| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,649,797 | C→A | 100% | E102* (GAA→TAA) | hdeA ← | stress response protein acid‑resistance protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,649,797 | 0 | C | A | 98.8% | 774.6 / ‑0.3 | 239 | E102* (GAA→TAA) | hdeA | stress response protein acid‑resistance protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/2); new base A (110/125); total (112/127) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.73e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
CATTTTGTAACCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAACCAACTG > CP009273/3649650‑3649943 | cATTTTGTAACCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGc < 1:579619/150‑1 (MQ=255)cATTTTGTAACCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGc < 2:3807245/150‑1 (MQ=255) ttttGTAACCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCt < 1:2634354/150‑1 (MQ=255) tttGTAACCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCtt < 1:2374026/150‑1 (MQ=255) tGTAACCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTa > 2:4425213/1‑150 (MQ=255) tAACCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAAc < 2:3315689/150‑1 (MQ=255) aaCCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCAGTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACt < 2:1044499/150‑1 (MQ=255) aCCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACtt > 1:3864973/1‑150 (MQ=255) cAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCttt < 2:2089135/150‑1 (MQ=255) cAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCttt < 1:4827728/150‑1 (MQ=255) agaTTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTgg < 1:4603517/150‑1 (MQ=255) gaTTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGc < 2:3577201/150‑1 (MQ=255) aTTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCt < 1:81728/150‑1 (MQ=255) aTTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCt < 1:1364612/150‑1 (MQ=255) ttATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCtt < 1:5088381/150‑1 (MQ=255) ttATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCtt < 2:1916758/150‑1 (MQ=255) tatataTGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTg < 2:565816/150‑1 (MQ=255) atatatGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGt > 2:2785433/1‑150 (MQ=255) atatGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGttt < 2:130903/150‑1 (MQ=255) atatGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGttt < 2:3380675/150‑1 (MQ=255) tatGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTa > 2:4854935/1‑150 (MQ=255) atGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTAt > 2:236096/1‑150 (MQ=255) aaCAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCt < 1:1022483/150‑1 (MQ=255) aggaggAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAg > 1:2724172/1‑150 (MQ=255) aggaggAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAg > 1:1292902/1‑150 (MQ=255) ggaggaATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGt > 2:2370779/1‑150 (MQ=255) aggaATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTAc > 2:759083/1‑150 (MQ=255) aggaATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTAc > 2:4684641/1‑150 (MQ=255) gaATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACaa < 2:5014132/150‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGc > 1:3811835/1‑150 (MQ=255) ctgctTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGa > 2:1732557/1‑150 (MQ=255) ctgctTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATATTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGa < 1:2121135/150‑1 (MQ=255) tgctTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGaa > 2:4647458/1‑150 (MQ=255) tgctTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGaa > 2:4209221/1‑150 (MQ=255) gctTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAAc < 2:1133523/150‑1 (MQ=255) gctTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAAc < 1:3487501/150‑1 (MQ=255) ttttAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGAATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGa < 1:1368819/150‑1 (MQ=255) tttAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGAt < 2:3041130/150‑1 (MQ=255) ttAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATa > 1:4444771/1‑150 (MQ=255) aaaGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGc < 2:3864973/150‑1 (MQ=255) aaaGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGc < 2:1936607/150‑1 (MQ=255) aagaTATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTggg > 2:5048217/1‑150 (MQ=255) tatTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTa > 2:4973619/1‑150 (MQ=255) ttCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACg < 1:784907/150‑1 (MQ=255) ttCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGAAGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACg > 1:322119/1‑150 (MQ=255) tCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTACTTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTCTCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACgg > 2:4674391/1‑150 (MQ=255) tCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACgg < 1:1743330/150‑1 (MQ=255) tCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACgg < 2:2690703/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGt < 1:4310718/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGt < 1:1464241/150‑1 (MQ=255) ggCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTg > 2:4279728/1‑150 (MQ=255) gTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATa > 1:2539579/1‑150 (MQ=255) tCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGATTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATAcc > 2:2513731/1‑150 (MQ=255) cAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATAccc > 1:4867891/1‑150 (MQ=255) cAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATAccc > 2:3697630/1‑150 (MQ=255) aaTATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCt > 2:1450419/1‑150 (MQ=255) atatGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTg < 1:3020766/150‑1 (MQ=255) cgCAAGGAACTCCGACGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAAc < 1:2682720/149‑1 (MQ=255) gCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACa < 1:497953/150‑1 (MQ=255) cAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACAt > 2:807599/1‑150 (MQ=255) cAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACAt > 1:3936182/1‑150 (MQ=255) cAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACAt < 1:3983217/150‑1 (MQ=255) cAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCACATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACAt > 2:4076898/1‑150 (MQ=255) aaGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATc > 1:1179672/1‑150 (MQ=255) aaGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATc > 2:627177/1‑150 (MQ=255) aGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGTAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCt < 1:3620651/150‑1 (MQ=255) aGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATca < 2:3645779/150‑2 (MQ=255) aGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCt < 1:2267455/150‑1 (MQ=255) aaGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTaaa < 1:4273028/150‑1 (MQ=255) aCGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCg < 2:2625989/150‑1 (MQ=255) cGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGc > 1:2937194/1‑150 (MQ=255) gATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCa < 2:3935392/150‑1 (MQ=255) gATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCa < 1:2229744/150‑1 (MQ=255) tAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCAtctt > 2:4955623/1‑150 (MQ=255) gCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTgg > 2:2267269/1‑150 (MQ=255) cATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGt < 2:5057042/150‑1 (MQ=255) aTTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTTCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGtt > 1:4658644/1‑150 (MQ=255) ttCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGttt < 1:3003543/150‑1 (MQ=255) ttCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGttt < 1:2078590/150‑1 (MQ=255) cccGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTAt > 1:3731863/1‑150 (MQ=255) ggAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCtt < 2:3135832/150‑1 (MQ=255) gAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCttt < 1:286111/150‑1 (MQ=255) aaTTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTttg > 1:3946686/1‑150 (MQ=255) ttACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTttgtt > 1:2417559/1‑150 (MQ=255) tACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTttgttg < 1:638652/150‑1 (MQ=255) tttcttAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAgcgc > 1:188730/1‑150 (MQ=255) ttcttAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCCTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCt < 1:4425213/150‑1 (MQ=255) cttAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTc < 1:860280/150‑1 (MQ=255) ttAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCa > 1:203281/1‑150 (MQ=255) ttAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCa < 2:2122482/150‑1 (MQ=255) ttAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTGTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCa > 1:4752028/1‑150 (MQ=255) tAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAg > 2:4366656/1‑150 (MQ=255) aaTTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGc > 2:2422997/1‑150 (MQ=255) aaTTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGc < 1:3716309/150‑1 (MQ=255) ttttGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCaa < 2:4738529/150‑1 (MQ=255) ttttGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCaa < 1:4530824/150‑1 (MQ=255) tttGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCaaa > 1:2393929/1‑150 (MQ=255) gTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAAcc > 2:3440331/1‑150 (MQ=255) cccATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAACCaa > 2:2142466/1‑150 (MQ=255) ccATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAACCAAc > 1:4913969/1‑150 (MQ=255) | CATTTTGTAACCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAACCAACTG > CP009273/3649650‑3649943 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |