Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 2,070,058 | 0 | C | A | 10.8% | 1087.3 / 77.7 | 296 | A90A (GCC→GCA) | yeeS | CP4‑44 prophage; putative DNA repair protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (144/120); new base A (24/8); total (168/128) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.66e-02 | |||||||||||
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Only 100 of 300 total aligned reads displayed.
TGGCGGGACTGGAGCGTGAAGAATTCCGGGTGCTGTATCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTT > CP009273/2069910‑2070206 | ggCGGGACTGGAGCGTGAAGAATTCCGGGTGCTGTATCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCg > 2:2031754/1‑149 (MQ=255) gCGGGACTGGAGCGTGAAGAATTCCGGGTTCTGTATCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGc < 1:2317736/149‑1 (MQ=255) gggACTGGAGCGTGAAGAATTCCGGGTGCTGTATCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTg > 2:525409/1‑149 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |