| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,582,413 | G→T | 6.1% | N47K (AAC→AAA) | ydeR ← | putative fimbrial‑like adhesin protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,582,413 | 0 | G | T | 6.1% | 1218.1 / 41.2 | 312 | N47K (AAC→AAA) | ydeR | putative fimbrial‑like adhesin protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (122/171); new base T (8/11); total (130/182) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 | |||||||||||
Only 100 of 312 total aligned reads displayed.
ACCCGTATTGTCAGTTGAACCTGTCACGATTGCCGTCACTGCACTTGTTTCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGAC > CP009273/1582266‑1582560 | aCCCGTATTGTCAGTTGAACCTGTCACGATTGCCGTCACTGCACTTGTTTCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGt < 2:2618926/149‑1 (MQ=255) cccGTATTGTCAGTTGAACCTGTCACGATTGCCGTCACTGCACTTGTTTCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGtt > 1:2993087/1‑149 (MQ=255) ttGTCAGTTGAACCTGTCACTATTGCCGTCACTGCACTTGTTTCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGcttc < 1:4501436/149‑1 (MQ=255) tGTCAGTTGAACCTGTCACGATTGCCGTCACTGCACTTGTTTCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACTTTAGcttct < 1:74420/149‑1 (MQ=255) aGTTGAACCTGTCACGATTGCCGTCACTGCACTTGTTTCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTgg < 1:378082/149‑1 (MQ=255) ttGAACCTGTCACGATTGCCGTCACTGCACTTGTTTCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGtt < 1:617047/149‑1 (MQ=255) tGAACCTGTCACGATTGCCGTCACTGCACTTGTTTCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACTTTAGCTTCTTTGGttt < 2:2929560/149‑1 (MQ=255) tGAACCTGTCACGATTGCCGTCACTGCACTTGTTTCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGttt > 2:4253017/1‑149 (MQ=255) aaCCTGTCACGATTGCCGTCACTGCACTTGTTTCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGa > 2:1344915/1‑149 (MQ=255) aCCTGTCACGATTGCCGTCACTGCACTTGTTTCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGaa > 2:146758/1‑149 (MQ=255) cTGTCACTATTGCCGTCACTGCACTTGTTTCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATa < 1:3856680/149‑1 (MQ=255) gTCACGATTGCCGTCACTGCACTTGTTTCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTCGGTTTGAATAGt < 1:1141865/149‑1 (MQ=255) cGATTGCCGTCACTGCACTTGTTTCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAg < 1:3333266/149‑1 (MQ=255) gATTGCCGTCACTGCACTTGTTTCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAgg < 1:4142709/149‑1 (MQ=255) gATTGCCGTCACTGCACTTGTTTCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAgg < 1:2915705/149‑1 (MQ=255) tGCCGTCACTGCACTTGTTTCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGtt > 1:430270/1‑149 (MQ=255) gTCACTGCACTTGTTTCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGc < 2:3729081/149‑1 (MQ=255) gTCACTGCACTTGTTTCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGc < 2:4167914/149‑1 (MQ=255) tCACTGCACTTGTTTCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCg > 2:720864/1‑149 (MQ=255) tCACTGCACTTGTTTCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCg > 2:4012235/1‑149 (MQ=255) cACTGCACTTGTTTCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGa > 2:4107087/1‑149 (MQ=255) cACTGCACTTGTTTCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGa > 1:1386135/1‑149 (MQ=255) aCTGCACTTGTTTCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGAc > 1:4059321/1‑149 (MQ=255) cACTTGTTTCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTAcc < 1:2482864/149‑1 (MQ=255) aCTTGTTTCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTAccc < 1:1565011/149‑1 (MQ=255) cTTGTTTCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCg > 1:2820923/1‑149 (MQ=255) tGTTTCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGAc < 2:2164539/149‑1 (MQ=255) ttCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCAt < 2:3300415/149‑1 (MQ=255) cGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAg < 1:4253078/149‑1 (MQ=255) cAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGAt < 2:3205286/149‑1 (MQ=255) aaTCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATa > 2:793158/1‑149 (MQ=255) tCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCGGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGt < 2:3583428/149‑1 (MQ=255) tCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGt < 2:4327024/149‑1 (MQ=255) ggTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGa > 2:3334832/1‑149 (MQ=255) ggTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGa > 1:4557690/1‑149 (MQ=255) gTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGAc > 2:1910868/1‑149 (MQ=255) tAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACAt > 1:2977540/1‑149 (MQ=255) aaTGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACAta < 1:5086847/149‑2 (MQ=255) aaTGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATc < 1:1394997/149‑1 (MQ=255) aTGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATcg > 1:3943751/1‑149 (MQ=255) tGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATcgg < 1:487923/149‑1 (MQ=255) gACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATcggc < 1:1482751/149‑1 (MQ=255) cAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATcggcgg > 1:4371062/1‑149 (MQ=255) aaGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGcc < 1:441767/149‑1 (MQ=255) aaGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGcc < 2:3653223/149‑1 (MQ=255) aaGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGcc < 2:2187594/149‑1 (MQ=255) aGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCt > 1:1313443/1‑149 (MQ=255) gTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTg < 1:4346641/149‑1 (MQ=255) tcttGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGgaga > 1:4158799/3‑149 (MQ=255) ttGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGt > 2:2774725/1‑149 (MQ=255) ttGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGt < 2:2244804/149‑1 (MQ=255) ttGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGt < 2:4930255/149‑1 (MQ=255) ttGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGt < 2:1450582/149‑1 (MQ=255) tgtgCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGtt < 2:537040/149‑1 (MQ=255) gccagccaGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCt < 1:2035725/149‑1 (MQ=255) cagccagATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCtgt < 2:1269537/149‑1 (MQ=255) cagccagATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCtgt < 2:4808145/149‑1 (MQ=255) cagATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAAt > 1:3520317/1‑149 (MQ=255) cagATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAAt < 1:4960072/149‑1 (MQ=255) cagATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAAt < 2:4620758/149‑1 (MQ=255) agATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATa > 1:527237/1‑149 (MQ=255) gATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATaa > 1:2358529/1‑149 (MQ=255) aTGCAGAACCAGGTTGTTGCAGAATGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAAc > 2:1177785/1‑149 (MQ=255) tGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAAcg < 2:2743857/149‑1 (MQ=255) gCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAAcgc < 2:380208/149‑1 (MQ=255) gAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCa > 1:2534821/1‑149 (MQ=255) aCCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACTTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCaaa > 1:3680011/1‑149 (MQ=255) ggTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGt < 2:1012733/149‑1 (MQ=255) gttgttGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTa < 1:986943/149‑1 (MQ=255) gttgttGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTa < 2:3677455/149‑1 (MQ=255) gttgttGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTa > 1:4709551/1‑149 (MQ=255) gttgCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCt > 1:2715322/1‑149 (MQ=255) tgCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGAGAATAACGCGCAAAACGTAGCTaa < 2:680406/149‑1 (MQ=255) gCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAAc < 2:1428514/149‑1 (MQ=255) aGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAg > 2:2063815/1‑149 (MQ=255) aGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAg < 2:3854287/149‑1 (MQ=255) gATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAgg > 1:5198650/1‑149 (MQ=255) gATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAgg > 1:2291370/1‑149 (MQ=255) ttGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGaa < 2:3132681/149‑1 (MQ=255) gcgcGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAAcc < 2:3520249/149‑1 (MQ=255) cgcgTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACct < 1:2662844/149‑1 (MQ=255) gcgTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACctc < 2:3261540/149‑1 (MQ=255) gcgTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACctc < 2:5097848/149‑1 (MQ=255) taAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTtgtg < 1:2592653/149‑1 (MQ=255) taAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGAAGCTAACAGGAACCTCTtgtg > 1:1851209/1‑149 (MQ=255) aaGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGaa > 1:2163599/1‑149 (MQ=255) aaGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGAGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTGGTGaa > 2:2519787/1‑149 (MQ=255) aTCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTc > 1:1011402/1‑149 (MQ=255) aTCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTc > 1:2945615/1‑149 (MQ=255) aTCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTc > 1:334914/1‑149 (MQ=255) ccccGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCtt < 2:685915/149‑1 (MQ=255) ccccGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCAGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCtt > 2:1634753/1‑149 (MQ=255) cccGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCttt > 1:3086265/1‑149 (MQ=255) gagaTTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCa > 1:3198277/1‑149 (MQ=255) gaTTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCata < 2:3499244/149‑1 (MQ=255) gaTTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCata < 2:2402327/149‑1 (MQ=255) ttAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATc < 2:1790189/149‑1 (MQ=255) tAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCt < 1:1678369/149‑1 (MQ=255) aCGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGa < 2:3033956/149‑1 (MQ=255) cGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGAc < 2:2358529/149‑1 (MQ=255) | ACCCGTATTGTCAGTTGAACCTGTCACGATTGCCGTCACTGCACTTGTTTCAACCGGACAATCGGTTAATGACAAAGTAATATTGTGCCAGCCAGATGCAGAACCAGGTTGTTGCAGATTGCGCGTATAAAGATCCCCGAGATTAACGTTAGCTTCTTTGGTTTGAATAGTGCAGGGTTTAGCGACTACCCGACCATTAACAGTGATAGTGACATCGGCGGCCTGGAGAGTTGCTGTGAATAACGCGCAAAACGTAGCTAACAGGAACCTCTTGTGAAGTCTTTTCATATCTGAC > CP009273/1582266‑1582560 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |