| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 658,096 | C→A | 100% | M1M (ATG→ATT) † | ybeD ← | UPF0250 family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 658,096 | 0 | C | A | 97.5% | 859.8 / 9.9 | 276 | M1M (ATG→ATT) † | ybeD | UPF0250 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/5); new base A (120/149); total (122/154) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.69e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.63e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 276 total aligned reads displayed.
GCTTGGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAATTTAATGT > CP009273/657949‑658242 | gctTGGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAAt < 1:1565234/150‑1 (MQ=255) ctTGGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATg > 1:3138485/1‑150 (MQ=255) ctTGGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATg > 2:1760972/1‑150 (MQ=255) ggTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCa < 1:2119831/150‑1 (MQ=255) gTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTAACACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTTCCCCATAACTTTGTAAGTTAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTTGTTTTAATGTCat < 2:2095043/150‑2 (MQ=255) ttttACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCACCCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGc < 1:133414/150‑1 (MQ=255) ttttACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGc < 2:5091205/150‑1 (MQ=255) ttACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGGTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTc > 2:2578407/1‑150 (MQ=255) tACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTcc > 1:1947116/1‑150 (MQ=255) aCCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCg < 1:158846/150‑1 (MQ=255) aCCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCg < 2:4499215/150‑1 (MQ=255) gTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGcg > 1:1477546/1‑150 (MQ=255) gTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTGTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGcg > 2:4329289/1‑150 (MQ=255) ttGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGcgt > 1:4792681/1‑150 (MQ=255) ggggTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGcgtaa < 2:4683441/150‑1 (MQ=255) ggTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGcgtaacg > 1:1712838/1‑150 (MQ=255) tgtAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGcgtaacgta < 2:3360183/150‑1 (MQ=255) tgtAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGcgtaacgta < 2:3429956/150‑1 (MQ=255) tgtAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGcgtaacgta > 1:43024/1‑150 (MQ=255) gTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTa < 1:570177/150‑1 (MQ=255) gTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTa > 1:3328314/1‑150 (MQ=255) cACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTaaa > 1:63699/1‑150 (MQ=255) cACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTaaa > 2:2346406/1‑150 (MQ=255) tGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGc > 1:2835676/1‑150 (MQ=255) ggCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCa > 1:4711826/1‑150 (MQ=255) gcgcATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCaa < 2:2236604/150‑1 (MQ=255) cgcATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTAGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAAc > 1:160388/1‑150 (MQ=255) gcATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACt > 2:3786455/1‑150 (MQ=255) tGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTccc < 2:681637/150‑1 (MQ=255) tGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTccc < 2:395934/150‑1 (MQ=255) gcTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCa < 1:1424802/150‑1 (MQ=255) cTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAg < 2:1444038/150‑1 (MQ=255) aCCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAgg < 1:4043435/150‑1 (MQ=255) cACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCg > 2:2092505/1‑150 (MQ=255) aCTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAG‑AGGCggg < 2:4301664/150‑1 (MQ=255) ttCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGa > 1:3431936/1‑150 (MQ=255) cAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGt > 1:4439360/1‑150 (MQ=255) accaccTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGttt > 2:670504/1‑150 (MQ=255) ccaccTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCCAGCTGTTCGTTATGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTATTTAAATAGCATCTCCCGCCAGAAGGCGGGAGtttt < 1:2222245/150‑1 (MQ=255) ccaccTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGtttt > 2:1276970/1‑150 (MQ=255) cTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTAc > 1:3842197/1‑150 (MQ=255) tGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACt > 2:1638129/1‑150 (MQ=255) aTCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGa < 1:855898/150‑1 (MQ=255) aaCCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGc > 2:2837998/1‑150 (MQ=255) aaCCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGc > 1:4208649/1‑150 (MQ=255) aCCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAACGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCt < 1:1460597/150‑1 (MQ=255) gCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGt < 2:1845205/150‑1 (MQ=255) gCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGt < 2:4592838/150‑1 (MQ=255) cAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGtata > 1:1772563/1‑150 (MQ=255) gTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATgg > 1:4483763/1‑150 (MQ=255) gTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAAGTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATgg < 2:3281657/150‑1 (MQ=255) cGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGAc > 1:4955313/1‑150 (MQ=255) cGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGAc < 1:3567383/150‑1 (MQ=255) gCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACg > 2:5023984/1‑150 (MQ=255) cTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGa > 1:4903936/1‑150 (MQ=255) cTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGa < 1:46052/150‑1 (MQ=255) cTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGa > 1:4213810/1‑150 (MQ=255) cTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGa > 1:1658901/1‑150 (MQ=255) tGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGaa > 2:733230/1‑150 (MQ=255) cccATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAAtt < 1:3770511/150‑1 (MQ=255) cccATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAAtt > 2:2507150/1‑150 (MQ=255) cccATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAAtt > 2:893925/1‑150 (MQ=255) cATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTac < 1:2658739/150‑1 (MQ=255) aTAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTaca < 1:1018248/150‑1 (MQ=255) aaCTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACt < 2:1580074/150‑1 (MQ=255) aaCTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACt < 1:2359315/150‑1 (MQ=255) aCTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACtt > 1:783885/1‑150 (MQ=255) ttGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCa > 1:2421216/1‑150 (MQ=255) gtaagtaaAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAg < 1:2609367/150‑1 (MQ=255) gtaagtaaAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAg < 1:2979393/150‑1 (MQ=255) taagtaaAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAgt < 1:2035545/150‑1 (MQ=255) gtaaAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGtt < 1:1003707/150‑1 (MQ=255) taaAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGttt < 1:4403569/150‑1 (MQ=255) acaGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGATTTACTGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTaa < 2:3108118/148‑1 (MQ=255) aaGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAAt > 1:3608040/1‑150 (MQ=255) aGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAAtt < 2:1712838/150‑1 (MQ=255) ggAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAAttt < 2:4908553/150‑1 (MQ=255) gTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTa < 1:525587/150‑1 (MQ=255) gAATTCAATCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCTTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCTGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTACAAGTGTTTAATTTTTaaccaa < 2:2944252/150‑1 (MQ=255) aaTTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTaaccaaa > 1:420707/1‑150 (MQ=255) tCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTaaccaaacca < 2:4163863/150‑1 (MQ=255) aaGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGt < 1:3408951/150‑1 (MQ=255) aaGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGt < 1:716481/150‑1 (MQ=255) aaGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGt < 2:1138703/150‑1 (MQ=255) aaGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGt < 2:1417857/150‑1 (MQ=255) aGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTg < 1:2543178/150‑1 (MQ=255) aGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTg < 2:575790/150‑1 (MQ=255) cAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGAt > 1:2506474/1‑150 (MQ=255) cAGTTCGTTAAGATAGGTTGTAATGACAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGACGGCGGGAGTTTTTAACTGATGCGACGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGAGTTTAAATTTTAACCAAACCAGTGAt > 2:3408052/1‑150 (MQ=255) gTTCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATgg > 2:1241427/1‑150 (MQ=255) ttCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCATCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCACGCCAGAAGGCGGGAGTTATTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTACAAGAGTTTAATTTTTAACAAAACCAGTGATTGa > 1:2291814/1‑150 (MQ=255) ttCGTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTATCAAGTGTTTAATTTTTAAACAAACCAGTGATGGa > 2:4773714/1‑150 (MQ=255) gTTAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACa > 2:786313/1‑150 (MQ=255) tAAGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACAtt > 2:3492589/1‑150 (MQ=255) aaGTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACAtta < 2:1583812/150‑1 (MQ=255) gtgtGGTTTGAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGCAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACAttaat < 2:4698525/147‑1 (MQ=255) gTTTGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACAttaat < 2:4210866/150‑1 (MQ=255) tttGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACAttaatt < 1:1103145/150‑1 (MQ=255) tGGTTTTAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACAttaattta < 2:63705/150‑1 (MQ=255) tttAATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGCAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAATTTAATGt > 2:3665130/1‑150 (MQ=255) | GCTTGGTTTTACCGTTGGGGTGTAGTCACCTGGCGCATGGCGCTGTACCACTTCAACCACCTGATCAACCAGCTCAGGTAACGCCTGCCCCATAACTTTGTAAGTAAAAGGAGTAGGGAATTCAAGCAGTTCGTTAAGTTTGGTTTTCATGTCAGCTCCGGCGTAACGTAATTAAATAGCAACTCCCGCCAGAAGGCGGGAGTTTTTTACTGATGCTTAGTATATGGGGACGGAAATTACACTTTCAAGTGTTTAATTTTTAACCAAACCAGTGATGGAACATTAATTTAATGT > CP009273/657949‑658242 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |