| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 280,968 | G→T | 79.9% | intergenic (+89/‑138) | yagF → / → yagG | CP4‑6 prophage; dehydratase family protein/CP4‑6 prophage; putative sugar transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 280,968 | 0 | G | T | 79.9% | 383.4 / 121.7 | 209 | intergenic (+89/‑138) | yagF/yagG | CP4‑6 prophage; dehydratase family protein/CP4‑6 prophage; putative sugar transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (19/23); new base T (81/86); total (100/109) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.33e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |