| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,520,863 | G→T | 15.4% | D187Y (GAC→TAC) | yfeH → | putative inorganic ion transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,520,863 | 0 | G | T | 15.4% | 1050.5 / 132.7 | 334 | D187Y (GAC→TAC) | yfeH | putative inorganic ion transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (132/150); new base T (29/23); total (161/173) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.90e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 336 total aligned reads displayed.
CCTGCTGGGGATTTTCCTTTCACCATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGTTTATCGTGGTGGTCAG > CP009273/2520715‑2521011 | ctgctgGGGATTTTCCTTTCACCATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGa > 2:1055375/1‑149 (MQ=255) ctgGGGATTTTCCTTTCACCATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTg < 2:1966224/149‑1 (MQ=255) tgGGGATTTTCCTTTCACCATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTgg > 2:3806869/1‑149 (MQ=255) tgGGGATTTTCCTTTCACCATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTgg < 1:3426458/149‑1 (MQ=255) ggggATTTTCCTTTCACCATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTTACTggg < 2:3623145/149‑1 (MQ=255) ggggATTTTCCTTTCACCATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTTACTggg < 1:680183/149‑1 (MQ=255) ggggATTTTCCTTTCACCATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTggg > 2:1407127/1‑149 (MQ=255) tCCTTTCACCATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCgcgc > 2:890007/1‑149 (MQ=255) tCCTTTCACCATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCgcgc > 1:4461617/1‑149 (MQ=255) cTTTCACCATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTTACTGGGTGTCGCGCaa > 2:529035/1‑149 (MQ=255) cTTTCACCATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTTACTGGGTGTCGCGCaa > 2:3487680/1‑149 (MQ=255) cTTTCACCATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCgcgcca > 1:2210344/1‑147 (MQ=255) ttCACCATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATa < 2:4812893/149‑1 (MQ=255) tCACCATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATaa < 1:1074871/149‑1 (MQ=255) tCACCATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTGTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATaa > 1:2531821/1‑149 (MQ=255) cATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATaaaaaa < 1:4800855/149‑1 (MQ=255) cATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATaaaaaa < 1:172745/149‑1 (MQ=255) tGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATgg < 1:3280111/149‑1 (MQ=255) gCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGa > 2:64510/1‑149 (MQ=255) tggttggtCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCACTAAAAAATGGAtt > 2:1880887/1‑149 (MQ=255) tggttggtCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGAtt < 2:1810288/149‑1 (MQ=255) tCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGaaaa < 2:1099992/149‑1 (MQ=255) tCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGaaaa > 1:2910514/1‑149 (MQ=255) cTGGTGATGAATGTTCACGGTGGAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAAc < 2:4946192/149‑1 (MQ=255) tgaATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAg > 1:1668383/1‑149 (MQ=255) tgaATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAg < 1:4331134/149‑1 (MQ=255) tGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTTTGTTGGGGCATGTTTACCGGCCGTGGGTTGGTTTGTGGGTGTGGCGCAATAAAAAATGTGTTTCGTAAACTGTCCAGACGt > 1:4382454/1‑149 (MQ=255) tGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGt > 1:2417000/1‑149 (MQ=255) tGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCGTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGt > 1:4610323/1‑149 (MQ=255) gTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTc > 2:2535928/1‑149 (MQ=255) tCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTTACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCa < 2:1073521/149‑1 (MQ=255) cACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCCGACGTCCAt > 2:2607477/1‑149 (MQ=255) cACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCAt > 1:4261876/1‑149 (MQ=255) aGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTtgg > 1:382440/1‑149 (MQ=255) gggggCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTtggt > 2:3127470/1‑149 (MQ=255) ggggCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTtggtg > 2:1428914/1‑149 (MQ=255) gCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTTACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTATGTTGGTGGtt > 1:2277598/1‑149 (MQ=255) aGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCCTCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTTACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGGGGTTta > 1:1049701/1‑149 (MQ=255) aGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTta < 2:1463546/149‑1 (MQ=255) aGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCg > 2:2982407/1‑149 (MQ=255) gCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTGTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGCTTGGTGACTGGGGGTCGCGCCATAAAAAAAGGATTGCGAAAACAGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTTTACAGCGt > 1:3120641/1‑149 (MQ=255) gTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAAATGACCAGACGTCCCTTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAg > 1:4216616/1‑149 (MQ=255) tCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGc < 2:3213244/149‑1 (MQ=255) tCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGc < 1:3790983/149‑1 (MQ=255) gTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTTCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTTGTGGGTTATACAGCGTTCACCGaa > 1:1548838/1‑149 (MQ=255) gTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAAAGGATTTCGAAAAAAGAACCGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTAATCGaa > 1:4942408/1‑149 (MQ=255) gTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTGGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACAGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGaa > 1:1973206/1‑149 (MQ=255) aaaTTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTAAGCGAAGcc > 1:5189338/1‑149 (MQ=255) aaTTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTTTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAAAAAAAAAAGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCcg > 1:2809675/1‑149 (MQ=255) aTGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCcgtcgt > 2:4655236/1‑149 (MQ=255) tgctgcAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTTACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATTGATTGCGAAAAAAGACCCGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATAAAGCGGTCAGCGAAGCCGTCGtt > 1:1382270/1‑149 (MQ=255) tgctgcAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGtt < 2:721713/149‑1 (MQ=255) gctgcAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTa < 1:1001938/149‑1 (MQ=255) gctgcAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTa < 1:3598887/149‑1 (MQ=255) ctgcAACTGCTGCTGCCGTGTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATGGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTaa < 2:170663/149‑1 (MQ=255) tgcAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAAt > 2:2260838/1‑149 (MQ=255) cAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATgg < 2:1867099/149‑1 (MQ=255) aCTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTTGGTGTCGCGCAATAAAAAAATGATTTCGAAAAAATACCACACCTCCAATCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTAAGCGAAGCCGACCTTaaatgta > 1:472180/1‑144 (MQ=255) aCTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGACCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTa > 2:1750823/1‑149 (MQ=255) ctgctgctgCCGTGTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTAt > 2:1592949/1‑149 (MQ=255) tgctgctgcCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATc < 1:1224009/149‑1 (MQ=255) gctgctgcCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCt < 1:3778685/149‑1 (MQ=255) tgcCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTTACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCAt < 2:4158374/149‑1 (MQ=255) tgcCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCAt > 2:2721479/1‑149 (MQ=255) tgcCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCAt > 2:43034/1‑149 (MQ=255) gcCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTTACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATa > 2:2477051/1‑149 (MQ=255) gcCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATa < 1:2121183/149‑1 (MQ=255) gTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAg < 2:4016050/149‑1 (MQ=255) tttGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGt > 2:3418606/1‑149 (MQ=255) ttGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGtt < 1:929517/149‑1 (MQ=255) tgtgTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTTACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTg < 2:2548963/149‑1 (MQ=255) gtgtTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTTACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTgg < 2:3990039/149‑1 (MQ=255) tgtTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTTACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGc < 1:2692886/149‑1 (MQ=255) tgtTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGc > 2:2911947/1‑149 (MQ=255) tgtTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGc < 2:2313355/149‑1 (MQ=255) gtTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCt < 2:2788859/149‑1 (MQ=255) gtTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCt > 2:3923370/1‑149 (MQ=255) gtTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCt > 2:3554546/1‑149 (MQ=255) ttGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTg < 1:3536894/149‑1 (MQ=255) tGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTgg > 1:694372/1‑149 (MQ=255) ggggCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTTACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTggg < 1:4099211/149‑1 (MQ=255) ggggCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTggg > 2:4521007/1‑149 (MQ=255) gggCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTgggg < 2:2193044/149‑1 (MQ=255) cATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATc < 1:3252725/149‑1 (MQ=255) tttCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTg > 1:4526945/1‑149 (MQ=255) cccGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTg < 1:1507352/149‑1 (MQ=255) cGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGtt < 2:5060911/149‑1 (MQ=255) gCCGTGGATTGGTTACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGTTTa > 1:714376/1‑149 (MQ=255) cGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGTTTATc < 1:1933813/149‑1 (MQ=255) cGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGTTTATc > 1:1889108/1‑149 (MQ=255) cGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGTTTATc > 1:4064923/1‑149 (MQ=255) tGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGTTTATCgt < 1:3946535/149‑1 (MQ=255) tGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGTTTATCgt < 1:2050271/149‑1 (MQ=255) gATTGGTTACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGTTTATCgtgg < 2:3061099/149‑1 (MQ=255) aTTGGTTACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGTTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATAATTGCTGTTTATCgtggt > 1:863275/1‑149 (MQ=255) aTTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGTTTATCgtggt < 2:4610323/149‑1 (MQ=255) aTTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGTTTATCgtggt < 1:3287/149‑1 (MQ=255) aTTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGTTTATCgtggt < 2:815096/149‑1 (MQ=255) ggTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGTTTATCGTggtggt < 2:2046543/149‑1 (MQ=255) tGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGTTTATCGTGGTGGTCa < 2:3316700/149‑1 (MQ=255) | CCTGCTGGGGATTTTCCTTTCACCATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGTTTATCGTGGTGGTCAG > CP009273/2520715‑2521011 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |