Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 838,652 | T→G | 18.1% | F289V (TTT→GTT) | rlmF → | 23S rRNA m(6)A1618 methyltransferase, SAM‑dependent |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 838,652 | 0 | T | G | 18.1% | 437.8 / 35.9 | 244 | F289V (TTT→GTT) | rlmF | 23S rRNA m(6)A1618 methyltransferase, SAM‑dependent |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (81/114); new base G (47/2); total (128/116) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.18e-13 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |