| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 1,780,104 | C→A | 10.0% | A422A (GCG→GCT) | ppsA ← | phosphoenolpyruvate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,780,104 | 0 | C | A | 10.0% | 1180.3 / 77.7 | 319 | A422A (GCG→GCT) | ppsA | phosphoenolpyruvate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (156/131); new base A (15/17); total (171/148) | |||||||||||
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Only 100 of 331 total aligned reads displayed.
ACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGCACAAGAAACAGTGACGTTCTCACCGTCTTTCATCCGTTCTGTTGCATCTCCACAGCCCACTACCGCCGGAATGCCCAGTTCACGAGCGATGATCGCCGCGTGACAGGTACGACCGCCACGGTTGGTGACGATGGCAGATGCTTTCTTCATGATCGGTTCCCAGTCCGGGTCGGTCATGTCAGTAACCAGCACGTCGCCAGGTTCGATGCGGTTCATTTCGCTGATGTCATGGATGACTTTCACCG > CP009273/1779958‑1780252 | aCGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGCACAAGAAACAGTGACGTTCTCACCGTCTTTCATCCGTTCTGTTGCATCTCCACAGCCCACTACCGCCGGAATGCCCAGTTCACGAGCGATGATcgccgc > 2:2353181/1‑149 (MQ=255)aCGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGCACAAGAAACAGTGACGTTCTCACCGTCTTTCATCCGTTCTGTTGCATCTCCACAGCCCACTACCGCCGGAATGCCCAGTTCACGAGCGATGATcgccgc > 2:3767107/1‑149 (MQ=255)aCGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGCACAAGAAACAGTGACGTTCTCACCGTCTTTCATCCGTTCTGTTGCATCTCCACAGCCCACTACCGCCGGAATGCCCAGTTCACGAGCGATGATcgccgc > 2:342483/1‑149 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tCGCCGCGTGACAGGTACGACCGCCACGGTTGGTGACGATGGCAGATGCTTTCTTCATGATCGGTTCCCAGTCCGGGTCGGTCATGTCAGTAACCAGCACGTCGCCAGGTTCGATGCGGTTCATTTCGCTGATGTCATGGATGACTTTc > 2:944777/1‑149 (MQ=255) gccgcGTGACAGGTACGACCGCCACGGTTGGTGACGATGGCAGATGCTTTCTTCATGATCGGTTCCCAGTCCGGGTCGGTCATGTCAGTAACCAGCACGTCGCCAGGTTCGATGCGGTTCATTTCGCTGATGTCATGGATGACTTTCAc > 2:4998762/1‑149 (MQ=255) | ACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGCACAAGAAACAGTGACGTTCTCACCGTCTTTCATCCGTTCTGTTGCATCTCCACAGCCCACTACCGCCGGAATGCCCAGTTCACGAGCGATGATCGCCGCGTGACAGGTACGACCGCCACGGTTGGTGACGATGGCAGATGCTTTCTTCATGATCGGTTCCCAGTCCGGGTCGGTCATGTCAGTAACCAGCACGTCGCCAGGTTCGATGCGGTTCATTTCGCTGATGTCATGGATGACTTTCACCG > CP009273/1779958‑1780252 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |