| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,736,714 | C→A | 100% | R325S (CGC→AGC) | yfiN → | putative membrane‑anchored diguanylate cyclase with an N‑terminal periplasmic domain |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,736,714 | 0 | C | A | 98.1% | 827.1 / 2.2 | 255 | R325S (CGC→AGC) | yfiN | putative membrane‑anchored diguanylate cyclase with an N‑terminal periplasmic domain |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/2); new base A (126/124); total (129/126) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
CCGAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCAT > CP009273/2736569‑2736859 | ccGAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCt < 2:923664/150‑1 (MQ=255)ccGAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCt < 2:4144459/150‑1 (MQ=255)ccGAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCt < 2:3682972/150‑1 (MQ=255)ccGAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCt < 2:4854679/150‑1 (MQ=255) cGAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTg > 1:1100176/1‑150 (MQ=255) cGAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTg < 1:4742124/150‑1 (MQ=255) cGAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTg < 2:148900/150‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTgg > 2:1325720/1‑150 (MQ=255) aaaCGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGggcg < 2:2718404/150‑1 (MQ=255) aaaCGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGggcg < 2:2410046/150‑1 (MQ=255) gTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGa < 1:2947415/150‑1 (MQ=255) gTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGa < 1:513908/150‑1 (MQ=255) tCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGAt > 1:4089641/1‑150 (MQ=255) ggCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGa < 1:1006899/150‑1 (MQ=255) aCTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGc > 1:1576751/1‑150 (MQ=255) cTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCt > 1:3679147/1‑150 (MQ=255) aTTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTAt < 2:2581488/150‑1 (MQ=255) ttCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATgg < 1:2606977/150‑1 (MQ=255) tCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGt < 2:4049123/150‑1 (MQ=255) aTGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGctct > 2:3724706/1‑150 (MQ=255) ggCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTat > 2:2616398/1‑150 (MQ=255) cGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTatga < 1:553206/150‑1 (MQ=255) ttCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAg > 1:2231295/1‑150 (MQ=255) cAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTc < 1:1475952/150‑1 (MQ=255) aaaTACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCg > 2:3253598/1‑150 (MQ=255) aTACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGa > 1:4870401/1‑150 (MQ=255) aTACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGa < 1:1630649/150‑1 (MQ=255) aTACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGa < 1:936810/150‑1 (MQ=255) tACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGaa < 2:3598479/150‑1 (MQ=255) aCATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAAt > 1:5038889/1‑150 (MQ=255) cATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATc < 2:244024/150‑1 (MQ=255) aTCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCt < 1:2444088/150‑1 (MQ=255) aTCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCt < 2:1636753/150‑1 (MQ=255) cAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGa < 1:3477121/150‑1 (MQ=255) cAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGa < 1:2722673/150‑1 (MQ=255) aaTGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGaa > 2:3196595/1‑150 (MQ=255) aaTGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGaa < 2:5014793/150‑1 (MQ=255) aaTGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATATGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGACTCTGaa > 1:4060481/1‑150 (MQ=255) aaTGAGACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGaa < 2:1959676/150‑1 (MQ=255) aTACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTgc < 1:4619211/150‑1 (MQ=255) aTACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTgc > 2:1598614/1‑150 (MQ=255) aTACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTgc > 2:4604346/1‑150 (MQ=255) aTACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTgc < 1:2809466/150‑1 (MQ=255) cTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTgcagca > 1:970188/1‑150 (MQ=255) tGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGcagcag > 2:4616472/1‑150 (MQ=255) tGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGcagcag > 1:4468519/1‑150 (MQ=255) tGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGcagcag > 2:1238996/1‑150 (MQ=255) tGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGcagcag > 1:1563262/1‑150 (MQ=255) gCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCa < 1:5059839/150‑1 (MQ=255) cGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAg > 2:2767066/1‑150 (MQ=255) cGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAg > 2:745318/1‑150 (MQ=255) gggCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACt > 1:2361139/1‑150 (MQ=255) gggCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACt > 2:4369648/1‑150 (MQ=255) gCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGa > 2:3976180/1‑150 (MQ=255) cGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCCGCAGATATGTTCAGCACTGac > 1:689305/1‑150 (MQ=255) aTAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGacac > 1:1097663/1‑150 (MQ=255) tAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGAcaca < 1:3905878/150‑1 (MQ=255) tAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGAcaca > 2:4291047/1‑150 (MQ=255) agagTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCCGCAGATATGTTCAGCACTGACACaa > 2:2060808/1‑150 (MQ=255) agagTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACaa > 2:3900656/1‑150 (MQ=255) agTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAAt < 2:1824647/150‑1 (MQ=255) cTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCtt > 1:4226525/1‑150 (MQ=255) cTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCtt > 2:693632/1‑150 (MQ=255) ttgattgaAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCttt < 2:130811/150‑1 (MQ=255) tgattgaAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTa > 1:3433317/1‑150 (MQ=255) attgaAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAAt > 2:3916663/1‑150 (MQ=255) attgaAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAAt > 2:4457233/1‑150 (MQ=255) attgaAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGGTCAGCACTGACACAAATCTTTAAt < 2:1305943/150‑1 (MQ=255) attgaAATAGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAAt > 2:225222/1‑150 (MQ=255) aaTCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTccc > 1:4895720/1‑150 (MQ=255) aTCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCg > 1:1015530/1‑150 (MQ=255) aTCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCg > 1:1155348/1‑150 (MQ=255) cGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGtt < 1:3550732/150‑1 (MQ=255) gCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGttt < 2:4667309/150‑1 (MQ=255) cAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTg < 2:2708992/150‑1 (MQ=255) cAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTg < 2:4519977/150‑1 (MQ=255) cAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTg > 1:4922452/1‑150 (MQ=255) cAAAACGGTGAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTg < 2:2832299/150‑1 (MQ=255) aaaaCGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGa < 2:4768606/150‑1 (MQ=255) aaaaCGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGa > 2:4083569/1‑150 (MQ=255) aaCGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATc > 2:3699692/1‑150 (MQ=255) aCGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCt < 2:3063430/150‑1 (MQ=255) cGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCtt < 2:1949309/150‑1 (MQ=255) ggTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTc > 2:1312513/1‑150 (MQ=255) ggTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTc < 2:1737605/150‑1 (MQ=255) gCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAAt < 2:3800259/150‑1 (MQ=255) tGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATgg > 2:4200530/1‑150 (MQ=255) aaTTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGcc > 1:4037998/1‑150 (MQ=255) tGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCa < 2:5143641/150‑1 (MQ=255) ggCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAg < 2:4452954/150‑1 (MQ=255) ggCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAg > 1:1185661/1‑150 (MQ=255) gCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGa < 2:789818/150‑1 (MQ=255) cGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGac > 1:3268164/1‑150 (MQ=255) gggCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATNAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGacc > 1:2680649/1‑150 (MQ=255) gggCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGacc > 1:4274933/1‑150 (MQ=255) ggCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGacca > 2:3162687/1‑150 (MQ=255) aCATAAAGCAGACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTTTGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCTTAATGGCCATCAGACCACCATGAc < 1:4795727/150‑1 (MQ=255) tAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACAtt > 1:2959834/1‑150 (MQ=255) aaaGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTa > 2:2389779/1‑150 (MQ=255) gCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGc < 2:1576751/150‑1 (MQ=255) | CCGAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCAT > CP009273/2736569‑2736859 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |