Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 619,048 | C→A | 100% | A307S (GCC→TCC) | fepB ← | iron‑enterobactin transporter subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 619,048 | 0 | C | A | 98.2% | 1099.2 / 6.4 | 341 | A307S (GCC→TCC) | fepB | iron‑enterobactin transporter subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/3); new base A (154/180); total (158/183) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.08e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 342 total aligned reads displayed.
GAGCGGTTTTGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGCGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGAACAGGAATAGTGACTCGCCAT > CP009273/618901‑619194 | ggTTTTGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTgta > 1:97368/1‑150 (MQ=255) ggTTTTGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTgta < 1:2982726/150‑1 (MQ=255) gTTTTGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTgtag > 1:5113031/1‑150 (MQ=255) ttttGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCAAGGAGCTgtagt > 2:1833844/1‑150 (MQ=255) tttGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTgtagta < 2:1863775/150‑1 (MQ=255) ttGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTaa > 1:1566603/1‑150 (MQ=255) ggTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATc > 1:1946706/1‑150 (MQ=255) tttGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCa < 2:831840/150‑1 (MQ=255) tgttgATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGa > 1:1485793/1‑150 (MQ=255) ttgATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACg > 1:4541169/1‑150 (MQ=255) ttgATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACg > 2:1633595/1‑150 (MQ=255) ttgATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACg < 2:546197/150‑1 (MQ=255) tgATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACgg > 1:750983/1‑150 (MQ=255) aTTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGaa < 2:2114130/150‑1 (MQ=255) ttATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAAc > 1:2383749/1‑150 (MQ=255) tATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACg > 1:4994869/1‑150 (MQ=255) tCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGtc > 1:318439/1‑150 (MQ=255) cGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGtct > 1:1626972/1‑150 (MQ=255) ggCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGtctc < 2:1418609/150‑1 (MQ=255) gCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCg < 2:184806/150‑1 (MQ=255) cGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCgg > 2:1108903/1‑150 (MQ=255) gttgttATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTc > 2:2311794/1‑150 (MQ=255) gttgttATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTc > 2:4294406/1‑150 (MQ=255) ttgttATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTcc < 1:105565/150‑1 (MQ=255) tgttATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTccc > 2:373466/1‑150 (MQ=255) ttATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAg < 2:2371390/150‑1 (MQ=255) tagtgctggtgctggTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAgc < 2:3608865/147‑1 (MQ=255) agtgctggagctggTGGAGTTGCGTCATTTTCGCCAGACGCCGCCTCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTACGCCTATCCAGCACTGGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGCCGGAACGTCTCGGTTCCCAgcg < 2:4823418/148‑1 (MQ=255) tgctggtgctggTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCa < 1:2897668/150‑1 (MQ=255) gctggtgctggtGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCAt < 1:2495727/150‑1 (MQ=255) tggtgctggtgGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATaa < 2:5057488/150‑1 (MQ=255) ctggtgGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTg > 1:3861580/1‑150 (MQ=255) gtggAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCtt > 2:4724986/1‑150 (MQ=255) gtggAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCtt < 2:2651806/150‑1 (MQ=255) tggAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTg > 1:4798270/1‑150 (MQ=255) gAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGtt > 2:3656456/1‑150 (MQ=255) ttGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTg > 2:3453010/1‑150 (MQ=255) tGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGt > 1:138728/1‑150 (MQ=255) 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cAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTg < 1:536458/150‑1 (MQ=255) aGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTgc < 2:4394438/150‑1 (MQ=255) gccgccgcAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGa < 2:1544675/150‑1 (MQ=255) cgcAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGagcagc > 2:2915231/1‑150 (MQ=255) gcAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCg < 1:1303433/150‑1 (MQ=255) ggTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGAt < 1:4373762/150‑1 (MQ=255) tGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTa < 2:3148883/150‑1 (MQ=255) tGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTa < 2:413052/150‑1 (MQ=255) cAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCa < 1:3932434/150‑1 (MQ=255) cAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCa < 2:3859138/150‑1 (MQ=255) gTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCATGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATaaa < 2:2634392/150‑1 (MQ=255) gTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATaaa > 1:3436353/1‑150 (MQ=255) ccGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATa < 2:4775721/150‑1 (MQ=255) cGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAg < 2:887362/150‑1 (MQ=255) cGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAg < 2:397425/150‑1 (MQ=255) 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ttAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCttt < 2:2080269/150‑1 (MQ=255) ttAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCttt < 2:1535104/150‑1 (MQ=255) ttAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCttt < 1:2120514/150‑1 (MQ=255) aaaaCAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCt > 1:944149/1‑150 (MQ=255) aaaaCAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCt > 2:2811015/1‑150 (MQ=255) aaCAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGCGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGa > 2:3225831/1‑150 (MQ=255) aaCAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGa < 1:855852/150‑1 (MQ=255) aGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCa > 2:3020727/1‑150 (MQ=255) cgcCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGCGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCAcc < 2:1946313/150‑1 (MQ=255) gcCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCTGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCTCCg < 1:2608977/150‑1 (MQ=255) cTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATCGCAGCGGCATCTTTCTGATCACCGGc > 2:2850847/1‑150 (MQ=255) tAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGa < 2:4014600/150‑1 (MQ=255) gCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGAACa < 1:202054/150‑1 (MQ=255) gCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGAACa < 1:3038295/150‑1 (MQ=255) cTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGAACAgg < 1:592928/150‑1 (MQ=255) cTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGAACAgg > 2:1194225/1‑150 (MQ=255) tATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGAACAGGa > 1:1801394/1‑150 (MQ=255) aTCCAGCACTTGCATGGCGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGACCAGGaa > 1:4724581/1‑150 (MQ=255) aTCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGAACAGGaa < 2:626758/150‑1 (MQ=255) ccAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGAACAGGAATa < 2:3540866/150‑1 (MQ=255) 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cATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGAACAGGAATAGTGACTCGcc > 2:3881423/1‑150 (MQ=255) tGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGAACAGGAATAGTGACTCGCCAt > 1:620808/1‑150 (MQ=255) | GAGCGGTTTTGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGCGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGAACAGGAATAGTGACTCGCCAT > CP009273/618901‑619194 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |