| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,886,725 | G→T | 100% | I256I (ATC→ATA) | yoaA ← | putative ATP‑dependent helicase, DinG family |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,886,725 | 0 | G | T | 99.0% | 986.6 / 0.4 | 298 | I256I (ATC→ATA) | yoaA | putative ATP‑dependent helicase, DinG family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/2); new base T (136/159); total (137/161) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 298 total aligned reads displayed.
CTGAATTTGCGGATTAGCTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCGATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCGGGATCAGTTCGCCAAATCCACTCTCTTT > CP009273/1886578‑1886871 | tGAATTTGCGGATTAGCTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATg < 1:5118892/150‑1 (MQ=255) aaTTTGCGGATTAGCTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGt < 1:1186305/150‑1 (MQ=255) aTTTGCGGATTAGCTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTg > 1:4438071/1‑150 (MQ=255) ttGCGGATTAGCTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGAt > 2:3087008/1‑150 (MQ=255) tGCGGATTAGCTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATg > 2:3906877/1‑150 (MQ=255) gCGGATTAGCTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGt < 2:1891215/150‑1 (MQ=255) cGGATTATCTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTc < 1:2539712/150‑1 (MQ=255) cGGATTAGCTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTc > 1:1059771/1‑150 (MQ=255) cGGATTAGCTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTc > 1:3640178/1‑150 (MQ=255) cGGATTAGCTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTc < 2:1597680/150‑1 (MQ=255) cGGATTAGCTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTc > 2:576711/1‑150 (MQ=255) aTTAGCTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCttt < 1:4938747/150‑1 (MQ=255) aGCTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGc < 1:3992110/150‑1 (MQ=255) gCTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGcc < 2:1135810/150‑1 (MQ=255) cTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCa > 2:171084/1‑150 (MQ=255) cTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCa < 2:1975868/150‑1 (MQ=255) tAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAg > 1:1642712/1‑150 (MQ=255) tAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAg > 1:4422032/1‑150 (MQ=255) aaCAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAgg < 1:545990/150‑1 (MQ=255) cTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAg > 1:1490184/1‑150 (MQ=255) tCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGc > 1:5070720/1‑150 (MQ=255) cGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGt > 1:1528487/1‑150 (MQ=255) gCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGtt < 2:546541/150‑1 (MQ=255) cAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTg < 1:790976/150‑1 (MQ=255) cAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTg > 2:4550267/1‑150 (MQ=255) tACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGAc > 1:571856/1‑150 (MQ=255) tACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGAc < 1:2734698/150‑1 (MQ=255) aCCGCGATCACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGCGCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACt < 2:2778292/150‑1 (MQ=255) aCCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACt > 2:870228/1‑150 (MQ=255) aCCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACt < 2:631932/150‑1 (MQ=255) aCCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACt < 2:183387/150‑1 (MQ=255) aCCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACt > 1:1263786/1‑150 (MQ=255) ccGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTg < 2:4446062/150‑1 (MQ=255) cgcgATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTgg < 2:3715517/150‑1 (MQ=255) gcgATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGga < 2:2214269/150‑1 (MQ=255) gcgATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGga < 1:160599/150‑1 (MQ=255) gcgATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGga < 2:2305907/150‑1 (MQ=255) cgATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGgag > 2:1057575/1‑150 (MQ=255) gATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGgaga > 1:976060/1‑150 (MQ=255) aTAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGagag < 1:4223037/150‑1 (MQ=255) tAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGt > 2:165092/1‑150 (MQ=255) tAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGt > 2:4511902/1‑150 (MQ=255) aaCCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGtg < 2:5012130/150‑1 (MQ=255) ccTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGtgac < 2:3809869/150‑1 (MQ=255) ggCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGtgactga > 1:3900354/1‑150 (MQ=255) gCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGtgactgac < 1:3245693/150‑1 (MQ=255) cTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTCTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGAcc < 1:2208547/150‑1 (MQ=255) cACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCaa > 1:1915683/1‑150 (MQ=255) cACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCaa > 1:2303770/1‑150 (MQ=255) ccGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCaaaa > 1:1144347/1‑150 (MQ=255) cGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAAt < 1:3006348/150‑1 (MQ=255) gAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATa < 1:4796999/150‑1 (MQ=255) ttGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATActg < 1:2376819/150‑1 (MQ=255) tGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATActgg < 2:3447753/150‑1 (MQ=255) gCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATActggc > 1:1720409/1‑150 (MQ=255) cAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATActggct > 1:1860114/1‑150 (MQ=255) cAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATActggct < 1:3527320/150‑1 (MQ=255) gACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATActggctgg < 1:369115/150‑1 (MQ=255) cGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCa < 1:2275164/150‑1 (MQ=255) gAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCaa < 2:797885/150‑1 (MQ=255) gAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCaa > 1:1290618/1‑150 (MQ=255) gAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTGTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAAGTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTGTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGCGAGTGACTGACCCAAATACTGGCGGGCaa > 2:435011/1‑150 (MQ=255) aaaTCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATg > 2:5088495/1‑150 (MQ=255) aaTCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGt > 1:3374931/1‑150 (MQ=255) cTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCgg > 1:1883303/1‑150 (MQ=255) cTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGAAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCgg > 1:2841547/1‑150 (MQ=255) gcgcACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTa < 1:1322264/150‑1 (MQ=255) aCTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCtg < 1:2070104/150‑1 (MQ=255) ctctGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCtgg > 2:4802564/1‑150 (MQ=255) ctctGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCtgg > 2:465407/1‑150 (MQ=255) tGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCtggtgg > 1:633761/1‑150 (MQ=255) ggCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGc > 1:2469450/1‑150 (MQ=255) ggCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGc > 1:4525360/1‑150 (MQ=255) aaGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTtc > 1:3945823/1‑150 (MQ=255) aaGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTtc < 1:4103317/150‑1 (MQ=255) cGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTtcgtcg > 1:490168/1‑150 (MQ=255) gATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGa > 2:4868365/1‑150 (MQ=255) tCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAg > 2:2098847/1‑150 (MQ=255) tCAGCGCACTTGTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAg < 1:2940776/150‑1 (MQ=255) gcACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCAt > 1:2501647/1‑150 (MQ=255) gcACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCAt < 2:2342824/150‑1 (MQ=255) tGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTcc < 2:2826616/150‑1 (MQ=255) tGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTcc < 1:3167012/150‑1 (MQ=255) tGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTcc < 1:3829952/150‑1 (MQ=255) aCTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCtt > 2:373942/1‑150 (MQ=255) tgctgGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTcc > 1:4589600/1‑150 (MQ=255) tgGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCggg > 1:1732857/1‑150 (MQ=255) tgGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCggg < 2:2986136/150‑1 (MQ=255) tgtCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCGGGATCa > 1:2346626/1‑150 (MQ=255) cTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCGGGATCAGtt < 2:3640178/150‑1 (MQ=255) tttAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCGGGATCAGTTCg < 2:4088492/150‑1 (MQ=255) tttAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCGGGATCAGTTCg < 2:4557278/150‑1 (MQ=255) tttAATTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCGGGATCAGTTCg < 2:3031226/150‑1 (MQ=255) aaTTCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCGGGATCAGTTCGCCa > 1:137840/1‑150 (MQ=255) tCGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCGGGATCAGTTCGCCAAAt > 2:918608/1‑150 (MQ=255) cGGTGCGGTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCGGGATCAGTTCGCCAAATc > 2:3330345/1‑150 (MQ=255) gTAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCGGGATCAGTTCGCCAAATCCActctc > 1:402997/1‑150 (MQ=255) tAGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCGGGATCAGTTCGCCAAATCCActctct < 2:3928716/150‑1 (MQ=255) aGGCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCGGGATCAGTTCGCCAAATCCACTCTCtt > 2:4952789/1‑150 (MQ=255) ggCTATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCGGGATCAGTTCGCCAAATCCACTCTCttt < 1:688033/150‑1 (MQ=255) | CTGAATTTGCGGATTAGCTAACAGCTCACGCAGGTTACCGCGATAACCTGGCTCACCGAGTTGCAGACGAAAATCCTGCGCACTCTGGGCAAGACGATCAGCGCACTTTTGTAACTGCTGGGTGTCTTTTAATTCGGTGCGGTAGGCGATGGTGATGTCTTTTGCCAGGTCGAGCAGTTGTCGACTGGAGAGTGACTGACCAAAATACTGGCTGGCAATGTCCGGTAGCTGGTGGGCTTCGTCGAAGATCATGACGTCCGCTTCCGGGATCAGTTCGCCAAATCCACTCTCTTT > CP009273/1886578‑1886871 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |