| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,402,363 | G→A | 6.7% | M19I (ATG→ATA) | ydaN → | putative Zn(II) transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,402,363 | 0 | G | A | 6.7% | 1006.0 / 40.2 | 283 | M19I (ATG→ATA) | ydaN | putative Zn(II) transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (135/129); new base A (7/12); total (142/141) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.46e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 | |||||||||||
Only 100 of 319 total aligned reads displayed.
ATTAATCATTTCAGGGTAATGGGGTGATGAGATGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGCCCAATGGCTGGCGACAACACCGCTGCTTCCCAATAACGTACGTGAT > CP009273/1402215‑1402510 | attaATCATTTCAGGGTAATGGGGTGATGAGATGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCctggatg > 1:1782750/1‑149 (MQ=255) ttaATCATTTCAGGGTAATGGGGTGATGAGATGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCctggatgc < 2:4887962/149‑1 (MQ=255) ttaATCATTTCAGGGTAATGGGGTGATGAGATGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCctggatgc < 2:3476426/149‑1 (MQ=255) ttaATCATTTCAGGGTAATGGGGTGATGAGATGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCctggatgc > 1:2094884/1‑149 (MQ=255) taATCATTTCAGGGTAATGGGGTGATGAGATGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCctggatgct > 2:2974456/1‑149 (MQ=255) aTTTCAGGGTAATGGGGTGATGAGATGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCctggatgctggatg > 1:3925645/1‑149 (MQ=255) tttCAGGGTAATGGGGTGATGAGATGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATgg < 1:4126117/149‑1 (MQ=255) tttCAGGGTAATGGGGTGATGAGATGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATgg > 2:1713363/1‑149 (MQ=255) tttCAGGGTAATGGGGTGATGAGATGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATgg > 1:2208601/1‑149 (MQ=255) cAGGGTAATGGGGTGATGAGATGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTag > 1:2309744/1‑149 (MQ=255) aGGGTAATGGGGTGATGAGATGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTaga > 1:3624831/1‑149 (MQ=255) aGGGTAATGGGGTGATGAGATGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTaga > 2:1178118/1‑149 (MQ=255) gTAATGGGGTGATGAGATGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAggc < 2:4298395/149‑1 (MQ=255) aaTGGGGTGATGAGATGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAggcgg < 1:4490875/149‑1 (MQ=255) gggTGATGAGATGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGtt < 1:967342/149‑1 (MQ=255) gggTGATGAGATGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGtt < 2:2071574/149‑1 (MQ=255) ggTGATGAGATGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTa < 1:4539205/149‑1 (MQ=255) ggTGATGAGATGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTa > 1:1181360/1‑149 (MQ=255) tgatgaGATGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTaaa < 1:2303680/149‑1 (MQ=255) gatgaGATGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAAc < 2:4652897/149‑1 (MQ=255) gatgaGATGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAAc < 1:2793237/149‑1 (MQ=255) atgaGATGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAAcc < 1:4877600/149‑1 (MQ=255) atgaGATGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAAcc > 1:131467/1‑149 (MQ=255) gagaTGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGc > 2:5079832/1‑149 (MQ=255) gagaTGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGc < 1:451587/149‑1 (MQ=255) gagaTGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGc < 1:4396938/149‑1 (MQ=255) gagaTGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGc < 2:2463251/149‑1 (MQ=255) gagaTGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGc > 2:799717/1‑149 (MQ=255) gagaTGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGc < 1:2390637/149‑1 (MQ=255) agaTGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCt < 2:4701526/149‑1 (MQ=255) agaTGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCt > 2:3851640/1‑149 (MQ=255) gaTGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTg > 1:3090022/1‑149 (MQ=255) gaTGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTg < 1:3974299/149‑1 (MQ=255) aaCAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAg > 2:4598092/1‑149 (MQ=255) cAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGAt < 1:1675530/149‑1 (MQ=255) gggCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGAtgt > 2:4775840/1‑149 (MQ=255) gCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGtga < 1:2423388/149‑1 (MQ=255) ccAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCTTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGtgat < 2:2109877/149‑1 (MQ=255) ccAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGtgat < 1:4016126/149‑1 (MQ=255) ccAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGtgat < 1:4788528/149‑1 (MQ=255) cAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGtgatt < 2:4049807/149‑1 (MQ=255) cAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGtgatt > 1:592326/1‑149 (MQ=255) gAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGtgattta > 2:4676274/1‑147 (MQ=255) gAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGtgattga > 2:2884693/1‑149 (MQ=255) gAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGtgattga < 2:1536351/149‑1 (MQ=255) gAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGtgattga > 2:535795/1‑149 (MQ=255) gAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGtgattga > 1:3233702/1‑149 (MQ=255) aGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATtgatg > 2:2228407/1‑149 (MQ=255) tAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAgc > 2:4139081/1‑149 (MQ=255) gACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAgcgc > 2:3772697/1‑149 (MQ=255) gACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATACTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAgcgc > 2:1448290/1‑149 (MQ=255) aCTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCa < 2:3537621/149‑1 (MQ=255) tACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATc < 2:3722013/149‑1 (MQ=255) tACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATc < 1:2477946/149‑1 (MQ=255) cAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATccc < 2:2309744/149‑1 (MQ=255) cAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATccc < 1:329064/149‑1 (MQ=255) aatGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATTGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATACTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTgg < 2:3402125/149‑1 (MQ=255) tGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCt < 2:1598026/149‑1 (MQ=255) ttGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCAc > 1:1613677/1‑149 (MQ=255) ttGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATACTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCAc > 2:856529/1‑149 (MQ=255) tgGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAAtt < 1:46767/149‑1 (MQ=255) ggAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTa < 1:1145785/149‑1 (MQ=255) gAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTAt > 1:3565614/1‑149 (MQ=255) aCTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTaca > 1:1005994/1‑149 (MQ=255) aCTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTaca > 2:1810723/1‑149 (MQ=255) gAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATACTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGa < 2:3666775/149‑1 (MQ=255) aGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATACTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATa < 1:4963610/149‑1 (MQ=255) gCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATACTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAg > 2:2837544/1‑149 (MQ=255) cGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAgc < 2:4963915/149‑1 (MQ=255) gATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAgcg > 1:4625976/1‑149 (MQ=255) aTTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAgcgc < 2:786105/149‑1 (MQ=255) ttAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGcc < 1:3739467/149‑1 (MQ=255) tAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGccc < 1:2832278/149‑1 (MQ=255) aGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGCCCaa < 1:2228568/149‑1 (MQ=255) aGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGCCCaa < 2:3240699/149‑1 (MQ=255) gggATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGCCCAAt > 2:3036250/1‑149 (MQ=255) gggATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGCCCAAt < 1:2659109/149‑1 (MQ=255) ggATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGCCCAAtg > 2:331532/1‑149 (MQ=255) cGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGCCCAAtggctg > 2:1271470/1‑149 (MQ=255) ggACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGCCCAAtggctgg < 1:146773/149‑1 (MQ=255) gACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGCCCAAtggctggc > 2:1684236/1‑149 (MQ=255) cGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGCCCAATGGCTGGCGa > 2:4209964/1‑149 (MQ=255) cGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATACTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGCCCAATGGCTGGCGa < 1:295609/149‑1 (MQ=255) tCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGCCCAATGGCTGGCGACAACACCg > 1:825427/1‑149 (MQ=255) ccGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGCCCAATGGCTGGCGACAACACCgct > 1:1935988/1‑149 (MQ=255) ggATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGCCCAATGGCTGGCGACAACACCgctgc < 2:707619/149‑1 (MQ=255) gATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGCCCAATGGCTGGCGACAACACCgctgct > 2:3925944/1‑149 (MQ=255) gATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGCCCAATGGCTGGCGACAACACCgctgct < 2:3368555/149‑1 (MQ=255) gCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGCCCAATGGCTGGCGACAACACCGCTGCTTcc > 2:2173877/1‑149 (MQ=255) gCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGCCCAATGGCTGGCGACAACACCGCTGCGTcc < 2:2529767/149‑1 (MQ=255) gTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGCCCAATGGCTGGCGACAACACCGCTGCTTCCCaa > 1:1032798/1‑149 (MQ=255) tATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCCCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAAATATGTACACCATGATAGCGCCCAAAGGCTGGCGACAACACCGCTGCTTCCCaaa > 2:5135449/1‑148 (MQ=255) aTTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGCCCAATGGCTGGCGACAACACCGCTGCTTCCCAATa < 1:4218521/149‑1 (MQ=255) tGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGCCCAATGGCTGGCGACAACACCGCTGCTTCCCAATAacg < 1:5155050/149‑1 (MQ=255) gCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGCCCAATGGCTGGCGACAACACCGCTGCTTCCCAATAacgt > 1:2204050/1‑149 (MQ=255) ctggatgctggatgGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGCCCAATGGCTGGCGACAACACCGCTGCTTCCCAATAacgtac > 2:2693647/1‑149 (MQ=255) ctggatgctggatgGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGCCCAATGGCTGGCGACAACACCGCTGCTTCCCAATAacgtac > 2:929852/1‑149 (MQ=255) tggatgctggatgGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGCCCAATGGCTGGCGACAACACCGCTGCTTCCCAATAacgtacg < 1:1740049/149‑1 (MQ=255) atgctggatgGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGCCCAATGGCTGGCGACAACACCGCTGCTTCCCAATAACGTACGTGa > 1:4908675/1‑149 (MQ=255) atgctggatgGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGCCCAATGGCTGGCGACAACACCGCTGCTTCCCAATAACGTACGTGa < 1:1721078/149‑1 (MQ=255) | ATTAATCATTTCAGGGTAATGGGGTGATGAGATGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCTAGACTACAAAATAATGCGTTGATGATGGAGGCACTGTGGAAGCGATTAAGGGATCGGACGTTAATGTCCCGGATGCAGTATTTGCCTGGATGCTGGATGGTAGAGGCGGCGTTAAACCGCTGGAAAATACAGATGTGATTGATGAAGCGCATCCCTGTTGGCTCCACCTTAATTATGTACACCATGATAGCGCCCAATGGCTGGCGACAACACCGCTGCTTCCCAATAACGTACGTGAT > CP009273/1402215‑1402510 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |