| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,216,183 | C→A | 7.7% | pseudogene (1127/2648 nt) | ycgH → | pseudogene; putative ATP‑binding component of a transport system |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,216,183 | 0 | C | A | 7.7% | 1190.7 / 52.0 | 313 | pseudogene (1127/2648 nt) | ycgH | pseudogene; putative ATP‑binding component of a transport system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (134/154); new base A (8/17); total (142/171) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.09e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 326 total aligned reads displayed.
AGTGTTGAACTTTCAAGTGCTTTGGATAGTATTGATGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAGACAGTATTATCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAA > CP009273/1216035‑1216331 | aGTGTTGAACTTTCAAGTGCTTTGGATAGTATTGATGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGActc > 1:1165403/1‑149 (MQ=255) gtgtTGAACTTTCAAGTGCTTTGGATAGTATTGATGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGActct < 2:2805177/149‑1 (MQ=255) ttGAACTTTCAAGTGCTTTGGATAGTATTGATGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTAtt < 2:436330/149‑1 (MQ=255) gAACTTTCAAGTGCTTTGGATAGTATTGATGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCt < 2:760624/149‑1 (MQ=255) aaCTTTCAAGTGCTTTGGATAGTATTGATGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTa < 1:1010983/149‑1 (MQ=255) tttCAAGTGCTTTGGATAGTATTGATGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAAt > 1:4888009/1‑149 (MQ=255) tttCAAGTGCTTTGGATAGCATTGATGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAAt > 2:1650052/1‑149 (MQ=255) tttAAAGTGCTTTGTATAGTATTGATGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATACTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTATATTCTAAAt < 2:3258569/149‑1 (MQ=255) ttCAAGTGCTTTGGATAGTATTGATGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATg > 2:579521/1‑149 (MQ=255) tCAAGTGCTTTGGATAGTATTGATGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATgg < 2:4848068/149‑1 (MQ=255) aGTGCTTTGGATAGTATTGATGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGc < 1:1976213/149‑1 (MQ=255) tGCTTTGGATAGTATTGATGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTATATTCTAAATGGAGCGa < 1:1183942/149‑1 (MQ=255) tGCTTTGGATAGTATTGATGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTATATTCTAAATGGAGCGa < 1:3444615/149‑1 (MQ=255) gCTTTGGATAGTATTGATGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGAc < 2:2469062/149‑1 (MQ=255) gCTTTGGATAGTATTGATGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGAc < 2:3575383/149‑1 (MQ=255) cTTTGGATAGTATTGATGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACt < 1:4016215/149‑1 (MQ=255) ttGGATAGTATTGATGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTaa < 1:4511726/149‑1 (MQ=255) gATAGTATTGATGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTATATTCTAAATGGAGCGACTAAACt < 2:472156/149‑1 (MQ=255) aTAGTATTGATGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTc < 2:1287029/149‑1 (MQ=255) tAGTATTGATGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCg > 1:2123806/1‑149 (MQ=255) gTATTGATGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTc > 2:217841/1‑149 (MQ=255) tATTGATGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCa < 1:697513/149‑1 (MQ=255) aTTGATGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAg > 2:4333223/1‑149 (MQ=255) aTTGATGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAg > 1:4353080/1‑149 (MQ=255) ttAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGcaca > 1:646661/1‑149 (MQ=255) tAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACaa > 1:369362/1‑149 (MQ=255) aaCAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAAc < 1:1826310/149‑1 (MQ=255) cAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCa > 1:2308438/1‑149 (MQ=255) aaaaCTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCAc < 2:3037194/149‑1 (MQ=255) aaaCTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACg > 1:1044848/1‑149 (MQ=255) aCAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGaa < 1:295680/149‑1 (MQ=255) aCGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCt < 1:454133/149‑1 (MQ=255) aCGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCt > 2:3110834/1‑149 (MQ=255) aCGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCt < 2:1910371/149‑1 (MQ=255) gTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGa > 2:407034/1‑149 (MQ=255) aGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGaaaa < 2:2658449/149‑1 (MQ=255) tATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATa < 2:2497100/149‑1 (MQ=255) tATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATa > 2:3485917/1‑149 (MQ=255) tCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACa > 1:4581514/1‑149 (MQ=255) ccTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACaa < 1:3404103/149‑1 (MQ=255) ccTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTATATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACaa > 2:4405241/1‑149 (MQ=255) cTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAAt > 2:45047/1‑149 (MQ=255) ttAATCGTAGTATTATCACACCTGGTAATATTGTTCTTGTTTTTAATACTGTTGGTGACTTTAACATAATTTCGTCCGAATATATTCTAATTGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGaaaataaaata < 2:942082/149‑2 (MQ=255) ttAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATc < 1:1139601/149‑1 (MQ=255) ttAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATc < 1:3886355/149‑1 (MQ=255) aaTCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTg < 1:2189044/149‑1 (MQ=255) tCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGa > 2:364649/1‑149 (MQ=255) cGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGaa < 2:4646862/149‑1 (MQ=255) attatCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGaa > 2:4956387/1‑149 (MQ=255) attatCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGaa > 1:2446734/1‑149 (MQ=255) ttatCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGaaa < 1:2868896/149‑1 (MQ=255) tatCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAg < 1:2661536/149‑1 (MQ=255) atCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGa < 1:1463692/149‑1 (MQ=255) cacCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGAc > 1:800716/1‑149 (MQ=255) cacCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGAc < 1:499829/149‑1 (MQ=255) acCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTATATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACt < 2:2936601/149‑1 (MQ=255) ccTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTc < 2:141712/149‑1 (MQ=255) cTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTcc > 2:1529708/1‑149 (MQ=255) ggTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCgt > 2:383767/1‑149 (MQ=255) taataaTGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCgttg > 1:2597020/1‑149 (MQ=255) aataatGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCgttgt < 1:409187/149‑1 (MQ=255) aatGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTAc > 2:1145884/1‑149 (MQ=255) atGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTAcc < 1:2490192/149‑1 (MQ=255) tGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTAccc > 1:2766649/1‑149 (MQ=255) gTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCa < 2:2066872/149‑1 (MQ=255) ggTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGa < 2:2710504/149‑1 (MQ=255) ttAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACt < 1:1347785/149‑1 (MQ=255) ataataCTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAAt > 2:58602/1‑149 (MQ=255) ataataCTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAAt < 2:2888455/149‑1 (MQ=255) ataataCTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAAt < 2:4167772/149‑1 (MQ=255) ataataCTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGAATCTATTCTAAATGGAGCTACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAAt < 2:2336791/149‑1 (MQ=255) aataCTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTc > 1:3258652/1‑149 (MQ=255) ataCTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCa < 1:4921746/149‑1 (MQ=255) taCTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAg > 2:1011198/1‑149 (MQ=255) cTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAGAc < 2:1315326/149‑1 (MQ=255) ggAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAGACAg > 2:1091994/1‑149 (MQ=255) gAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAGACAGt < 1:601760/149‑1 (MQ=255) aGGTGTCTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAGACAGta < 2:103260/149‑1 (MQ=255) gTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAGACAGtatt > 2:3447538/1‑149 (MQ=255) gTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAGACAGtatt < 1:293687/149‑1 (MQ=255) gTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAGACAGtatt > 2:430969/1‑149 (MQ=255) caCTAAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAGACAGtattat < 2:4476785/148‑1 (MQ=255) aCTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAGACAGTATTATc < 2:2738184/149‑1 (MQ=255) cTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAGACAGTATTATCa > 2:2355429/1‑149 (MQ=255) aaCATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAGACAGTATTATCAATCt < 1:3045666/149‑1 (MQ=255) cATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAGACAGTATTATCAATCttt > 1:279032/1‑149 (MQ=255) cATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAGACAGTATTATCAATCttt < 2:1505260/149‑1 (MQ=255) cATAATTTCGTCCGACTATATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAGACAGTATTATCAATCttt < 1:424110/149‑1 (MQ=255) aTAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAGACAGTATTATCAATCTTTc < 1:2318541/149‑1 (MQ=255) aTAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAGACAGTATTATCAATCTTTc < 1:465931/149‑1 (MQ=255) tAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAGACAGTATTATCAATCTTTCg > 1:1719251/1‑149 (MQ=255) aaTTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAGACAGTATTATCAATCTTTCGt < 2:1835831/149‑1 (MQ=255) tCGTCCGACTCTATTCTAACTGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAGACAGTATTATCAATCTTTCGTatga < 2:3338155/149‑1 (MQ=255) tCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAGACAGTATTATCAATCTTTCGTatga > 1:5165327/1‑149 (MQ=255) tCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAGACAGTATTATCAATCTTTCGTatga < 2:5055474/149‑1 (MQ=255) cGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAGACAGTATTATCAATCTTTCGTatgat < 2:855588/149‑1 (MQ=255) gACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAGACAGTATTATCAATCTTTCGTATGATGATgg > 1:5129204/1‑149 (MQ=255) gACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAGACAGTATTATCAATCTTTCGTATGATGATgg < 2:1709336/149‑1 (MQ=255) aCTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAGACAGTATTATCAATCTTTCGTATGATGATGGt < 2:1165403/149‑1 (MQ=255) tctATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAGACAGTATTATCAATCTTTCGTATGATGATGGTCa > 2:4887912/1‑149 (MQ=255) | AGTGTTGAACTTTCAAGTGCTTTGGATAGTATTGATGTTAACAAAACTACAACGGATGTAAGTATCCTTAATCGAAGTATTATCACACCTGGTAATAATGTTCTGGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAGACAGTATTATCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAA > CP009273/1216035‑1216331 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |