Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
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RA | CP009273 | 2,600,721 | C→A | 8.5% | S149* (TCG→TAG) | hyfF → | hydrogenase 4, membrane subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,600,721 | 0 | C | A | 8.5% | 1136.0 / 53.5 | 301 | S149* (TCG→TAG) | hyfF | hydrogenase 4, membrane subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (156/117); new base A (16/11); total (172/129) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 305 total aligned reads displayed.
CATGAAGTGGCACACGGCGAGCTTTCACCCGTTACGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGGTGTCGCTTTTGGTCTGTTCGGTACCGTGCTGGTATACGCCAACGCCGCCAGCGTTATGCCGCAGGCAGAA > CP009273/2600573‑2600869 | aTGAAGTGGCACACGGCGAGCTTTCACCCGTTACGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCg < 1:2932472/149‑1 (MQ=255) aTGAAGTGGCACACGGCGAGCTTTCACCCGTTACGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCg > 1:64801/1‑149 (MQ=255) tGAAGTGGCACACGGCGAGCTTTCACCCGTTACGCGGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCgg > 2:905917/1‑149 (MQ=255) gAAGTGGCACACGGCGAGCTTTCACCCGTTACGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGc > 2:2981105/1‑149 (MQ=255) gTGGCACACGGCGAGCTTTCACCCGTTACGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGtt > 1:3722089/1‑149 (MQ=255) gTGGCACACGGCGAGCTTTCACCCGTTACGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGtt < 1:1584812/149‑1 (MQ=255) gTGGCACACGGCGAGCTTTCACCCGTTACGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGtt > 2:625219/1‑149 (MQ=255) ggCACACGGCGAGCTTTCACCCGTTACGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTc > 1:376940/1‑149 (MQ=255) cacaCGGCGAGCTTTCACCCGTTACGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTAGGCGTTTCTg > 1:1220348/1‑149 (MQ=255) acacGGCGAGCTTTCACCCGTTACGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTgg > 2:3700051/1‑149 (MQ=255) gCGAGCTTTCACCCGTTACGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGc > 1:5027406/1‑149 (MQ=255) gCGAGCTTTCACCCGTTACGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGc > 2:1479247/1‑149 (MQ=255) cGAGCTTTCACCCGTTACGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCa < 1:468524/149‑1 (MQ=255) aGCTTTCACCCGTTACGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCAtt > 2:1077967/1‑149 (MQ=255) aGCTTTCACCCGTTACGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCAtt > 1:2955581/1‑149 (MQ=255) gCTTTCACCCGTTACGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGAGTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCAttt > 1:526080/1‑149 (MQ=255) cTTTCACCCGTTACGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTa < 1:215743/149‑1 (MQ=255) cTTTCACCCGTTACGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTa > 2:5201889/1‑149 (MQ=255) tttCACCCGTTACGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTAGGCGTTTCTGGTAGGCATTTAc > 2:2288222/1‑149 (MQ=255) ttCACCCGTTACGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACg > 2:4823216/1‑149 (MQ=255) tCACCCGTTACGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACgg < 1:1200943/149‑1 (MQ=255) cACCCGTTACGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGt > 2:1501643/1‑149 (MQ=255) cccGTTACGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCa > 1:1709370/1‑149 (MQ=255) cccGTTACGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCa > 1:4229340/1‑149 (MQ=255) ccGTTACGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAg > 1:114162/1‑149 (MQ=255) ttACGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGt > 2:3257297/1‑149 (MQ=255) ttACGCTGTGCGAGTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGGTCACCATGCTGCTGGTTGGGACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTAGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGt < 2:7068/149‑1 (MQ=255) tACGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGtt > 2:130254/1‑149 (MQ=255) aCGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTc > 1:1653638/1‑149 (MQ=255) aCGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTGTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTc > 2:2503676/1‑149 (MQ=255) gCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCAt < 1:4823216/149‑1 (MQ=255) tgCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCt < 2:736544/149‑1 (MQ=255) gCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTg < 1:720949/149‑1 (MQ=255) aTTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGaa > 1:3898884/1‑149 (MQ=255) tactacGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCCTTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGc > 2:2299879/1‑149 (MQ=255) tacGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGc > 1:2597613/1‑149 (MQ=255) tacGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGc > 1:151804/1‑149 (MQ=255) cGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTAGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCAt < 1:3159101/149‑1 (MQ=255) ggTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCTTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATg > 2:3999047/1‑149 (MQ=255) ggTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATg < 1:1498171/149‑1 (MQ=255) gTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATgg < 2:1288569/149‑1 (MQ=255) gTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTAAGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATgg > 1:1317038/1‑149 (MQ=255) tttCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGa < 1:2470098/149‑1 (MQ=255) ttcttcCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGaa > 1:2376605/1‑149 (MQ=255) ttcttcCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGaa > 1:4745164/1‑149 (MQ=255) ttcttcCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGaa > 1:4115706/1‑149 (MQ=255) tcttcCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAg < 1:2253333/149‑1 (MQ=255) cATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTAGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTAcat > 2:1982280/1‑149 (MQ=255) aTCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTAcatc > 2:175897/1‑149 (MQ=255) cTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTAcatcat < 2:793818/149‑1 (MQ=255) tttttGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCattat < 2:4099041/149‑1 (MQ=255) ttGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTg > 2:3636264/1‑149 (MQ=255) ttGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTg < 2:4135188/149‑1 (MQ=255) gTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTa < 2:5127169/149‑1 (MQ=255) ttCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTAc < 2:314991/149‑1 (MQ=255) tCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACt > 2:1840709/1‑149 (MQ=255) aCCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACCTCATTATTTGTACTGt > 2:1179848/1‑149 (MQ=255) aCCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGt > 2:4181817/1‑149 (MQ=255) aCCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTGTGTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGGTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGt > 1:2191935/1‑149 (MQ=255) aCCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTAGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGt > 1:3958271/1‑149 (MQ=255) aTGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTgg < 2:3718257/149‑1 (MQ=255) aTGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTgg < 2:3063480/149‑1 (MQ=255) tgctgcTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGgt < 2:4163635/149‑1 (MQ=255) tgctgcTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTAGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGgt > 1:3928480/1‑149 (MQ=255) gctgctGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGgtg < 1:1363098/149‑1 (MQ=255) tgctgGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGGTGTc > 2:3525118/1‑149 (MQ=255) ggTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGGTGTCGCtt < 2:1418169/149‑1 (MQ=255) ggTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGGTGTCGCtt < 1:457682/149‑1 (MQ=255) ggTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTGTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGGTGTCGcgt > 1:4958603/1‑147 (MQ=255) ggTTGTGACCATCAATAAGCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGATGCCTACTCCTTATGCTGGGAGTTTCTGGTTGGCTTTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTTTAATGTTGGTGTCGCtt < 2:3707568/149‑1 (MQ=255) gttgttACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGGTGTCGCttt < 2:2619922/149‑1 (MQ=255) ttgttACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGGTGTCGCtttt > 2:3395819/1‑149 (MQ=255) ttgttACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGGTGTCGCgttt > 2:1900448/1‑149 (MQ=255) 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gCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGGTGTCGCTTTTGGTCTGTTc > 2:847460/1‑149 (MQ=255) cAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGGTGTCGCTTTTGGTCTGTTCg > 2:1455106/1‑149 (MQ=255) aTAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGGTGTCGCTTTTGGTCTGTTCGGt < 2:4244095/149‑1 (MQ=255) aCCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGGTGTCGCTTTTGGTCTGTTCGGTAcc < 2:4624656/149‑1 (MQ=255) cTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTAATGTTGGTGTCGCTTTTTGTCTGTTAGGTAACGt > 2:4414120/1‑149 (MQ=255) gATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGGTGTCGCTTTTGGTCTGTTCGGTACCGTGc > 2:101663/1‑149 (MQ=255) ttGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGGTGTCGCTTTTGGTCTGTTCGGTACCGTGCTg > 2:2429008/1‑149 (MQ=255) gtgATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTACATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGGTGTCGCTTTTGGTCTGTTCGGTACCGTGCTGGt < 2:1600763/149‑1 (MQ=255) tgATGTGGGCGGCGATCGTAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGGTGTCGCTTTTGGTCTGTTCGGTACCGTGCTGGta < 2:3539613/149‑1 (MQ=255) tgtgGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGGTGTCGCGTTTGGTCGGTTCGGTACCGTGCTGGTATAc > 2:2112268/1‑149 (MQ=255) ggcggcGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGGTGTCGCTTTTGGTCTGTTCGGTACCGTGCTGGTATACGCCa < 2:4937865/149‑1 (MQ=255) gcggcgATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGGTGTCGCTTTTGGTCTGTTCGGTACCGTGCTGGTATACGCCaa < 2:2843735/149‑1 (MQ=255) gcggcgATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGGTGTCGCTTTTGGTCTGTTCGGTACCGTGCTGGTATACGCCaa < 2:2399848/149‑1 (MQ=255) gacaccagCTTATGCTCGGCGTTTCTTGTAGTCATTTACGGTCAGGGTTGATCGCTGGTAGCTGCTTGGTAGTACTTAATTTTTTGTACTGTTGGTGTTGCTTTTGGTCTGTTCGGTACCGTGCTGGTATTAGCCTAAGCCGCCATCGt < 2:2587655/147‑1 (MQ=255) caccacCTTAAGCTAGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGGTGTCGCTTTTGGTCTGTTCGGTACCGTGCTGGTATACGCCAACGCCGCCAGCGTTa < 2:1220348/149‑1 (MQ=255) accaccTTAAGCTAGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGGTGTCGCTTTTGGTGTGTTCGGTAACGGGCTGGTATAAGCCAACGCCGCCACCGGTAt > 1:101269/1‑149 (MQ=255) ccaccTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGGTGTCGCTTTTGGTCTGTTCGGTACCGTGCTGGTATACGCCAACGCCGCCAGCGTTATg < 2:4757077/149‑1 (MQ=255) caccTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGGTGTCGCTTTTGGTCTGTTCGGTACCGTGCTGGTATACGCCAACGCCGCCAGCGTTATGc < 2:2194183/149‑1 (MQ=255) accTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCATTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGGTGTCGCTTTTTGTCTGTTCGGTACCGTGCTGGTATACGCCAACGCCCCCACCGTTATTcc > 1:855260/1‑149 (MQ=255) cTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGGTGTCGCTTTTGGTCTGTTCGGTACCCTGCGGGTATAAGCCAACCCCCCCACCGGTAttaccc > 1:5120826/1‑144 (MQ=255) tAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGGTGTCGCTTTTGGTCTGTTCGGTACCGTGCTGGTATACGCCAACGCCGCCAGCGTTATGCCgcag < 1:412595/149‑1 (MQ=255) gCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGGTGTCGCTTTTGGTCTGTTCGGTACCGTGCTGGTATACGCCAACGCCGCCAGCGTTATGCCgcaggca < 1:925739/149‑1 (MQ=255) | CATGAAGTGGCACACGGCGAGCTTTCACCCGTTACGCTGTGCGATTACTACGGTTTCTTCCATCTGTTTTTGTTCACCATGCTGCTGGTTGTTACCAGCAATAACCTGATTGTGATGTGGGCGGCGATCGAAGCCACCACCTTAAGCTCGGCGTTTCTGGTAGGCATTTACGGTCAGCGTTCATCGCTGGAAGCTGCATGGAAGTACATCATTATTTGTACTGTTGGTGTCGCTTTTGGTCTGTTCGGTACCGTGCTGGTATACGCCAACGCCGCCAGCGTTATGCCGCAGGCAGAA > CP009273/2600573‑2600869 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |