Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,945,306 | C→G | 100% | G172A (GGC→GCC) | recD ← | exonuclease V (RecBCD complex), alpha chain |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,945,306 | 0 | C | G | 98.6% | 1090.2 / 4.8 | 283 | G172A (GGC→GCC) | recD | exonuclease V (RecBCD complex), alpha chain |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/1); new base G (132/146); total (135/148) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.52e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 292 total aligned reads displayed.
CGCAAAGCCTTGCCGAGAGATTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGCCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGCCAGTAGAGCTTCATCAACCTCAATGGCATGATTCACTTCGTTG > CP009273/2945159‑2945452 | cGCAAAGCCTTGCCGAGAGATTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGggcg > 2:2869491/1‑150 (MQ=255) aGCCTTGCCGAGAGATTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGa < 2:4232378/150‑1 (MQ=255) aGCCTTGCCGAGAGATTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGa > 1:2134666/1‑150 (MQ=255) cTTGCCGAGAGATTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAAt < 1:1968062/150‑1 (MQ=255) cTTGCCGAGAGATTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAAt > 1:3245648/1‑150 (MQ=255) cTTGCCGAGAGATTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAAt < 1:1874080/150‑1 (MQ=255) ttGCCGAGAGATTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATc < 1:2504827/150‑1 (MQ=255) tGCCGAGAGATTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCa < 2:1765306/150‑1 (MQ=255) gCCGAGAGATTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCAc < 1:3367030/150‑1 (MQ=255) cGAGAGATTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCg > 1:1449272/1‑150 (MQ=255) cGAGAGATTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCg > 1:5094185/1‑150 (MQ=255) gagagaGTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCga < 1:4676030/150‑1 (MQ=255) agagaTTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCgag > 1:4515034/1‑150 (MQ=255) aTTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATcc < 1:4378460/150‑1 (MQ=255) gtCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATccg < 1:4151570/149‑1 (MQ=255) tggTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATccgcc > 1:4442766/2‑150 (MQ=255) cGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATccgcc > 2:2304272/1‑150 (MQ=255) ggTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATccgccg < 1:3639939/150‑1 (MQ=255) aGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCa > 2:1280738/1‑150 (MQ=255) cgcgGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAgcgc < 1:3349648/150‑1 (MQ=255) gcgGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGcc > 2:3057847/1‑150 (MQ=255) cgGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCa > 1:2191423/1‑150 (MQ=255) cgGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCa > 1:3042477/1‑150 (MQ=255) gCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACt > 2:1043252/1‑150 (MQ=255) cAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGCCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTg > 2:3793855/1‑150 (MQ=255) aGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTgc > 1:1337905/1‑150 (MQ=255) gCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTgcc < 1:580685/150‑1 (MQ=255) gCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTgcc < 2:3874948/150‑1 (MQ=255) gCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTgcc < 1:1376352/150‑1 (MQ=255) gCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTgcc < 1:1594963/150‑1 (MQ=255) gCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGCCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTgcc > 2:2751175/1‑150 (MQ=255) cccGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCa > 1:847639/1‑150 (MQ=255) ccGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCaa < 1:4648451/150‑1 (MQ=255) cGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAAc < 2:1155991/150‑1 (MQ=255) gTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACt > 1:993610/1‑150 (MQ=255) ggTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACtttt < 1:4828995/150‑1 (MQ=255) ggTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACtttt > 1:4625117/1‑150 (MQ=255) gTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACttttt < 1:654080/150‑1 (MQ=255) cAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGcc < 2:319585/150‑1 (MQ=255) cAGCCAGACGGAGACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATGTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCGACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGcc < 2:4392127/150‑1 (MQ=255) gCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAg < 1:1262556/150‑1 (MQ=255) aGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTa > 1:4863510/1‑150 (MQ=255) gACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTaa < 1:3021473/150‑1 (MQ=255) aCGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAAt < 1:3666128/150‑1 (MQ=255) aCGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAAt < 1:2829119/150‑1 (MQ=255) cGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAAtt < 2:2149207/150‑1 (MQ=255) gATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTc < 2:1371767/150‑1 (MQ=255) aTACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCa > 1:3828299/1‑150 (MQ=255) 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tGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGCCAg > 2:4853477/1‑150 (MQ=255) ccAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGCCAGTa > 1:4283872/1‑150 (MQ=255) ccAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGCCAGTa < 1:2773294/150‑1 (MQ=255) aGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGCCAGTaga > 1:2411985/1‑150 (MQ=255) aGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGCCAGTaga > 1:3622838/1‑150 (MQ=255) gCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGCCAGTagag > 2:4108932/1‑150 (MQ=255) aaCTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGCCAGTAGAGCt > 2:3313660/1‑150 (MQ=255) ttCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGCCAGTAGAGCTtca < 1:1280322/150‑1 (MQ=255) cGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGCCAGTAGAGCTtcatc > 1:2567642/1‑150 (MQ=255) aCGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGAGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGCCAGTAGAGCTTCATCAAcc < 2:5069956/150‑1 (MQ=255) cGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGCCAGTAGAGCTTCATCAACCt < 2:196314/150‑1 (MQ=255) ggtggtCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGCCAGTAGAGCTTCATCAACCTc < 2:586945/150‑1 (MQ=255) ggtCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGCCAGTAGAGCTTCATCAACCTCAAt < 2:1228354/150‑1 (MQ=255) gTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGCCAGTAGAGCTTCATCAACCTCAATGGCa > 1:4334218/1‑150 (MQ=255) tACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGCCAGTAGAGCTTCATCAACCTCAATGGCATGAt > 2:1435515/1‑150 (MQ=255) aCCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGCCAGTAGAGCTTCATCAACCTCAATGGCATGAtt > 2:121959/1‑150 (MQ=255) aCCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGCCAGTAGAGCTTCATCAACCTCAATGGCATGAtt > 1:233980/1‑150 (MQ=255) ccGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGCCAGTAGAGCTTCATCAACCTCAATGGCATGATTc > 1:3553574/1‑150 (MQ=255) ccGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGCCAGTAGAGCTTCATCAACCTCAATGGCATGATTc > 2:2076800/1‑150 (MQ=255) cGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGCCAGTAGAGCTTCATCAACCTCAATGGCATGATTCa < 2:3672888/150‑1 (MQ=255) ggTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGCCAGTAGAGCTTCATCAACCTCAATGGCATGATTCAc > 2:3107687/1‑150 (MQ=255) aGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGCCAGTAGAGCTTCATCAACCTCAATGGCATGATTCACTTCGtt < 1:4974400/150‑1 (MQ=255) | CGCAAAGCCTTGCCGAGAGATTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGCCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGCCAGTAGAGCTTCATCAACCTCAATGGCATGATTCACTTCGTTG > CP009273/2945159‑2945452 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |