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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,749,729 | 0 | T | C | 5.5% | 894.5 / 32.0 | 276 | intergenic (‑331/‑226) | ydhZ/pykF | uncharacterized protein/pyruvate kinase I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (146/107); new base C (11/4); total (157/119) | |||||||||||
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Only 100 of 284 total aligned reads displayed.
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ccAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTGGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCTTTTTCGATGTCACCTATCCTTAGAGCGAGGCACCACCACttt < 2:4228030/149‑1 (MQ=255) aTTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCTTTTTCGATGTCACCTATCCTTAGAGCGAGGCACCACCACTTTCGt > 1:2259729/1‑149 (MQ=255) | GTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTGTTTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCTTTTTCGATGTCACCTATCCTTAGAGCGAGGCACCACCACTTTCGTA > CP009273/1749581‑1749876 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |