Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 134,028 | G→T | 100% | A153A (GCG→GCT) | cueO → | multicopper oxidase (laccase) |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 134,028 | 0 | G | T | 97.3% | 836.1 / 8.6 | 280 | A153A (GCG→GCT) | cueO | multicopper oxidase (laccase) |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (4/4); new base T (140/132); total (144/136) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 280 total aligned reads displayed.
GCTGGAAGTACCGGGTGAAGTCGACGGCGGCCCGCAGGGAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCGATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGA > CP009273/133881‑134171 | tGGAAGTACCGGGTGAAGTCGACGGCGGCCCGCAGGGAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATgg < 2:2985451/150‑1 (MQ=255) aGTACCGGGTGAAGTCGACGGCGGCCCGCAGGGAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGggct < 1:1571925/150‑1 (MQ=255) tACCGGGTGAAGTCGACGGCGGCCCGCAGGGAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGggctgg > 1:3054242/1‑150 (MQ=255) aCCGGGTGAAGTCGACGGCGGCCCGCAGGGAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGggctggc < 1:5009956/150‑1 (MQ=255) aCCGGGTGAAGTCGACGGCGGCCCGCAGGGAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGggctggc < 2:4198584/150‑1 (MQ=255) aCCGGGTGAAGTCGACGGCGGCCCGCAGGGAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGggctggc > 2:1498873/1‑150 (MQ=255) ccGGGTGAAGTCGACGGCGGCCCGCAGGGAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGggctggct < 1:2732331/150‑1 (MQ=255) ccGGGTGAAGTCGACGGCGGCCCGCAGGGAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGggctggct > 1:703922/1‑150 (MQ=255) gggTGAAGTCGACGGCGGCCCGCAGGGAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGctggctgg > 2:2585933/1‑150 (MQ=255) ggTGAAGTCGACGGCGGCCCGCAGGGAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTggctggg > 2:3708806/1‑150 (MQ=255) gTGAAGTCGACGGCGGCCCGCAGGGAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTggctgggc < 2:4420886/150‑1 (MQ=255) cGACGGCGGCCCGCAGGGAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTggtggt > 1:4201143/1‑150 (MQ=255) gACGGCGGCCCGCAGGGAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGgtggtg < 1:2267178/150‑1 (MQ=255) ggcggcCCGCAGGGAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGAtt < 1:2611134/150‑1 (MQ=255) gcggcCCGCAGGGAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTg > 1:1862530/1‑150 (MQ=255) ggcCCGCAGGGAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGaa < 2:2459690/150‑1 (MQ=255) ggcCCGCAGGGAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGaa < 2:4024187/150‑1 (MQ=255) gcCCGCAGGGAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAg < 2:2362946/150‑1 (MQ=255) cccGCAGGGAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGa > 2:1995756/1‑150 (MQ=255) cccGCAGGGAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGa > 2:3564988/1‑150 (MQ=255) gAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACgaga < 2:4346565/150‑1 (MQ=255) aaTTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGAt < 2:5001766/150‑1 (MQ=255) attattCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATc > 2:2701856/1‑150 (MQ=255) attattCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATc > 2:100820/1‑150 (MQ=255) tattCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCt < 1:4458571/150‑1 (MQ=255) tattCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCGATGGGGCTGGCTGGGCGGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCt > 1:449063/1‑150 (MQ=255) tattCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACAGGGAGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCt > 1:4069642/1‑150 (MQ=255) attCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTg > 1:511341/1‑150 (MQ=255) ttCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGa > 1:616689/1‑150 (MQ=255) tCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGaa < 2:770365/150‑1 (MQ=255) ccGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGaaa < 1:1780850/150‑1 (MQ=255) cGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAAt < 2:3841463/150‑1 (MQ=255) ggTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAAtg < 1:3329171/150‑1 (MQ=255) ggTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAAtg < 2:1679887/150‑1 (MQ=255) gTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAAtgc < 1:4319864/150‑1 (MQ=255) tGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAAtgct > 1:4895423/1‑150 (MQ=255) gCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAAtgctgc < 1:1947471/150‑1 (MQ=255) gCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAAtgctgc < 2:2073967/150‑1 (MQ=255) aGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCaa < 2:671599/150‑1 (MQ=255) gcgcTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCaaa > 2:4463030/1‑150 (MQ=255) gcgcTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCaaa > 2:129297/1‑150 (MQ=255) tCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAg < 1:4444304/150‑1 (MQ=255) tCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAg < 2:2725692/150‑1 (MQ=255) cGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGt < 2:1390467/150‑1 (MQ=255) ggTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTg > 1:3231059/1‑150 (MQ=255) tGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTggg > 2:3136309/1‑150 (MQ=255) tGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGGGGCTATGGGGCTGGCGGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTggg > 2:3351567/1‑150 (MQ=255) gttgaacgttgaTCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTAt > 2:5109065/1‑150 (MQ=255) gttgaacgttgaTCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTAt > 2:3270132/1‑150 (MQ=255) tgaacgttgaTCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCg > 1:4363811/1‑150 (MQ=255) tgaacgttgaTCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCg > 1:1726207/1‑150 (MQ=255) tgaacgttgaTCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCg > 1:1446395/1‑150 (MQ=255) gaacgttgaTCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCga < 2:4186871/150‑1 (MQ=255) aacgttgaTCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCgat < 1:3152971/150‑1 (MQ=255) acgttgaTCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCgatg < 1:2454083/150‑1 (MQ=255) cgttgaTCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCgatga > 2:808125/1‑150 (MQ=255) cgttgaTCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCgatga > 2:3501218/1‑150 (MQ=255) gttgaTCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCgatgat > 2:2223182/1‑150 (MQ=255) gaTCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGtt > 1:1657375/1‑150 (MQ=255) aTCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGACATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCGAGGCTGTTc > 2:4801969/1‑150 (MQ=255) cAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCg < 2:3788824/150‑1 (MQ=255) ccTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGATATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTg < 2:2644969/150‑1 (MQ=255) cTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGa < 2:1335055/150‑1 (MQ=255) 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tACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCa > 2:1637060/1‑150 (MQ=255) ccTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAgg < 2:2855130/150‑1 (MQ=255) ccTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAgg > 2:4684749/1‑150 (MQ=255) ctgctgGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGa > 1:794275/1‑150 (MQ=255) gctgGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATa > 2:1931830/1‑150 (MQ=255) 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cAGGTGGCTATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTg < 2:2832283/150‑1 (MQ=255) cAGGTGGCGATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGAGTGATTATCAACTg > 2:4957645/1‑150 (MQ=255) | GCTGGAAGTACCGGGTGAAGTCGACGGCGGCCCGCAGGGAATTATTCCGCCAGGTGGCAAGCGCTCGGTGACGTTGAACGTTGATCAACCTGCCGCTACCTGCTGGTTCCATCCGCATCAGCACGGCAAAACCGGGCGACAGGTGGCGATGGGGCTGGCTGGGCTGGTGGTGATTGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGA > CP009273/133881‑134171 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |