| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,524,056 | C→A | 100% | A179A (GCG→GCT) | zipA ← | FtsZ stabilizer |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,524,056 | 0 | C | A | 98.8% | 1118.1 / 2.5 | 340 | A179A (GCG→GCT) | zipA | FtsZ stabilizer |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/1); new base A (198/137); total (202/138) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.52e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 340 total aligned reads displayed.
ATATTCATATCGCCAAAAATGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCCGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGTTCAGGCTGCGGCTG > CP009273/2523910‑2524202 | atatTCATATCGCCAAAAATGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCt < 1:419951/150‑1 (MQ=255) cATATCGCCAAAAATGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTAcagg > 1:475209/1‑150 (MQ=255) gCCAAAAATGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTAcaggctcagg > 1:3932516/1‑150 (MQ=255) aaaaaTGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCtg < 1:3363671/150‑1 (MQ=255) aaaaaTGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCtg > 2:3966581/1‑150 (MQ=255) aaaaaTGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCtg > 2:3461668/1‑150 (MQ=255) aaaaTGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCtgt > 1:1107234/1‑150 (MQ=255) aaaaTGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCtgt > 1:1021451/1‑150 (MQ=255) aTGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTgtggt > 2:3182331/1‑150 (MQ=255) tGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTgtggtg > 1:2639253/1‑150 (MQ=255) tGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTgtggtg > 2:1862517/1‑150 (MQ=255) gAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCGTTGCGCTTCGGTTTATCCAGAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGc > 2:2648067/1‑150 (MQ=255) aaGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGcc < 1:3441116/150‑1 (MQ=255) aGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCg < 2:1191762/150‑1 (MQ=255) ccGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTa > 1:237438/1‑150 (MQ=255) cGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCTCCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTAc < 1:4448054/150‑1 (MQ=255) ttgAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTc > 2:1312020/1‑150 (MQ=255) ttgAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTc < 2:556479/150‑1 (MQ=255) ttgAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTc > 1:3822719/1‑150 (MQ=255) tgAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCt > 2:151188/1‑150 (MQ=255) gCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAgg > 1:2467629/1‑150 (MQ=255) tGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCt > 2:4462736/1‑150 (MQ=255) gTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTg < 2:1943632/150‑1 (MQ=255) gTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTg < 1:1232516/150‑1 (MQ=255) gaagCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAg < 1:414837/150‑1 (MQ=255) gCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCt < 2:2170737/150‑1 (MQ=255) gCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCt > 2:4560917/1‑150 (MQ=255) cAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCtg < 2:2838370/150‑1 (MQ=255) cAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCtg < 2:751455/150‑1 (MQ=255) aGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCtgt > 2:3623503/1‑150 (MQ=255) aGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCtgt > 2:2397978/1‑150 (MQ=255) ttCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCtgttg < 1:3956022/150‑1 (MQ=255) ttCACCGTGTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATACTCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCtgttg < 2:3716432/150‑1 (MQ=255) cACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTtgtg < 1:3015522/150‑1 (MQ=255) cACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTtgtg < 2:4109450/150‑1 (MQ=255) cGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCg > 2:3981452/1‑150 (MQ=255) cGTTTAGCTCGCGACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCg < 2:2920815/150‑1 (MQ=255) ttAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATAACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGATCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGtt > 2:3890925/1‑150 (MQ=255) tAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTg < 2:63788/150‑1 (MQ=255) tAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTg < 2:1305367/150‑1 (MQ=255) gCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGc > 2:4219404/1‑150 (MQ=255) cTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCt < 1:753323/150‑1 (MQ=255) cTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCt < 1:2824376/150‑1 (MQ=255) tACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTg > 2:128204/1‑150 (MQ=255) tACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTg > 1:3605534/1‑150 (MQ=255) aCCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATACCTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGa < 1:2901445/150‑1 (MQ=255) aCCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGa > 1:1733255/1‑150 (MQ=255) gTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATg > 1:4589767/1‑150 (MQ=255) gATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGca > 2:3790297/1‑150 (MQ=255) cgccgcGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAgg > 2:3660290/1‑150 (MQ=255) ccgcGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCt < 1:1989780/150‑1 (MQ=255) gcgACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTgc < 1:3144454/150‑1 (MQ=255) cgACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTgcg > 1:4910474/1‑150 (MQ=255) cgACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTgcg < 2:1561393/150‑1 (MQ=255) cgACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTgcg > 1:136946/1‑150 (MQ=255) gACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTgcgg < 1:3725451/150‑1 (MQ=255) gACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTgcgg > 1:829737/1‑150 (MQ=255) aCGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTgcggc < 1:1631378/150‑1 (MQ=255) 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tGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGgcg < 2:1731678/150‑1 (MQ=255) gATAATCACCGCTTCTTTTCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCAGGTTGCGGTACTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGgcgc > 1:2535202/1‑150 (MQ=255) tAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGa > 1:2965453/1‑150 (MQ=255) tAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGa > 1:2721247/1‑150 (MQ=255) aTCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGAcc > 2:4323482/1‑150 (MQ=255) tCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCt < 2:1021451/150‑1 (MQ=255) tCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCt > 1:976195/1‑150 (MQ=255) aCCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCtgt > 1:2925949/1‑150 (MQ=255) cGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTgg > 2:3377458/1‑150 (MQ=255) gCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGc < 1:5113919/150‑1 (MQ=255) gCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGc > 1:5159104/1‑150 (MQ=255) cttcttTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCg > 1:1512341/1‑150 (MQ=255) cttcttTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCg > 1:3983918/1‑150 (MQ=255) ttcttTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGa > 1:5029349/1‑150 (MQ=255) tcttTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGaa < 2:5061279/150‑1 (MQ=255) cttTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGaaa < 1:1702237/150‑1 (MQ=255) tttGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAAc > 1:1314258/1‑150 (MQ=255) tttGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAAc > 1:3255834/1‑150 (MQ=255) ttGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACt < 2:1107228/150‑1 (MQ=255) tGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTg < 2:4841591/150‑1 (MQ=255) 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ttATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAAc > 2:3215689/1‑150 (MQ=255) tATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACg > 1:1879697/1‑150 (MQ=255) tAACTGGAGCAGGTTCAGCGACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGtt < 2:4985271/150‑1 (MQ=255) aCTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGTTCa < 2:3932516/150‑1 (MQ=255) aCTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGTTCa < 1:2743060/150‑1 (MQ=255) tGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGTTCAgg < 2:2983206/150‑1 (MQ=255) aGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGTTCAGGCTg > 2:1218740/1‑150 (MQ=255) aGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGTTCAGGCTg > 1:4881405/1‑150 (MQ=255) cAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGGGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGTTCAGGCTGCg > 2:3736714/1‑150 (MQ=255) ggTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGTTCAGGCTGCGGc < 1:192438/150‑1 (MQ=255) gTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGTTCAGGCTGCGGCt > 1:2145177/1‑150 (MQ=255) ttCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGTTCAGGCTGCGGCTg < 1:3743822/150‑1 (MQ=255) | ATATTCATATCGCCAAAAATGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCCGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGTTCAGGCTGCGGCTG > CP009273/2523910‑2524202 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |