Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 3,388,644 | 0 | T | A | 7.3% | 1058.9 / 49.8 | 338 | D325V (GAC→GTC) | yhdP | DUF3971‑AsmA2 domains protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (126/187); new base A (13/12); total (139/199) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.93e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 339 total aligned reads displayed.
GCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGTTTCGCGGCCAGCGGGCGTATGCCCTCCAGGCCTGCCAGCTCCAGATTACTGGCGCGAATCCGGAGTTCGTCACTGCGTTTATTGTCTTTGCCGCCAACGTCCTGTTCCGGTATCCAGGCCAGCGTCAATGCTCCGCTCGGCCAGGGTTTGCCGTCCATCGTGATCCGTGTATCGGGAATAGAGAACTGCCAGCCCGGATTTTCACGCGTAATATGCGCGGTCAGATTATCCACCGACAGCGTATGCGTT > CP009273/3388496‑3388793 | cGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGTTTCGCGGCCAGCGGGCGTATGCCCTCCAGGCCTGCCAGCTCCAGATTACTGGCGCGAATCCGGAGTTCGTCACTGCGTTTATTGTCTTTGCCGCCAACGTCCt > 2:3236012/1‑150 (MQ=255) gCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGTTTCGCGGCCAGCGGGCGTATGCCCTCCAGGCCTGCCAGCTCCAGATTACTGGCGCGAATCCGGAGTTCGTCACTGCGTTTATTGTCTTTGCCGCCAACGTCCTg > 2:367980/1‑150 (MQ=255) gCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGTTTCGCGGCCAGCGGGCGTATGCCCTCCAGGCCTGCCAGCTCCAGATTACTGGCGCGAATCCGGAGTTCGTCACTGCGTTTATTGTCTTTGCCGCCAACGTCCTg < 2:1511120/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |