Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,675,261 | T→A | 8.3% | L10* (TTA→TAA) | folM → | dihydromonapterin reductase, NADPH‑dependent; dihydrofolate reductase isozyme |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,675,261 | 0 | T | A | 8.3% | 891.4 / 53.1 | 290 | L10* (TTA→TAA) | folM | dihydromonapterin reductase, NADPH‑dependent; dihydrofolate reductase isozyme |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (143/122); new base A (14/10); total (157/133) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.31e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 |
Only 100 of 311 total aligned reads displayed.
TAATGTACTGAACCGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGACTGATTAATGCAGGTGCGCAGTGTATTCAGGCTGATTT > CP009273/1675112‑1675408 | aaTGTACTGAACCGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATatta > 2:2090350/1‑150 (MQ=255) aTGTACTGAACCGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATattaa < 1:360876/150‑1 (MQ=255) tGTACTGAACCGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATattaat > 2:3988509/1‑150 (MQ=255) gTACTGAACCGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATattaatt < 1:1406531/150‑1 (MQ=255) cTGAACCGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACt > 2:1778713/1‑150 (MQ=255) cTGAACCGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACt > 2:2447418/1‑150 (MQ=255) gAACCGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTgg < 2:296476/150‑1 (MQ=255) aCCGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCg > 1:2015879/1‑150 (MQ=255) cGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGa > 2:4610076/1‑150 (MQ=255) tCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAgg < 1:482008/150‑1 (MQ=255) cAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGgt > 1:2857052/1‑150 (MQ=255) aGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGgtc < 1:758350/150‑1 (MQ=255) gAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGgtcgt > 2:1581723/1‑150 (MQ=255) aaTGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGtcgtcg > 2:2536653/1‑150 (MQ=255) aTGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGc < 1:2810107/150‑1 (MQ=255) aTGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCAACGTTGTATATCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCATTGCCAATATTAATTACAGGCTGAGGTCGTCGc > 1:1247782/1‑150 (MQ=255) tGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCa > 1:2104789/1‑150 (MQ=255) ggTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCAt < 2:3657563/150‑1 (MQ=255) ggTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATAAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCAt > 1:2723622/1‑150 (MQ=255) gCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCgg > 1:225300/1‑150 (MQ=255) tGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGcc > 2:3125416/1‑150 (MQ=255) aTTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGcctc < 1:1525904/150‑1 (MQ=255) aTTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTAGCCAATATTAATTACTGGCGGAGTTCGTCGCATCGGcctc > 1:1870707/1‑150 (MQ=255) ttGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGcctcg < 2:2822481/150‑1 (MQ=255) tGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATAAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGcctcgc > 1:4481202/1‑150 (MQ=255) cATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGcctcgccct > 1:2219019/1‑150 (MQ=255) cATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATAAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGcctcgccct > 2:2492001/1‑150 (MQ=255) aTGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGcctcgccctc < 1:5031392/150‑1 (MQ=255) aTGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATAAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGcctcgccctc < 1:268859/150‑1 (MQ=255) tGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGcctcgccctcg < 2:3038421/150‑1 (MQ=255) cTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATAAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCa > 1:76239/1‑150 (MQ=255) tAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGc > 1:2942815/1‑150 (MQ=255) aaTTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCa > 2:1182984/1‑150 (MQ=255) aTTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCAt > 2:2504928/1‑150 (MQ=255) ttGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCAGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCAtt < 1:4070397/150‑1 (MQ=255) tGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCAttt > 2:1025934/1‑150 (MQ=255) tGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCAttt < 1:4955810/150‑1 (MQ=255) gCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTc > 1:1658412/1‑150 (MQ=255) tCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCa < 1:2138935/150‑1 (MQ=255) cGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATAAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCaaa > 2:2315075/1‑150 (MQ=255) ggCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCaaaa > 2:3370327/1‑150 (MQ=255) cGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGc > 1:4214882/1‑150 (MQ=255) ccTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAAc > 2:4685378/1‑150 (MQ=255) cTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAAcc < 2:4046133/150‑1 (MQ=255) cTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAAcc > 2:4800207/1‑150 (MQ=255) cTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAAcc < 1:2493205/150‑1 (MQ=255) taTGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGt > 2:746802/2‑150 (MQ=255) gATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGt < 2:1474848/150‑1 (MQ=255) tGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGa > 1:1052728/1‑150 (MQ=255) gCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGAt < 1:4413256/150‑1 (MQ=255) cTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGAtt < 2:4368650/150‑1 (MQ=255) cTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGAtt < 2:4236458/150‑1 (MQ=255) tAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTAt > 1:5104243/1‑150 (MQ=255) tAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTAt > 1:3388251/1‑150 (MQ=255) aaCGTTAATACCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGACAATATTAATTACTGGAGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAgaaaac > 2:4846981/1‑145 (MQ=255) aCGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCg > 1:822507/1‑150 (MQ=255) aCGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCg < 1:357297/150‑1 (MQ=255) ttCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGac < 1:994743/150‑1 (MQ=255) ttCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGac > 1:1862255/1‑150 (MQ=255) tCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGaca < 2:3872259/150‑1 (MQ=255) aTCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGacaca < 1:4616899/150‑1 (MQ=255) cccATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATAAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTATCAGCTATCGGACACACt > 1:5146257/1‑150 (MQ=255) ccATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTa < 2:1077995/150‑1 (MQ=255) ccATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTa < 1:3926967/150‑1 (MQ=255) cGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCa > 2:1955816/1‑150 (MQ=255) cGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATAAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCa < 2:809412/150‑1 (MQ=255) gTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAg > 1:3320557/1‑150 (MQ=255) tGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCATGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGcc > 2:719095/1‑150 (MQ=255) tAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTg < 2:1240737/150‑1 (MQ=255) tAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTg < 1:3737613/150‑1 (MQ=255) aGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGa > 2:3488577/1‑150 (MQ=255) aaaGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATgg > 1:675002/1‑150 (MQ=255) aaaGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATgg > 1:3682808/1‑150 (MQ=255) aaGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATAAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGa > 1:4530632/1‑150 (MQ=255) gagaTAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGACTg < 2:1301339/150‑1 (MQ=255) agaTAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATAAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGACTGa < 2:4449681/150‑1 (MQ=255) aTAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGACTGAtc > 1:1552636/1‑149 (MQ=255) tAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGACTGATTa > 2:2773394/1‑150 (MQ=255) tAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGACTGATTa > 2:1373379/1‑150 (MQ=255) aaCGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGACTGATTaa > 1:582146/1‑150 (MQ=255) aaCGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGACTGATTaa > 1:1812899/1‑150 (MQ=255) cGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGACTGATTAATg > 1:1700105/1‑150 (MQ=255) gATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGACTGATTAATGc > 1:4559235/1‑150 (MQ=255) gATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGACTGATTAATGc > 1:2210946/1‑150 (MQ=255) tGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCCTTGATGGACTGATTAATGCAg > 2:289057/1‑150 (MQ=255) tAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGACTGATTAATGCAGGTgc < 1:2411640/150‑1 (MQ=255) aaaCCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGACTGATTAATGCAGGTgcgc > 2:2195495/1‑150 (MQ=255) cccAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGACTGATTAATGCAGGTGCGCAgt > 2:3583448/1‑150 (MQ=255) ccAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGACTGATTAATGCAGGTGCGCAgtg > 1:3507277/1‑150 (MQ=255) ccAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGACTGATTAATGCAGGTGCGCAgtg < 1:3811946/150‑1 (MQ=255) aGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGACTGATTAATGCAGGTGCGCAGTGTa > 1:3193947/1‑150 (MQ=255) cccTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGACTGATTAATGCAGGTGCGCAGTGTAtt < 1:2518851/150‑1 (MQ=255) ttGCCAATATAAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGACTGATTAATGCAGGTGCGCAGTGTATTCAg > 1:941314/1‑150 (MQ=255) tGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGACTGATTAATGCAGGTGCGCAGTGTATTCAgg < 2:3320557/150‑1 (MQ=255) tGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGACTGATTAATGCAGGTGCGCAGTGTATTCAgg < 2:4967938/150‑1 (MQ=255) ccAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGACTGATTAATGCAGGTGCGCAGTGTATTCAGGCt < 2:174134/150‑1 (MQ=255) cAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGACTGATTAATGCAGGTGCGCAGTGTATTCAGGCTg < 2:340520/150‑1 (MQ=255) aaTATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGACTGATTAATGCAGGTGCGCAGTGTATTCAGGCTGa < 2:85431/150‑1 (MQ=255) attaattaCTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGACTGATTAATGCAGGTGCGCAGTGTATTCAGGCTGAttt < 2:1676113/150‑1 (MQ=255) ttaattaCTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGACTGATTAATGCAGGTGCGCAGTGTATTCa > 2:5108113/1‑140 (MQ=255) | TAATGTACTGAACCGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGACTGATTAATGCAGGTGCGCAGTGTATTCAGGCTGATTT > CP009273/1675112‑1675408 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |