| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 168,584 | A→T | 80.0% | L212F (TTA→TTT) | fhuB → | fused iron‑hydroxamate transporter subunits of ABC superfamily: membrane components |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 168,584 | 0 | A | T | 80.0% | 847.1 / 208.9 | 379 | L212F (TTA→TTT) | fhuB | fused iron‑hydroxamate transporter subunits of ABC superfamily: membrane components |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/43); new base T (150/153); total (183/196) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.70e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.41e-01 | |||||||||||
Only 100 of 379 total aligned reads displayed.
ACTGGTTATCTTCCATCATGACCAACTGCAAAGCATGTTTCTGTGGAGCACTGGAACGCTGACGCAAACCGACTGGGGCGGCGTTGAGCGTTTATGGCCGCAGCTGCTGGGCGGTGTGATGCTGACGTTGCTGCTACTTCGTCCGTTAACCCTGATGGGGCTTGATGATGGCGTGGCGCGCAATCTCGGGCTGGCCTTGTCGCTTGCGCGTCTGGCAGCGCTGTCGCTGGCGATTGTCATCAGTGCGCTGCTGGTGAACGCTGTGGGGATTATCGGCTTTATCGGGTTGTTCG > CP009273/168437‑168729 | aCTGGTTATCTTCCATCATGACCAACTGCAAAGCATGTTTCTGTGGAGCACTGGAACGCTGACGCAAACCGACTGGGGCGGCGTTGAGCGTTTATGGCCGCAGCTGCTGGGCGGTGTGATGCTGACGTTGCTGCTACTTCGTCCGTTTAc > 1:1317184/1‑150 (MQ=255) ggTTATCTTCCATCATGACCAACTGCAAAGCATGTTTCTGTGGAGCACTGGAACGCTGACGCAAACCGACTGGGGCGGCGTTGAGCGTTTATGGCCGCAGCTGCTGGGCGGTGTGATGCTGACGTTGCTGCTACTTCGTCCGTTTACCCt < 1:95472/150‑1 (MQ=255) ggTTATCTTCCATCATGACCAACTGCAAAGCATGTTTCTGTGGAGCACTGGAACGCTGACGCAAACCGACTGGGGCGGCGTTGAGCGTTTATGGCCGCAGCTGCTGGGCGGTGTGATGCTGACGTTGCTGCTACTTCGTCCGTTTACCCt < 1:894489/150‑1 (MQ=255) ggTTATCTTCCATCATGACCAACTGCAAAGCATGTTTCTGTGGAGCACTGGAACGCTGACGCAAACCGACTGGGGCGGCGTTGAGCGTTTATGGCCGCAGCTGCTGGGCGGTGTGATGCTGACGTTGCTGCTACTTCGTCCGTTTACCCt < 2:5106796/150‑1 (MQ=255) gTTATCTTCCATCATGACCAACTGCAAAGCATGTTTCTGTGGAGCACTGGAACGCTGACGCAAACCGACTGGGGCGGCGTTGAGCGTTTATGGCCGCAGCTGCTGGGCGGTGTGATGCTGACGTTGCTGCTACTTCGTCCGTTTACCCTg < 2:1152436/150‑1 (MQ=255) gTTATCTTCCATCATGACCAACTGCAAAGCATGTTTCTGTGGAGCACTGGAACGCTGACGCAAACCGACTGGGGCGGCGTTGAGCGTTTATGGCCGCAGCTGCTGGGCGGTGTGATGCTGACGTTGCTGCTACTTCGTCCGTTTACCCTg < 2:4184104/150‑1 (MQ=255) tATCTTCCATCATGACCAACTGCAAAGCATGTTTCTGTGGAGCACTGGAACGCTGACGCAAACCGACTGGGGCGGCGTTGAGCGTTTATGGCCGCAGCTGCTGGGCGGTGTGATGCTGACGTTGCTGCTACTTCGTCCGTTTACCCTGAt < 1:3066160/150‑1 (MQ=255) tCTTCCATCATGACCAACTGCAAAGCATGTTTCTGTGGAGCACTGGAACGCTGACGCAAACCGACTGGGGCGGCGTTGAGCGTTTATGGCCGCAGCTGCTGGGCGGTGTGATGCTGACGTTGCTGCTACTTCGTCCGTTTACCCTGATgg > 1:5151886/1‑150 (MQ=255) ttCCATCATGACCAACTGCAAAGCATGTTTCTGTGGAGCACTGGAACGCTGACGCAAACCGACTGGGGCGGCGTTGAGCGTTTATGGCCGCAGCTGCTGGGCGGTGTGATGCTGACGTTGCTGCTACTTCGTCCGTTTACCCTGATgggg < 1:2813267/150‑1 (MQ=255) atGACCAACTGCAAAGCATGTTTCTGTGGAGCACTGGAACGCTGACGCAAACCGACTGGGGCGGCGTTGAGCGTTTATGGCCGCAGCTGCTGGGCGGTGTGATGCTGACGTTGCTGCTACTTCGTCCGTTTACCCTGATGGGGCTtgatg > 1:2377535/1‑150 (MQ=255) aCCAACTGCAAAGCATGTTTCTGTGGAGCACTGGAACGCTGACGCAAACCGACTGGGGCGGCGTTGAGCGTTTATGGCCGCAGCTGCTGGGCGGTGTGATGCTGACGTTGCTGCTACTTCGTCCGTTTACCCTGATGGGGCTTGatgatg > 1:2014903/1‑150 (MQ=255) cAACTGCAAAGCATGTTTCTGTGGAGCACTGGAACGCTGACGCAAACCGACTGGGGCGGCGTTGAGCGTTTATGGCCGCAGCTGCTGGGCGGTGTGATGCTGACGTTGCCGCTACTTCGTCCGTTTACCCTGATGGGGCTTGATGAtggc > 2:2214956/1‑150 (MQ=255) tGCAAAGCATGTTTCTGTGGAGCACTGGAACGCTGACGCAAACCGACTGGGGCGGCGTTGAGCGTTTATGGCCGCAGCTGCTGGGCGGTGTGATGCTGACGTTGCTGCTACTTCGTCCGTTTACCCTGATGGGGCTTGATGAtggcgtgg < 2:55207/150‑1 (MQ=255) 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aaaGCATGTTTCTGTGGAGCACTGGAACGCTGACGCAAACCGACTGGGGCGGCGTTGAGCGTTTATGGCCGCAGCTGCTGGGCGGTGTGATGCTGACGTTGCTGCTACTTCGTCCGTTAACCCTGATGGGGCTTGATGATGGCGTGgcgc < 2:4694252/150‑1 (MQ=255) gCATGTTTCTGTGGAGCACTGGAACGCTGACGCAAACCGACTGGGGCGGCGTTGAGCGTTTATGGCCGCAGCTGCTGGGCGGTGTGATGCTGACGTTGCTGCTACTTCGTCCGTTTACCCTGATGGGGCTTGATGATGGCGTGGCGCGCa > 1:3598308/1‑150 (MQ=255) gCATGTTTCTGTGGAGCAATGGAACGCTGACGCAAACCGACTGGGGCTGCGTTGAGCGTTTATGGCCGCAGCTGCTGGGCGGTGTGATGCTGACGTTGCTGCTACTTCGTCCGTTAACCCTGATGGGGCTTGATGATGGCGTGGCGCGCa > 2:795300/1‑150 (MQ=255) aTGTTTCTGTGGAGCACTGGAACGCTGACGCAAACCGACTGGGGCGGCGTTGAGCGTTTATGGCCGCAGCTGCTGGGCGGTGTGATGCTGACGTTGCTGCTACTTCGTCCGTTTACCCTGATGGGGCTTGATGATGGCGTGGCGCGCAAt > 2:3412375/1‑150 (MQ=255) tGTTTCTGTGGAGCACTGGAACGCTGACGCAAACCGACTGGGGCGGCGTTGAGCGTTTATGGCCGCAGCTGCTGGGCGGTGTGATGCTGACGTTGCTGCTACTTCGTCCGTTTACCCTGATGGGGCTTGATGATGGCGTGGCGCGCAAtc > 1:1821777/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |