| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,415,112 | C→A | 14.9% | G143G (GGC→GGA) | yhdY → | putative amino‑acid transporter subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,415,112 | 0 | C | A | 14.9% | 999.9 / 99.6 | 336 | G143G (GGC→GGA) | yhdY | putative amino‑acid transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (140/145); new base A (30/21); total (170/166) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.26e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 339 total aligned reads displayed.
CACGACCAACGCTGGCGAATTAACCTCGCATTACTGATTGGGCTTGTGTCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTAT > CP009273/3414963‑3415261 | gACCAACGCTGGCGAATTAACCTCGCATTACTGATTGGGCTTGTGTCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGt < 1:4190039/150‑1 (MQ=255) aCCAACGCTGGCGAATTAACCTCGCATTACTGATTGGGCTTGTGTCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGtt < 1:1323245/150‑1 (MQ=255) aCCAACGCTGGCGAATTAACCTCGCATTACTGATTGGGCTTGTGTCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGtt > 2:4672365/1‑150 (MQ=255) cAACGCTGGCGAATTAACCTCGCATTACTGATTGGGCTTGTGTCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGtttt > 1:2872319/1‑150 (MQ=255) gCTGGCGAATTAACCTCGCATTACTGATTGGGCTTGTGTCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTg < 2:83074/150‑1 (MQ=255) cTGGCGAATTAACCTCGCATTACTGATTGGGCTTGTGTCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGc > 1:1770205/1‑150 (MQ=255) ggCGAATTAACCTCGCATTACTGATTGGGCTTGTGTCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCAGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGctc > 1:4123017/1‑150 (MQ=255) cGAATTAACCTCGCATTACTGATTGGGCTTGTGTCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCtt < 2:206118/150‑1 (MQ=255) cGAATTAACCTCGCATTACTGATTGGGCTTGTGTCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCtt < 2:174310/150‑1 (MQ=255) aaTTAACCTCGCATTACTGATTGGGCTTGTGTCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGAGGTTTTTTTGCTCTTGa > 2:3087630/1‑150 (MQ=255) ttAACCTCGCATGACTGATTGGGCTTGTGTCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGAGGTTTTTTTGCTCTTGAGc < 2:5142055/150‑1 (MQ=255) ccTCGCATTACTGATTGGGCTTGTGTCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGAGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGt < 1:3374587/150‑1 (MQ=255) ccTCGCATTACTGATTGGGCTTGTGTCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGAGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGt < 2:1393877/150‑1 (MQ=255) cTCGCATTACTGATTGGGCTTGTGTCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGtt > 2:1185117/1‑150 (MQ=255) cTCGCATTACTGATTGGGCTTGTGTCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGtt > 1:1952876/1‑150 (MQ=255) gCATTACTGATTGGGCTTGTGTCGATCGCACCACTGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGaa < 2:2149486/150‑1 (MQ=255) gCATTACTGATTGGGCTTGTGTCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGaa < 1:422517/150‑1 (MQ=255) gCATTACTGATTGGGCTTGTGTCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGaa < 2:4123543/150‑1 (MQ=255) cATTACTGATTGGGCTTGTGTCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGaaa > 2:2890658/1‑150 (MQ=255) aTTACTGATTGGGCTTGTGTCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAAc > 2:435764/1‑150 (MQ=255) ttACTGATTGGGCTTGTGTCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGTGCGGTGATTTAACCACTGATTGTCTGGTGGCTTATGTATTGCGGTTTTTTTGATCTTTAGCGGGTTGAAAca > 1:116708/1‑149 (MQ=255) aCTGATTGGGCTTGTGTCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCg > 2:142346/1‑150 (MQ=255) tGGGCTTGTGTCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATg > 2:1981514/1‑150 (MQ=255) cTTGTGTCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGgggc > 2:3629159/1‑150 (MQ=255) ttGTGTCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGgggcg < 2:1072292/150‑1 (MQ=255) tgtgTCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGgggcgg < 1:3150513/150‑1 (MQ=255) tgtgTCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGAGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGgggcgg < 2:4775553/150‑1 (MQ=255) gtCGATCGCACCTATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCt < 2:3767966/150‑1 (MQ=255) gtCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCt < 2:2316229/150‑1 (MQ=255) gtCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGAGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCt < 1:3924460/150‑1 (MQ=255) tCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTg < 2:2582398/150‑1 (MQ=255) tCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGAGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTg > 1:2732774/1‑150 (MQ=255) gATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGAc > 1:3496431/1‑150 (MQ=255) gATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGAc > 2:1308724/1‑150 (MQ=255) cGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCt > 2:2963200/1‑150 (MQ=255) cACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTaa > 1:3626363/1‑150 (MQ=255) cAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTTCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACtt > 2:1882756/1‑150 (MQ=255) aaTGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACttt < 1:3145846/150‑1 (MQ=255) aaTGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACttt > 2:1927060/1‑150 (MQ=255) aTGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGAGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTa < 1:1075855/150‑1 (MQ=255) gTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAat > 2:3408927/1‑150 (MQ=255) cTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTCTATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGGTCTTGAGCGGGGTGAAACCCGGCAATTGGGCGGGCTGACGCTAAAGTTAattat > 2:482245/1‑150 (MQ=255) cTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAattat > 2:2792491/1‑150 (MQ=255) cTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAattat > 1:2767572/1‑150 (MQ=255) tGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAattatt < 1:3892642/150‑1 (MQ=255) tGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAattatt > 2:2212570/1‑150 (MQ=255) ggAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTCATTATTg > 2:1145649/1‑150 (MQ=255) aaTACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATc < 1:457478/150‑1 (MQ=255) aaTACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATc < 1:2359092/150‑1 (MQ=255) aaTACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGAGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATc > 2:1037812/1‑150 (MQ=255) tACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAg > 1:1428853/1‑150 (MQ=255) tCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTg > 1:3998255/1‑150 (MQ=255) ccGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTggg < 2:3134104/150‑1 (MQ=255) cATCGCGGTCGCTATAGTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTATTTTTTCTCTTTAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCTGGCTGACGATTACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGAtt < 1:4402259/150‑1 (MQ=255) aTCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTg > 1:3812214/1‑150 (MQ=255) gcgGTCGCTATAGTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCgg < 2:4585172/150‑1 (MQ=255) ggTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCgggg > 2:1611454/1‑150 (MQ=255) gTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCggggg < 1:2577103/150‑1 (MQ=255) gTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCggggg < 1:645186/150‑1 (MQ=255) gTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCggggg > 2:4251983/1‑150 (MQ=255) cTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCt > 1:4954599/1‑150 (MQ=255) cTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCt < 1:4907442/150‑1 (MQ=255) tataTTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATAGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCATGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCAAAAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTa > 1:4436185/1‑150 (MQ=255) tatTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGAGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTAcc > 1:2184386/1‑150 (MQ=255) ttGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTGGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGt < 1:4674929/150‑1 (MQ=255) cGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTAACGTggg > 1:149800/1‑150 (MQ=255) ggCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTgggg > 2:4564847/1‑150 (MQ=255) ggCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTgggg > 1:3013268/1‑150 (MQ=255) cTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGAt < 1:4795310/150‑1 (MQ=255) cTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGAGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGAt > 1:2065169/1‑150 (MQ=255) ggCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCtt < 1:3687527/150‑1 (MQ=255) cGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTAc < 1:785243/150‑1 (MQ=255) tGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTgg > 1:2811953/1‑150 (MQ=255) gATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGAGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTGGc < 1:506997/150‑1 (MQ=255) tACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTGGCGTTa < 1:2890679/150‑1 (MQ=255) tACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTGGCGTTa < 1:1035470/150‑1 (MQ=255) cccACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTGGCGTTAgg < 1:1872059/150‑1 (MQ=255) ccACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTTCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTGGCGTTAGGt > 1:2381861/1‑150 (MQ=255) tGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTGGCGTTAGGTcgcc < 2:2435989/150‑1 (MQ=255) tGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTGGCGTTAGGTcgcc < 2:4409634/150‑1 (MQ=255) tGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGAGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTGGCGTTAGGTcgcc < 1:3261397/150‑1 (MQ=255) gATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTGGCGTTAGGTcgccg < 2:488341/150‑1 (MQ=255) ttGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCt < 1:3279764/150‑1 (MQ=255) gTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTcc > 2:251835/1‑150 (MQ=255) gTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTcc < 2:3889826/150‑1 (MQ=255) gTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTcc < 2:2745299/150‑1 (MQ=255) tCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTccc < 1:1400011/150‑1 (MQ=255) tCTGGTGGCTGATGTATGGAGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTccc > 2:1710945/1‑150 (MQ=255) cTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTAGTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCa < 1:4558855/150‑1 (MQ=255) tggtggCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCat < 1:1568096/150‑1 (MQ=255) tggtggCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCat > 1:2108482/1‑150 (MQ=255) tggtggCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCat > 2:1531704/1‑150 (MQ=255) tggtggCTGATGTAGGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCat < 2:869162/150‑1 (MQ=255) tggCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAAACCGGCAATTGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATg > 1:3478077/1‑150 (MQ=255) ggCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGc > 2:1851469/1‑150 (MQ=255) gCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGcc > 1:4237198/1‑150 (MQ=255) tGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGa < 1:4313679/150‑1 (MQ=255) tGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGa < 1:560720/150‑1 (MQ=255) tGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGa < 2:2108482/150‑1 (MQ=255) gTATGGAGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATtgt < 1:2276462/150‑1 (MQ=255) | CACGACCAACGCTGGCGAATTAACCTCGCATTACTGATTGGGCTTGTGTCGATCGCACCAATGTTCTGGAAAATACTCCCGCATCGCGGTCGCTATATTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACCGTGGGGGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTAT > CP009273/3414963‑3415261 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |