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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 1,700,008 | 0 | T | A | 5.5% | 735.8 / 20.9 | 231 | intergenic (+61/‑16) | ydgK/rsxA | DUF2569 family inner membrane protein/SoxR iron‑sulfur cluster reduction factor component; inner membrane protein of electron transport complex |
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Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
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ataataGGCGGC‑TTTTTAATTTCAGGCCGAAAAATGACTGACTACCTGTTACTGTTTGTCGGAACTGTACTGGTCAATAACTTTGTACTGGTCAAGTTTCTCGGTCTCTGTCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATg < 2:4867209/150‑1 (MQ=255) attggcggc‑TTTTTTATTTCAGGCCGAAAAATGACTGACTACCTGTTACTGTTTGTCGGAACTGTACTGGTCAATAACTTTGTACTGGTAAAGTTTCTCGGTCTCTGTCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGc < 1:4938142/147‑1 (MQ=255) taGGCGGC‑TTTTTTATTTCAGGCCGAAAAATGACTGACTACCTGTTACTGTTTGTCGGAACTGTACTGGTCAATAACTTTGTACTGGTCAAGTTTCTTGGTCTCTGTCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCa > 2:456642/1‑150 (MQ=255) aGGCGGC‑TTTTTTATTTCAGGCCGAAAAATGACTGACTACCTGGTACTGTTGGTCGGAACTGTACTGGTCAATAACTTTGTACTGGTCAAGTTTCTCGGTCTCTGTCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCAt < 2:1898922/150‑1 (MQ=255) gcggc‑TTTTTTATTTCAGGCCGAAAAATGACTGACTACCTGTTACTGTTTGTCGGAACTGTACTGGTCAATAACTTTGTACTGGTCAAGTTTCTCGGTCTCTGTCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATgg < 1:2543298/150‑1 (MQ=255) cggc‑TTTTTTATTTCAGGCCGAAAAATGACTGACTACCTGTTACTGTTTGTCGGAACTGTACTGGTCAATAACTTTGTACTGGTCAAGTTTCTCGGTCTCTGTCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATggg > 2:119010/1‑150 (MQ=255) cggc‑TTTTTTATTTCAGGCCGAAAAATGACTGACTACCTGTTACTGTTTGTCGGAACTGTACTGGTCAATAACTTTGTACTGGTCAAGTTTCTCGGTCTCTGTCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATggg > 1:4831075/1‑150 (MQ=255) gc‑TTTTTAATTTCAGGCCGAAAAATGACTGACTACCTGTTACTGTTTGTCGGAACTGTACTGGTCAATAACTTTGTACTGGTCAAGTTTCTCGGTCTCTGTCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGc > 2:1475922/1‑150 (MQ=255) tttttATTTCAGGCCGAAAAATGACTGACTACCTGTTACTGTTTGTCGGAACTGTACTGGTCAATAACTTTGTACTGGTCAAGTTTCTCGGTCTCTGTCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTgg > 1:2102774/1‑150 (MQ=255) tttATTTCAGGCCGAAAAATGACTGACTACCTGTTACTGTTTGTCGGAACTGTACTGGTCAATAACTTTGTACTGGTCAAGTTTCTCGGTCTCTGTCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGca > 1:2609995/1‑150 (MQ=255) ttATTTCAGGCCGAAAAATGACTGACTACCTGTTACTGTTTGTCGGACCTGTACTGGTCAATAACTTTGTACTGGTCAAGTTTCTCGGTCTCTGTCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGcaa < 1:1445816/150‑1 (MQ=255) tATTTCAGGCCGAAAAATGACTGACTACCTGTTACTGTTTGTCTGAACTGTACTGGTCAATAACTTTGTACTGTTCAAGTTTCTCGGTCTCTGTCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGcaac < 2:3400143/150‑1 (MQ=255) | TTGCTGTTTACTTTGTTGGCAACCGCATTGATCGTCCCCTATTTCAAACGCTCGTCGCGGGTAAAAGCGACGTTTGTGAATCCGTAATAACCTTACAGTTAACCTGTTGTCGCCTGCTCTGGATTAACGGATAATAGGCGGC‑TTTTTTATTTCAGGCCGAAAAATGACTGACTACCTGTTACTGTTTGTCGGAACTGTACTGGTCAATAACTTTGTACTGGTCAAGTTTCTCGGTCTCTGTCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCAAC > CP009273/1699861‑1700157 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |