| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 101,236 | G→T | 6.8% | A256A (GCG→GCT) | ftsA → | ATP‑binding cell division protein involved in recruitment of FtsK to Z ring |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 101,236 | 0 | G | T | 6.8% | 1189.4 / 46.4 | 308 | A256A (GCG→GCT) | ftsA | ATP‑binding cell division protein involved in recruitment of FtsK to Z ring |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (126/161); new base T (15/6); total (141/167) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.15e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 310 total aligned reads displayed.
GCGTCGTCGATATCGGTGGTGGTACAATGGATATCGCCGTTTATACCGGTGGGGCATTGCGCCACACTAAGGTAATTCCTTATGCTGGCAATGTCGTGACCAGTGATATCGCTTACGCCTTTGGCACGCCGCCAAGCGACGCCGAAGCGATTAAAGTTCGCCACGGTTGTGCGCTGGGTTCCATCGTTGGAAAAGATGAGAGCGTGGAAGTGCCGAGCGTAGGTGGTCGTCCGCCACGGAGTCTGCAACGTCAGACACTGGCAGAGGTGATCGAGCCGCGCTATACCGAGCTGCTC > CP009273/101088‑101383 | gCGTCGTCGATATCGGTGGTGGTACAATGGATATCGCCGTTTATACCGGTGGGGCATTGCGCCACACTAAGGTAATTCCTTATGCTGGCAATGTCGTGACCAGTGATATCGCTTACGCCTTTGGCACGCCGCCAAGCGACGCCGAAGCg > 1:2513592/1‑149 (MQ=255) cgtcgtCGATATCGGTGGTGGTACAATGGATATCGCCGTTTATACCGGTGGGGCATTGCGCCACACTAAGGTAATTCCTTATGCTGGCAATGTCGTGACCAGTGATATCGCTTACGCCTTTGGCACGCCGCCAAGCGACGCCGAAGCGa < 1:4807597/149‑1 (MQ=255) gtcgtcGATATCGGTGGTGGTACAATGGATATCGCCGTTTATACCGGTGGGGCATTGCGCCACACTAAGGTAATTCCTTATGCTGGCAATGTCGTGACCAGTGATATCGCTTACGCCTTTGGCACGCCGCCAAGCGACGCCGAAGCGAt < 1:153184/149‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |