Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 1,586,743 | 0 | A | T | 10.3% | 738.7 / 57.7 | 249 | intergenic (‑44/+179) | hipB/yneO | antitoxin of HipAB toxin‑antitoxin system/pseudogene, AidA homolog |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.02e-02 | |||||||||||
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Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
CAATTTTTTTCGCCAGCTCGCTCTGCGTCCAGCCATTTTGCTGGCGAACCAGTTTCATTGCATTCGCCAATTGCGTTGGGCTATAGATCTTCTGAAAGCTCATCATGTCATACGTCCACAGCAAGTTTATCCGCTTAAGGGGATATTATAAGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGC > CP009273/1586594‑1586892 | cAATTTTTTTCGCCAGCTCGCTCTGCGTCCAGCCATTTTGCTGGCGAACCAGTTTCATTGCATTCGCCAATTGCGTTGGGCTATAGATCTTCTGAAAGCTCATCATGTCATACGTCCACAGCAAGTTTATCCGCTTAAGGGGATATtata > 2:1424152/1‑150 (MQ=255) tttttCGCCAGCTCGCTCTGCGTCCAGCCATTTTGCTGGCGAACCAGTTTCATTGCATTCGCCAATTGCGTTGGGCTATAGATCTTCTGAAAGCTCATCATGTCATACGTCCACAGCAAGTTTATCCGCTTAAGGGGATATTATAAGttt > 1:2484915/1‑150 (MQ=255) tttttCGCCAGCTCGCTCTGCGTCCAGCCATTTTGCTGGCGAACCAGTTTCATTGCATTCGCCAATTGCGTTGGGCTATAGATCTTCTGAAAGCTCATCATGTCATACGTCCACAGCAAGTTTATCCGCTGAAGGGGATATTATAAGttt > 1:1369421/1‑150 (MQ=255) 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ataAGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGcc < 1:1479446/150‑1 (MQ=255) taAGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCg > 2:3110200/1‑150 (MQ=255) | CAATTTTTTTCGCCAGCTCGCTCTGCGTCCAGCCATTTTGCTGGCGAACCAGTTTCATTGCATTCGCCAATTGCGTTGGGCTATAGATCTTCTGAAAGCTCATCATGTCATACGTCCACAGCAAGTTTATCCGCTTAAGGGGATATTATAAGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGC > CP009273/1586594‑1586892 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |