| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 3,000,265 | G→T | 10.4% | M215I (ATG→ATT) | ygeW → | putative carbamoyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,000,265 | 0 | G | T | 10.4% | 879.5 / 50.9 | 267 | M215I (ATG→ATT) | ygeW | putative carbamoyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (118/121); new base T (9/19); total (127/140) | |||||||||||
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Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
CCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCAAGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCA > CP009273/3000116‑3000412 | ccGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCAAGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCtgatg < 1:1297261/150‑1 (MQ=255)ccGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCAAGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCtgatg > 2:115965/1‑150 (MQ=255)ccGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCAAGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCtgatg > 1:330932/1‑150 (MQ=255) 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cTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGAc > 1:3802493/1‑150 (MQ=255) atgaCTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCa < 2:5100557/150‑1 (MQ=255) | CCGACTCAGTCAATGGCTGACCTCGCGTGGTTACGTGAACACTTTGGTTCACTGGAAAACCTGAAAGGTAAAAAAATCGCCATGACCTGGGCCTACTCTCCAAGCTATGGCAAACCGCTCTCTGTACCACAAGGCATCATCGGTCTGATGACTCGCTTCGGTATGGATGTCACCCTGGCCCATCCGGAAGGCTACGACCTGATCCCGGATGTGGTTGAAGTGGCGAAAAACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAAGACGCA > CP009273/3000116‑3000412 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |