| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,521,805 | C→T | 5.1% | intergenic (+396/‑354) | yncH → / → rhsE | IPR020099 family protein/pseudogene, Rhs family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,521,805 | 0 | C | T | 5.1% | 1139.5 / 30.7 | 312 | intergenic (+396/‑354) | yncH/rhsE | IPR020099 family protein/pseudogene, Rhs family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (147/148); new base T (5/11); total (153/159) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.00e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.29e-01 | |||||||||||
Only 100 of 317 total aligned reads displayed.
TGAAGCAAGATCATCCGGCACCAGGTGGTGGTGCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAATATTG > CP009273/1521657‑1521953 | gAAGCAAGATCATCCGGCACCAGGTGGTGGTGCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCt < 1:1721141/149‑1 (MQ=255) aGCAAGATCATCCGGCACCAGGTGGTGGTGCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAg > 1:4895780/1‑149 (MQ=255) aaGATCATCCGGCACCAGGTGGTGGTGCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAgtgt > 1:1119526/1‑149 (MQ=255) aGATCATCCGGCACCAGGTGGTGGTGCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGTTAGTGtt > 1:2941102/1‑149 (MQ=255) aGATCATCCGGCACCAGGTGGTGGTGCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGtt < 1:3913891/149‑1 (MQ=255) aGATCATCCGGCACCAGGTGGTGGTGCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGtt > 1:5155895/1‑149 (MQ=255) atcatcCGGCACCAGGTGGTGGTGCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTa > 1:4176432/1‑149 (MQ=255) catcCGGCACCAGGTGGTGGTGCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAac < 1:702280/149‑1 (MQ=255) ccGGCACCAGGTGGTGGTGCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAacgac > 1:4445707/1‑149 (MQ=255) ggCACCAGGTGGTGGTGCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGt > 1:1592917/1‑149 (MQ=255) aCCAGGTGGTGGTGCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTaa < 2:6852/149‑1 (MQ=255) ccAGGTGGTGGTGCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAg < 1:3743522/149‑1 (MQ=255) ccAGGTGGTGGTGCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAg < 1:4960611/149‑1 (MQ=255) ccAGGTGGTGGTGCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAg < 1:891549/149‑1 (MQ=255) cAGGTGGTGGTGCAGTGCTTTGGTAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTTTGCTTTTTGCTTTTTATCTTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTACTTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGa < 1:746652/149‑1 (MQ=255) aGGTGGTGGTGCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGTTAGTGTTTAACGACGTTAAGAt < 1:3676394/149‑1 (MQ=255) aGGTGGTGGTGCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGAt < 2:4670848/149‑1 (MQ=255) tggtggtgCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTAAGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGc < 2:1129657/149‑1 (MQ=255) ggtggtgCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCa > 1:2550487/1‑149 (MQ=255) ggtggtgCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCa < 1:340152/149‑1 (MQ=255) gtggtgCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCaa < 1:4595631/149‑1 (MQ=255) tggtgCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAAt > 2:2647068/1‑149 (MQ=255) gCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGATGTCATTATTATCTATGCTATTTGCTTATTAAATTCATCAGGAGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAAACACGTTAAGATGGAAATGTGc > 2:4806494/1‑149 (MQ=255) aGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAg > 1:2113180/1‑149 (MQ=255) cTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCa < 1:1402640/149‑1 (MQ=255) aaaTGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTAAGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGTTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTAt < 2:5137941/149‑1 (MQ=255) ccccTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTg > 2:741168/1‑149 (MQ=255) ccccTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTg > 2:634465/1‑149 (MQ=255) cccTCGGGTTATTTGTAATTATTTTCTATGATATTTTATTATTATATTCATCAGGTTAATTTAATAAATTCCTAATTTTAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTgg < 2:3041470/149‑1 (MQ=255) cccTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTgg > 2:3802134/1‑149 (MQ=255) gggggAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCgg > 1:795200/1‑149 (MQ=255) gggggAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCgg > 2:5025294/1‑149 (MQ=255) gggggAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCgg < 1:4756011/149‑1 (MQ=255) ttGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGta > 2:2815267/1‑149 (MQ=255) attattTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTc > 2:2397382/1‑149 (MQ=255) attattTTCTATGCTATTTGCTTATTATAGTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGT‑GGGCGGTAGCGTATATTcc < 2:288892/149‑1 (MQ=255) ttattTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTcc > 2:4481141/1‑149 (MQ=255) ttattTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTcc > 1:1349588/1‑149 (MQ=255) tattTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCt < 2:1317253/149‑1 (MQ=255) tttCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTtat < 2:227572/149‑1 (MQ=255) tCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATAc < 2:4222081/149‑1 (MQ=255) tCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATAc < 1:1183898/149‑1 (MQ=255) aTGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACaaa < 2:2672000/149‑1 (MQ=255) cTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACca > 1:862797/1‑149 (MQ=255) tATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACcat > 1:3777765/1‑149 (MQ=255) aTTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACcatc > 1:1296469/1‑149 (MQ=255) tttGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGTTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACcatca < 2:4961949/149‑1 (MQ=255) tttGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACcatca > 1:2607361/1‑149 (MQ=255) gCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCAtcattc > 1:936911/1‑149 (MQ=255) ttattaTATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCAtcattcat > 1:1100666/1‑149 (MQ=255) tattatATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATcattcatt < 2:2596214/149‑1 (MQ=255) tattatATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATcattcatt < 2:446323/149‑1 (MQ=255) attatATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCAttt < 2:3759466/149‑1 (MQ=255) atatTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCaa > 2:43413/1‑149 (MQ=255) atatTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCaa < 1:668794/149‑1 (MQ=255) atTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATg < 1:2697327/149‑1 (MQ=255) tcatcaGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGAt < 1:2016450/149‑1 (MQ=255) atcaGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTg < 1:1469213/149‑1 (MQ=255) tcaGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGt > 1:1041263/1‑149 (MQ=255) tcaGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGt < 2:1778976/149‑1 (MQ=255) ggTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTAt < 2:331913/149‑1 (MQ=255) gTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTAtt < 1:600871/149‑1 (MQ=255) gTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTAtt < 1:4539495/149‑1 (MQ=255) gTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTAtt < 1:4510183/149‑1 (MQ=255) tGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTg > 2:16310/1‑149 (MQ=255) tttAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAatt < 2:4712725/149‑1 (MQ=255) tttAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAatt < 1:4126824/149‑1 (MQ=255) taataaATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAattat < 1:184800/149‑1 (MQ=255) taataaATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAattat < 1:4323299/149‑1 (MQ=255) ataaATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAAttattt > 1:3186818/1‑149 (MQ=255) taaATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAAttattta > 1:2950627/1‑149 (MQ=255) aaaTTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAAttatttat > 2:1543424/1‑149 (MQ=255) aaaTTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGAAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAAttagttat > 2:4069233/1‑149 (MQ=255) ccTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTAttgttg < 1:2088357/149‑1 (MQ=255) cTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATtgttgt < 1:1461550/149‑1 (MQ=255) tAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTtgtg > 2:4530944/1‑149 (MQ=255) aaTTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGa > 2:45605/1‑149 (MQ=255) aTTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGaa > 1:2244075/1‑149 (MQ=255) aTTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGaa < 2:3099850/149‑1 (MQ=255) tttGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAAt > 1:1762318/1‑149 (MQ=255) atCCACTATTAAGTTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGAc > 2:400189/1‑149 (MQ=255) tCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACa > 2:3397757/1‑149 (MQ=255) tCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACa > 1:4580815/1‑149 (MQ=255) cACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACAtt > 1:1024467/1‑149 (MQ=255) cACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACAtt > 2:1377372/1‑149 (MQ=255) cACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACAtt < 2:2133212/149‑1 (MQ=255) aCTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTa < 1:1488495/149‑1 (MQ=255) cTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTAt > 1:3024664/1‑149 (MQ=255) cTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTAt > 1:2478748/1‑149 (MQ=255) cTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTAt > 1:4291269/1‑149 (MQ=255) cTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCAGGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGAATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTAt > 1:5080275/1‑149 (MQ=255) aTTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGa > 1:3375431/1‑149 (MQ=255) ttAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGaa > 2:2534426/1‑149 (MQ=255) aaGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAata > 2:4897511/1‑149 (MQ=255) aaGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAata > 2:3505743/1‑149 (MQ=255) aaGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAata > 2:2299371/1‑149 (MQ=255) aGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAatat < 2:792821/149‑1 (MQ=255) gCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAATAtt > 2:4975737/1‑149 (MQ=255) gCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAATAtt < 2:2091194/149‑1 (MQ=255) cTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGTGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAATATTg < 2:3669829/149‑1 (MQ=255) | TGAAGCAAGATCATCCGGCACCAGGTGGTGGTGCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTTCAATGATTGTTATTGAATTATTTATTGTTGTGAATAAAAAGACATTATGAATATTG > CP009273/1521657‑1521953 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |