Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 3,186,181 | G→C | 79.9% | W205C (TGG→TGC) | yqiJ → | DUF1449 family inner membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 3,186,181 | 0 | G | C | 79.9% | 590.3 / 153.3 | 214 | W205C (TGG→TGC) | yqiJ | DUF1449 family inner membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (18/25); new base C (95/76); total (113/101) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.25e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.18e-01 |
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
GCGAAGGAAAACTCACCGATCAATTTGGCCAAATACATTATTTACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGGCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTTTATTATTGGAATTATTTTCGCCAGGCTCTATCGTCGCG > CP009273/3186036‑3186328 | gCGAAGGAAAACTCACCGATCAATTTGGCCAAATACATTATTTACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCcccc > 2:164053/1‑150 (MQ=255) cgaacgaaCACTCACCGATCACTATGTCCAAATACATTATGCACGACGGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCa < 2:2949021/150‑1 (MQ=255) cGAAGGAAAACTCACCGATCAATTTGGCCAAATACATTATTTACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCa > 1:4797464/1‑150 (MQ=255) 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cTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTTTATTATTGGAATTATTTTCGCCAGGCTCTATCGTcgc > 2:4512718/1‑150 (MQ=255) cTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTTTATTATTGGAATTATTTTCGCCAGGCTCTATCGTcgc > 2:2166703/1‑150 (MQ=255) | GCGAAGGAAAACTCACCGATCAATTTGGCCAAATACATTATTTACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGGCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTTTATTATTGGAATTATTTTCGCCAGGCTCTATCGTCGCG > CP009273/3186036‑3186328 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |