| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,689,180 | T→G | 100% | E383D (GAA→GAC) | uidA ← | beta‑D‑glucuronidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,689,180 | 0 | T | G | 98.6% | 1102.5 / ‑0.8 | 284 | E383D (GAA→GAC) | uidA | beta‑D‑glucuronidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (3/1); new base G (112/168); total (115/169) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.07e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 285 total aligned reads displayed.
CGCGTTGCTTCCGCCAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTTTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTC > CP009273/1689031‑1689326 | cgTTGCTTCCGCCAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTc > 1:3623189/1‑150 (MQ=255) cgTTGCTTCCGCCAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTATCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTc < 1:552364/150‑1 (MQ=255) ttGCTTCCGCCAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTccc > 2:1698404/1‑150 (MQ=255) ttCCGCCAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGtt > 1:3793200/1‑150 (MQ=255) ttCCGCCAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGtt < 1:3968346/150‑1 (MQ=255) ccGCCAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGa < 1:4912560/150‑1 (MQ=255) gCCAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACt < 2:1425783/150‑1 (MQ=255) aGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGcc > 2:1375984/1‑150 (MQ=255) cgcgAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTc > 1:2172896/1‑150 (MQ=255) gcgAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCg < 1:4337209/150‑1 (MQ=255) cgAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGc > 1:4206571/1‑150 (MQ=255) atatTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTa > 1:2238273/1‑150 (MQ=255) atatTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTa < 1:3155781/150‑1 (MQ=255) atatTCCCGTGCACCTGGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTa < 2:2741390/150‑1 (MQ=255) atTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACa < 1:5132843/150‑1 (MQ=255) cccGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGtt < 1:4601275/150‑1 (MQ=255) cccGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGtt < 1:4702575/150‑1 (MQ=255) ccGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTc > 2:1850666/1‑150 (MQ=255) cGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCt < 1:938479/150‑1 (MQ=255) tGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCttt < 1:2912800/150‑1 (MQ=255) gCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTc < 1:2823238/150‑1 (MQ=255) gCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCttgt < 1:4339965/150‑1 (MQ=255) ggACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCttgttg > 1:2296992/1‑150 (MQ=255) agggTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTTTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGccc > 2:2304652/2‑150 (MQ=255) gggTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCg > 2:4415923/1‑150 (MQ=255) gggTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCg < 1:801100/150‑1 (MQ=255) gTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCt < 1:2102769/150‑1 (MQ=255) tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCtt > 2:990730/1‑150 (MQ=255) tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCtt < 2:2395860/150‑1 (MQ=255) aTCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTc > 1:5099057/1‑150 (MQ=255) aTCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTc > 1:2784446/1‑150 (MQ=255) aTCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTc < 2:2822415/150‑1 (MQ=255) aTCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTc > 2:3061638/1‑150 (MQ=255) ccGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGa > 2:4959769/1‑150 (MQ=255) cGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGaa > 2:1999948/1‑150 (MQ=255) gTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAAc < 2:1210873/150‑1 (MQ=255) gTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAAc > 1:2320196/1‑150 (MQ=255) tCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCa < 1:2515994/150‑1 (MQ=255) tCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCa < 1:2089718/150‑1 (MQ=255) cGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCaa < 2:2771046/150‑1 (MQ=255) gTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAAt < 2:793671/150‑1 (MQ=255) gTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAAt < 1:1724580/150‑1 (MQ=255) gTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAAt > 2:3877912/1‑150 (MQ=255) ggCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGcc < 1:3156890/150‑1 (MQ=255) aaTACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTaa < 1:1334811/150‑1 (MQ=255) tCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAagaga < 2:3661781/150‑1 (MQ=255) tCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAagaga < 2:1796824/150‑1 (MQ=255) tCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAagaga > 1:1047604/1‑150 (MQ=255) ccACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAagagag < 1:2742709/150‑1 (MQ=255) cacaTCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAgg < 2:4558449/150‑1 (MQ=255) cacaTCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAgg < 1:4051659/150‑1 (MQ=255) caTCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGtt < 1:1069829/150‑1 (MQ=255) aTCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTa < 2:2057441/150‑1 (MQ=255) aTCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTa > 1:4579845/1‑150 (MQ=255) tCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTaa > 2:4975299/1‑150 (MQ=255) caccacGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGAGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACAAATGCCTAAAGAGAGGTTaaa > 1:566386/1‑150 (MQ=255) accacGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAg > 1:2468308/1‑150 (MQ=255) ccacGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGc > 2:349492/1‑150 (MQ=255) cacGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGcc < 2:78800/150‑1 (MQ=255) acGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCg < 1:5007979/150‑1 (MQ=255) acGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCg < 1:2708459/150‑1 (MQ=255) cTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGAca < 1:33123/150‑1 (MQ=255) cTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGAca < 2:4288797/150‑1 (MQ=255) cTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGAca < 2:2744104/150‑1 (MQ=255) taggtggtTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACACCTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGAcagc < 1:4877679/148‑1 (MQ=255) gtTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGt < 2:3440780/150‑1 (MQ=255) gtTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGt < 1:3277452/150‑1 (MQ=255) tttttGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGtt < 1:3074592/150‑1 (MQ=255) tttttGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGtt < 1:1661533/150‑1 (MQ=255) ttttGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTTTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGttt < 1:4875427/150‑1 (MQ=255) ttttGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGttt > 2:647617/1‑150 (MQ=255) tttGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTtc < 1:1904414/150‑1 (MQ=255) cACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCatcaa < 2:4831658/150‑1 (MQ=255) aCGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCatcaat < 1:3877912/150‑1 (MQ=255) aCGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCatcaat < 2:1514538/150‑1 (MQ=255) aCGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCatcaat < 1:1532132/150‑1 (MQ=255) cTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATcacca < 2:2238351/150‑1 (MQ=255) aGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATg > 1:73700/1‑150 (MQ=255) gCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGc > 2:4664045/1‑150 (MQ=255) ctctTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGcc < 1:554551/150‑1 (MQ=255) ctctTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGcc < 1:349839/150‑1 (MQ=255) tctTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCa < 2:2726012/150‑1 (MQ=255) tctTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCa > 1:3399961/1‑150 (MQ=255) tAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGtt > 2:3789665/1‑150 (MQ=255) aTCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCa > 2:4009804/1‑150 (MQ=255) gCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGCTGCCCGCTTCGAAACCAAGGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCt < 1:661307/150‑1 (MQ=255) ccTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTg > 2:446377/1‑150 (MQ=255) aaGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAg > 1:4840979/1‑150 (MQ=255) gTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTc < 1:2409406/150‑1 (MQ=255) tGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCg < 2:5118585/150‑1 (MQ=255) tGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCg < 1:4983579/150‑1 (MQ=255) gcTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGc > 1:2582072/1‑150 (MQ=255) cTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCa > 1:3462754/1‑150 (MQ=255) cTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCa < 1:3545662/150‑1 (MQ=255) cTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTGTCATCAGTCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCGAGGCGAGCa > 1:2630698/1‑150 (MQ=255) gCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCAtct > 1:184488/1‑150 (MQ=255) tGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTATAGAGAGGTTATAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCCATCACCACGATGCCATGTTCATCGGCCCGGGCGCGCATctct > 2:2942598/1‑150 (MQ=255) gAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCGGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCtt < 1:635870/150‑1 (MQ=255) gAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCtt > 2:3186631/1‑150 (MQ=255) aGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTc < 1:1417940/150‑1 (MQ=255) | CGCGTTGCTTCCGCCAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTTTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTC > CP009273/1689031‑1689326 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |