| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,891,523 | T→A | 5.1% | N419Y (AAT→TAT) | ygcU ← | putative FAD‑containing dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,891,523 | 0 | T | A | 5.1% | 1209.1 / 35.9 | 327 | N419Y (AAT→TAT) | ygcU | putative FAD‑containing dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (131/179); new base A (5/11); total (137/190) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.45e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 340 total aligned reads displayed.
ACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATGGTGATGTCGTCGGCGTGCGGGAACTCAGTACGAATA > CP009273/2891376‑2891671 | cTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATtgt > 1:1196362/1‑149 (MQ=255) cTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATtgt > 1:647643/1‑149 (MQ=255) tCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTGTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTg > 2:1834431/1‑149 (MQ=255) cAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGt < 2:1106210/149‑1 (MQ=255) cAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGt > 1:4196366/1‑149 (MQ=255) gCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCg > 1:1353733/1‑149 (MQ=255) ccTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGAt > 1:738768/1‑149 (MQ=255) ccTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGAt > 2:408943/1‑149 (MQ=255) ccTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGAt < 2:3457294/149‑1 (MQ=255) cTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGACTGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGAGAGTGGTACTTGTCGAtt > 2:3621498/1‑149 (MQ=255) ttCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGAttt < 2:3895810/149‑1 (MQ=255) ccAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTcc < 2:4636369/149‑1 (MQ=255) aGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCctc > 2:2617949/1‑149 (MQ=255) aGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCctc < 2:3201263/149‑1 (MQ=255) gCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCctct > 1:386273/1‑149 (MQ=255) cAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCtt < 1:347832/149‑1 (MQ=255) aCGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTcc < 1:379697/149‑1 (MQ=255) aCGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTcc > 1:3506499/1‑149 (MQ=255) aCGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTcc < 2:3953964/149‑1 (MQ=255) cgcTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAg < 1:4635181/149‑1 (MQ=255) gcTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGt > 1:4926484/1‑149 (MQ=255) tGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCa < 2:3438048/149‑1 (MQ=255) tGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCa > 1:2240646/1‑149 (MQ=255) gCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCaa > 1:4534296/1‑149 (MQ=255) gCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCaa < 1:2208271/149‑1 (MQ=255) ccGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAac < 1:4871652/149‑1 (MQ=255) gtgtTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAacga < 2:1415227/149‑1 (MQ=255) ttCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGt < 1:54380/149‑1 (MQ=255) ttCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGt > 1:1826536/1‑149 (MQ=255) tCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGtt > 2:53685/1‑149 (MQ=255) ccAGTTTGCTCCAGTGACCGCGATGTGTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACTACGTTg < 2:4911809/149‑1 (MQ=255) ccAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATAGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTg < 2:900940/149‑1 (MQ=255) tttGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAAt < 2:249141/149‑1 (MQ=255) tgtGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAAt < 2:2268703/147‑1 (MQ=255) tCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAg < 2:3066210/149‑1 (MQ=255) ccAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGa < 2:1233451/149‑1 (MQ=255) cAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGAc > 1:5142829/1‑149 (MQ=255) cAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGAc > 1:2052087/1‑149 (MQ=255) tGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGaa < 1:1961354/149‑1 (MQ=255) aCGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTa < 1:4015962/149‑1 (MQ=255) cgATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACAt < 2:3649398/149‑1 (MQ=255) gATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATg < 1:1541872/149‑1 (MQ=255) gTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTg < 1:3204430/149‑1 (MQ=255) tttACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTgg < 1:2726995/149‑1 (MQ=255) tACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTg > 2:11704/1‑149 (MQ=255) aCCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGc > 2:19236/1‑149 (MQ=255) aCCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGc > 2:1758840/1‑149 (MQ=255) ccGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGcc < 2:545838/149‑1 (MQ=255) ccGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATAGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGcc < 1:2963007/149‑1 (MQ=255) cGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATAGTAGACGAAGTACAAGTTTGTGcag > 2:52178/1‑147 (MQ=255) gATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGACGTACATGTTGGTGCCGt > 2:2725/1‑149 (MQ=255) gATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGt > 2:1137005/1‑149 (MQ=255) tACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTc > 1:3077163/1‑149 (MQ=255) cGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGa > 2:3694365/1‑149 (MQ=255) gtggtggtgCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGAt < 1:4819458/149‑1 (MQ=255) gtggtgCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATAGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGc < 2:4846946/149‑1 (MQ=255) tggtgCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCt < 1:88939/149‑1 (MQ=255) gtgCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGTTAt < 1:2612112/149‑1 (MQ=255) cACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACAGGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATgag > 2:2246519/1‑149 (MQ=255) aCCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATgaga < 2:3973236/149‑1 (MQ=255) cATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAgg < 2:5024231/149‑1 (MQ=255) aTCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGa < 2:1187419/149‑1 (MQ=255) gAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATg > 1:3328405/1‑149 (MQ=255) aaCCGCCGAGGCGATTGGTTTCTTCACAGTTGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGa < 1:431796/149‑1 (MQ=255) aaCCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGa > 2:3717824/1‑149 (MQ=255) aCCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGAc < 2:3027330/149‑1 (MQ=255) ccgccgAGGCGTATGGTTTCTTCCCAGATTATATTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGTTTTCGTCTTCCGGCTTACTGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGTTGCCGTTCTGATAGCTATGAGTGGAATGAcc < 1:2485822/149‑1 (MQ=255) ccgccgAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGAcc > 2:1798114/1‑149 (MQ=255) cgccgAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCg > 1:2851839/1‑149 (MQ=255) gccgAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGc < 2:1050019/149‑1 (MQ=255) gCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCa < 2:4206641/149‑1 (MQ=255) gAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATg < 1:1659952/149‑1 (MQ=255) gAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATg > 1:1055505/1‑149 (MQ=255) gAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATg > 2:288057/1‑149 (MQ=255) aaTGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATgg < 1:4167532/149‑1 (MQ=255) tGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATGGTg > 1:143971/1‑149 (MQ=255) tttCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATGGTGATg > 2:4296308/1‑149 (MQ=255) tcttcACAGATGATCTTGTTGAGCGGATAGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATGGTGATgtc < 1:1134766/149‑1 (MQ=255) cttcACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATGGTGATgtcg > 2:4400056/1‑149 (MQ=255) cccaGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATGGTGATGtcgtcg < 2:2296509/147‑1 (MQ=255) cacaGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATGGTGATGtcgtcg < 1:1524221/149‑1 (MQ=255) caGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATGGTGATGTCGTCGGc < 1:2556407/149‑1 (MQ=255) gatgatCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATGGTGATGTCGTCGGCGt < 1:3970379/149‑1 (MQ=255) atgatCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATGGTGATGTCGTCGGCGTg < 2:3491525/149‑1 (MQ=255) tgatCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATGGTGATGTCGTCGGCGTGc > 2:2398726/1‑149 (MQ=255) tgatCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATGGTGATGTCGTCGGCGTGc < 1:1248943/149‑1 (MQ=255) tCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATGGTGATGTCGTCGGCGTGCggg > 2:4325263/1‑149 (MQ=255) ttgttgAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATGGTGATGTCGTCGGCGTGCGGGaa > 1:2754820/1‑149 (MQ=255) tgttgAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATGGTGATGTCGTCGGCGTGCGGGAAc < 1:2124784/149‑1 (MQ=255) gttgAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATGGTGATGTCGTCGGCGTGCGGGAACt > 2:820562/1‑149 (MQ=255) gttgAGCGGATAGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATGGTGATGTCGTCGGCGTGCGGGAACt < 2:723083/149‑1 (MQ=255) ttgAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATGGTGATGTCGTCGGCGTGCGGGAACTc < 2:4340598/149‑1 (MQ=255) ttgAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATGGTGATGTCGTCGGCGTGCGGGAACTc > 2:4566682/1‑149 (MQ=255) tgAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATGGTGATGTCGTCGGCGTGCGGGAACTCa < 1:3403382/149‑1 (MQ=255) gAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATGGTGATGTCGTCGGCGTGCGGGAACTCAg < 1:465111/149‑1 (MQ=255) aGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATGGTGATGTCGTCGGCGTGCGGGAACTCAGt < 2:1681347/149‑1 (MQ=255) gCGGATAGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATGGTGATGTCGTCGGCGTGCGGGAACTCAGTa < 1:5031785/149‑1 (MQ=255) aTTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATGGTGATGTCGTCGGCGTGCGGGAACTCAGTACGaa < 2:4922750/149‑1 (MQ=255) ttGTGGTACTTTTCTATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATGGTGATGTCGTCGGCGTGCGGGAACTCAGTACGAAt < 2:4006357/149‑1 (MQ=255) ttGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATGGTGATGTCGTCGGCGTGCGGGAACTCAGTACGAAt < 1:4419430/149‑1 (MQ=255) | ACTGCTTTTTCAGCCCTTCCAGCAACGCCCACGCGCTGCCGTGTTCCAGTTTGCTCCAGTGAACGCGATGTTTACCGATACCGTGGTGGTGCACCATCGAACCGCCGAGGCGAATGGTTTCTTCACAGATGATCTTGTTGAGCGGATTGTGGTACTTGTCGATTTCCTCTTCCGGCTTACAGTCAACGACGTTGTAATCGTAGACGAAGTACATGTTGGTGCCGTTCTGATAGCTATGAGAGGAATGACCGCCCAGCATGGTGATGTCGTCGGCGTGCGGGAACTCAGTACGAATA > CP009273/2891376‑2891671 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |