New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 3613151 | NA (NA) | 4 (0.010) | 4/258 | NT | 100% | coding (600/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
? | CP009273 | 3613476 = | 0 (0.000) | coding (925/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
CCGGCAGCAGGCCATTTCCGGCGGGACGGAACCGTCCGCTTTTCCTGATACCCTGCCGGGTTACACCGAATATGGCCGGGACAACGGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCG > CP009273/3613328‑3613624 | aggtcaccggctggccgcactctggcaggcgctgccggaagaactccgcttaagtccgcatcgttatctggcgacaaacagtccgcaggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggaagcggatgaggtgctgcctg > 2:2518236‑M2/149‑149 (MQ=255) aggtcaccggctggccgcactctggcaggcgctgccggaagaactccgcttaagtccgcatcgttatctggcgacaaacagtccgcaggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggaagcggatgaggtgctgcctg > 2:2517571‑M2/149‑149 (MQ=255) aggtcaccggctggccgcactctggcaggcgctgccggaagaactccgcttaagtccgcatcgttatctggcgacaaacagtccgcaggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggaagcggatgaggtgctgcctg > 1:2276258‑M2/149‑149 (MQ=255) aggtcaccggctggccgcactctggcaggcgctgccggaagaactccgcttaagtccgcatcgttatctggcgacaaacagtccgcaggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggaagcggatgaggtgctgcctg > 1:3612766‑M2/149‑149 (MQ=255) gtcaccggctggccgcactctggcaggcgctgccggaagaactccgcttaagtccgcatcgttatctggcgacaaacagtccgcaggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggaagcggatgaggtgctgcctgcg > 1:4404395‑M2/147‑149 (MQ=255) gtcaccggctggccgcactctggcaggcgctgccggaagaactccgcttaagtccgcatcgttatctggcgacaaacagtccgcaggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggaagcggatgaggtgctgcctgcg > 1:4404356‑M2/147‑149 (MQ=255) gtcaccggctggccgcactctggcaggcgctgccggaagaactccgcttaagtccgcatcgttatctggcgacaaacagtccgcaggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggaagcggatgaggtgctgcctgcg > 1:4404247‑M2/147‑149 (MQ=255) tcaccggctggccgcactctggcaggcgctgccggaagaactccgcttaagtccgcatcgttatctggcgacacacagtccgcaggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggaagcggatgaggtgctgcctgcgc < 2:1076863‑M2/4‑1 (MQ=255) tcaccggctggccgcactctggcaggcgctgccggaagaactccgcttaagtccgcatcgttatctggcgacaaacagtccgcaggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggaagcggatgaggtgctgcctgcgc > 1:1810809‑M2/146‑149 (MQ=255) tcaccggctggccgcactctggcaggcgctgccggaagaactccgcttaagtccgcatcgttatctggcgacaaacagtccgcaggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggaagcggatgaggtgctgcctgcgc < 1:2649534‑M2/4‑1 (MQ=255) caccggctggccgcactctggcaggcgctgccggacgaactccgcttaagtccgcatcgttatctggcgacaaacagtccgcaggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggacgcggatgaggtgctgcctGcgcc > 1:2061086‑M2/145‑149 (MQ=255) caccggctggccgcactctggcaggcgctgccggaagaactccgcttaagtccgcatcgttatctggcgacaaacagtccgcaggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggaagcggatgaggtgctgcctGcgcc < 1:1379274‑M2/5‑1 (MQ=255) caccggctggccgcactctggcaggcgctgccggaagaactccgcttaagtccgcatcgttatctggcgacaaacagtccgcaggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggaagcggatgaggtgctgcctGcgcc > 1:904745‑M2/145‑149 (MQ=255) caccggctggccgcactctggcaggcgctgccggaagaactccgcttaagtccgcatcgttatctggcgacaaacagtccgcaggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggaagcggatgaggtgctgcctGcgcc < 1:4379775‑M2/5‑1 (MQ=255) caccggctggccgcactctggcaggcgctgccggaagaactccgcttaagtccgcatcgttatctggcgacaaacagtccgcaggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggaagcggatgaggtgctgcctGcgcc > 1:2192763‑M2/145‑149 (MQ=255) caccggctggccgcactctggcaggcgctgccggaagaactccgcttaagtccgcatcgttatctggcgacaaacagtccgcaggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggaagcggatgaggtgctgcctGcgcc > 1:3793528‑M2/145‑149 (MQ=255) caccggctggccgcactctggcaggcgctgccggaagaactccgcttaagtccgcatcgttatctggcgacaaacagtccgcaggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggaagcggatgaggtgctgcctGcgcc > 1:2269100‑M2/145‑149 (MQ=255) accggctggccgcactctggcaggcgctgccggaagaactccgcttaagtccgcatcgttatctggcgacaaacagtccgcaggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggaagcggatgaggtgctgcctGcgccg > 2:4987120‑M2/144‑149 (MQ=255) accggctggccgcactctggcaggcgctgccggaagaactccgcttaagtccgcatcgttatctggcgacaaacagtccgcaggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggaagcggatgaggtgctgcctGcgccg < 1:3955840‑M2/6‑1 (MQ=255) accggctggccgcactctggcaggcgctgccggaagaactccgcttaagtccgcatcgttatctggcgacaaacagtccgcaggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggaagcggatgaggtgctgcctGcgccg > 1:2646072‑M2/144‑149 (MQ=255) ccggctggccgcactctggcaggcgctgccggaagaactccgcttaagtccgcatcgttatctggcgacaaacagtccgcaggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggacgcggaggaggtgctgcctGcgccgc > 2:2009934‑M2/143‑149 (MQ=255) ccggctggccgcactctggcaggcgctgccggaagaactccgcttaagtccgcatcgttatctggcgacaaacagtccgcaggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggaagcggatgaggtgctgcctGcgccgc < 1:4213147‑M2/7‑1 (MQ=255) ccggctggccgcactctggcaggcgctgccggaagaactccgcttaagtccgcatcgttatctggcgacaaacagtccgcaggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggaagcggatgaggtgctgcctGcgccgc > 2:2317089‑M2/143‑149 (MQ=255) ccggctggccgcactctggcaggcgctgccggaagaactccgcttaagtccgcatcgttatctggcgacaaacagtccgcaggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggaagcggatgaggtgctgcctGcgccgc > 2:2009867‑M2/143‑149 (MQ=255) ccggctggccgcactctggcaggcgctgccggaagaactccgcttaagtccgcatcgttatctggcgacaaacagtccgcaggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggaagcggatgaggtgctgcctGcgccgc > 1:790187‑M2/143‑149 (MQ=255) ccggctggccgcactctggcaggcgctgccggaagaactccgcttaagtccgcatcgttatctggcgacaaacagtccgcaggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggaagcggatgaggtgctgcctGcgccgc < 1:4213952‑M2/7‑1 (MQ=255) cggctggccgcactctggcaggcgctgccggaagaactccgcttaagtccgcatcgttatctggcgacagacagtccgcaggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggaagcggatgaggtgctgcctGCGCCGCt < 2:4686576‑M2/8‑1 (MQ=255) ggctggccgcactctggcaggcgctgccggaagaactccgcttaagtccgcatcgttatctggcgacaaacagtccgcaggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggaagcggatgaggtgctgcctGCGCCGCTg < 2:591368‑M2/9‑1 (MQ=255) ggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggaagcggatgaggtgctgcctGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTAt > 2:1125106‑M2/62‑115 (MQ=255) ggggccgtggtggctgctcggttggtgtgagcgggtgccggaagcggatgaggtgctgcctGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTAt < 1:1125106‑M2/54‑1 (MQ=255) gggtgccggaagcggatgaggtgctgcctGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATAcc < 1:4104522‑M2/103‑1 (MQ=255) gggtgccggaagcggatgaggtgctgcctGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATAcc > 2:4104522‑M2/30‑132 (MQ=255) GCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATccg > 2:3810382‑M2/1‑149 (MQ=255) | CCGGCAGCAGGCCATTTCCGGCGGGACGGAACCGTCCGCTTTTCCTGATACCCTGCCGGGTTACACCGAATATGGCCGGGACAACGGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCG > CP009273/3613328‑3613624 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |