‑2 (MQ=255) gAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTg < 1:4764823/150‑1 (MQ=255) aGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGa < 2:3702633/150‑1 (MQ=255) ttgCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTc < 1:1286699/150‑1 (MQ=255) ttgCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTc < 2:4961429/150‑1 (MQ=255) gCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCAc < 2:3448620/150‑1 (MQ=255) 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tgggCATGTGGAGATGTGCAGTGGCGTCGGCGGTGTGCCTGAGACGGATGACGCAGCAGGGAGCGAAGCACCCATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCCTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGTCTGGTGATCCTCACCGATGCTGa < 2:5073781/149‑1 (MQ=255) ggggCATGTGGTGATTTGGAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGTCGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGa < 1:4178768/150‑1 (MQ=255) gggCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGAt > 2:674321/1‑150 (MQ=255) ggCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATg < 1:1097362/150‑1 (MQ=255) gCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGc < 2:75942/150‑1 (MQ=255) gCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGc > 2:1902381/1‑150 (MQ=255) gCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGc > 1:4422305/1‑150 (MQ=255) cATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCg > 2:2365531/1‑150 (MQ=255) tgtgGTGATTTGCAGGGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGt < 2:3960762/150‑1 (MQ=255) tggtgATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGtat < 2:3850921/150‑1 (MQ=255) 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cAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTg < 1:2146305/150‑1 (MQ=255) ggcggcggcGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGa < 1:4507283/150‑1 (MQ=255) ggcggcggTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAAcg < 1:2390308/150‑1 (MQ=255) gcggcggTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAAcgc > 2:4644826/1‑150 (MQ=255) ggTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCgcag < 2:3638141/150‑1 (MQ=255) tgCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAGCAAc < 2:1885748/150‑1 (MQ=255) gCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAGCAACg > 1:3434149/1‑150 (MQ=255) ggatgacggaGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAGCAACGTGCCATTCg < 1:3879299/150‑1 (MQ=255) atgacggaGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAGCAACGTGCCATTCGcc < 2:2223348/150‑1 (MQ=255) gacggaGCAGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAGCAACGTGCCATTCGCCAt > 1:2449946/1‑150 (MQ=255) 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aGGGAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAGCAACGTGCCATTCGCCATGCCACAcc < 2:4344385/150‑1 (MQ=255) ggAGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAGCAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCgg > 1:380330/1‑150 (MQ=255) aGTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAGCAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGAt > 1:5161121/1‑150 (MQ=255) gTGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAGCAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATg > 1:1781321/1‑150 (MQ=255) tGAAGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAGCAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGa > 1:3646591/1‑150 (MQ=255) aGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAGCAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGtt < 1:4664502/150‑1 (MQ=255) aGCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAGCAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGtt < 2:668755/150‑1 (MQ=255) gCAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAGCAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTa < 2:207475/150‑1 (MQ=255) cAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAGCAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAg < 1:970673/150‑1 (MQ=255) cAGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAGCAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAg < 1:4002799/150‑1 (MQ=255) aGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAGCAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAgc > 1:1501089/1‑150 (MQ=255) aGTTATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAGCAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAgc > 1:2066778/1‑150 (MQ=255) | TTTGCGCCGGGTGGTGGCGTCTCCGCAACCGCGTAAAATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTGATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAGCAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGC > CP009273/546344‑546637 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |