| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,975,754 | T→A | 6.8% | intergenic (‑213/+102) | araE ← / ← kduD | arabinose transporter/hexuronate dehydrogenase; hexuronate utilization in high osmolarity |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,975,754 | 0 | T | A | 6.8% | 968.4 / 46.7 | 265 | intergenic (‑213/+102) | araE/kduD | arabinose transporter/hexuronate dehydrogenase; hexuronate utilization in high osmolarity |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (134/113); new base A (11/7); total (145/120) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.31e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.24e-01 | |||||||||||
Only 100 of 293 total aligned reads displayed.
GGTCGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCATCCACGGCAATGGTATAACCATTCA > CP009273/2975606‑2975902 | gTCGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGTta > 2:2152451/1‑149 (MQ=255) gTCGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGAta < 1:698549/149‑1 (MQ=255) cGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGAtaat > 2:1449579/1‑149 (MQ=255) cGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGAaaat < 1:4530719/149‑1 (MQ=255) cGGAAACAGCATAAATATGGATTAAAGTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGAtaat < 2:1405686/149‑1 (MQ=255) gAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGAtaatta > 1:4180390/1‑149 (MQ=255) gAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGATGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATATTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCAATAATTGAtaatta > 1:4706381/1‑149 (MQ=255) gAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATATTCAAATTAAGATGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTACATTAATTGAtaatta > 1:356147/1‑149 (MQ=255) aaCAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGAtaattaat > 1:1527662/1‑149 (MQ=255) aCAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAata > 1:3850210/1‑149 (MQ=255) aCAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAata > 2:3432644/1‑149 (MQ=255) aGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATg < 2:2494177/149‑1 (MQ=255) cATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGa > 2:1418365/1‑149 (MQ=255) aTAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGat < 1:4641536/149‑1 (MQ=255) tAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGCTAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGatt < 1:2410691/149‑1 (MQ=255) tAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGatt < 2:3850210/149‑1 (MQ=255) tatGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACATCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTAttt > 1:2135502/1‑149 (MQ=255) tatGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATAATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTATACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTTATAATTAATATGGATTAttt > 1:2281056/1‑149 (MQ=255) atcgATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGAAAATTAATATGGATTATTTc < 2:4285772/146‑1 (MQ=255) tGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCa < 1:3412315/149‑1 (MQ=255) ggATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCAt > 2:5062121/1‑149 (MQ=255) aTTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATaa > 2:1808779/1‑149 (MQ=255) ttAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAAc < 2:1229788/149‑1 (MQ=255) ttAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAAc < 1:3752005/149‑1 (MQ=255) aTTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATg > 2:2254069/1‑149 (MQ=255) cGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGa < 1:67918/149‑1 (MQ=255) cGACATGTAGTTATGTTATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACATAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGa < 1:3116783/149‑1 (MQ=255) gACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGAt < 1:4672979/149‑1 (MQ=255) cATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTACAAATTAAGTTGAAGTATTGAGATTATTATTAACAACCTAATTTTACAGAAGATAAAATTCATAAAGTTAATTAATTGATAATAAATAATTATTATTTAATAAACATGATAAGTATTa > 1:3342433/1‑149 (MQ=255) aTGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTat < 1:912617/149‑1 (MQ=255) tCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTatgat > 2:4558458/1‑149 (MQ=255) gTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTAtgatga > 2:4106145/1‑149 (MQ=255) gTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTAtgatga > 1:2560036/1‑149 (MQ=255) ttATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATgatgat > 1:2370799/1‑149 (MQ=255) tATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATc > 1:759036/1‑149 (MQ=255) tATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATGAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATc < 1:1585324/149‑1 (MQ=255) tgtgATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGAAAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTa > 1:3272231/1‑149 (MQ=255) gATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAg < 1:135946/149‑1 (MQ=255) gATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAg < 1:3706287/149‑1 (MQ=255) aTGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAgg > 2:1126933/1‑149 (MQ=255) tGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGt < 1:562375/149‑1 (MQ=255) atatTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGtata > 1:1495493/1‑149 (MQ=255) atTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGAAAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATaaa > 2:3957847/1‑149 (MQ=255) aaTTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAAcc > 2:73688/1‑149 (MQ=255) aTTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAAccc < 2:3583127/149‑1 (MQ=255) ttttCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCt < 2:3599457/149‑1 (MQ=255) tCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGcc < 1:4114279/149‑1 (MQ=255) aaaTTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCAt > 1:4581366/1‑149 (MQ=255) aTTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGAAAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGTATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGc > 2:588101/1‑149 (MQ=255) ttAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCg > 1:1005474/1‑149 (MQ=255) ttAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCg > 1:836518/1‑149 (MQ=255) tttGAATTATTGAGAATAATATTAACCACATAATTTTACAGAAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATTTATTATTTCATAACAATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAg < 2:4797454/148‑1 (MQ=255) ttGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAgg < 1:2471843/149‑1 (MQ=255) gAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGt > 1:2959992/1‑149 (MQ=255) gAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGt < 2:2600433/149‑1 (MQ=255) gAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGt < 1:3484611/149‑1 (MQ=255) ttattGAGATTATTATTAACCACATAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCAt < 2:2884949/149‑1 (MQ=255) tattGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATa < 1:3665653/149‑1 (MQ=255) attGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCATATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATaa < 2:2541241/149‑1 (MQ=255) attGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATaa > 1:2425799/1‑149 (MQ=255) gagaTTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAg > 1:1242692/1‑149 (MQ=255) agaTTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGt > 2:633024/1‑149 (MQ=255) ttattattaACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTaag < 2:2828475/149‑1 (MQ=255) tattattaACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAATGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTaaga > 2:1521948/1‑149 (MQ=255) attaACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAgaagaa < 1:322687/149‑1 (MQ=255) ttaACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAATACCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAgaat > 2:1962231/1‑149 (MQ=255) aaCCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAgaatga > 2:349591/1‑149 (MQ=255) ccaccTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGAAAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAgaatgaat > 1:3541253/1‑149 (MQ=255) ccaccTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGAAAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAgaatgaat > 1:605257/1‑149 (MQ=255) accTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTa > 2:4417732/1‑149 (MQ=255) accTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAAACCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTa > 2:4324073/1‑149 (MQ=255) ccTAATTTTACATCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTaa < 2:4582454/149‑1 (MQ=255) cTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCCTGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAAc > 2:4859882/1‑149 (MQ=255) tAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAAcg > 2:2698492/1‑149 (MQ=255) tAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAAcg < 1:4825293/149‑1 (MQ=255) aaTTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGACTGAATTAAcgc > 2:4181203/1‑149 (MQ=255) aaTTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAAcgc < 1:2799396/149‑1 (MQ=255) aTTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAAcgcg > 1:1690241/1‑149 (MQ=255) ttttACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACgcgc > 1:4446768/1‑149 (MQ=255) tttACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCgcc > 2:3037616/1‑149 (MQ=255) aCAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCgccagc > 2:1732890/1‑149 (MQ=255) cagcagATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCgccagcc > 2:5137362/1‑149 (MQ=255) gcagATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCaa > 2:5102532/1‑149 (MQ=255) aaaaTTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCa < 1:4026690/149‑1 (MQ=255) aaaTTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCAt > 1:934051/1‑149 (MQ=255) aaaTTCATAAAGTTCATTAATTGAAAATTAATATGGATTATCTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCAt > 2:3239122/1‑149 (MQ=255) aTTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCATcc < 1:5076285/149‑1 (MQ=255) aaaGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCATCCACGGCa > 2:3017925/1‑149 (MQ=255) aaGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCATCCACGGCaa > 1:1927116/1‑149 (MQ=255) aaGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCATCCACGGCaa < 2:4180282/149‑1 (MQ=255) aaGTTCATTAATTGAAAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCATCCACGGCaa < 2:3272384/149‑1 (MQ=255) aGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCATCCACGGCAAt < 2:845533/149‑1 (MQ=255) ttCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCATCCACGGCAATgg < 1:4272482/149‑1 (MQ=255) cATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCATCCACGGCAATGGta > 1:1026980/1‑149 (MQ=255) aaTTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCATCCACGGCAATGGta < 1:2707091/148‑1 (MQ=255) aTTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACTATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCATCCACGGCAATGGtat < 2:1385765/149‑1 (MQ=255) aTTAATTGAAAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCATCCACGGCAATGGtat < 2:3620181/149‑1 (MQ=255) gATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCATCCACGGCAATGGTATAACCAtt > 2:3681992/1‑149 (MQ=255) gATAATTAATATGGATTATATCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATAAACGCGCCAGCCAACCGCCATCCACGGCAATGGTATAACCAtt > 1:2048037/1‑149 (MQ=255) taattaatATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCATCCACGGCAATGGTATAACCATTca > 1:4966616/1‑149 (MQ=255) | GGTCGGAAACAGCATAAATATGGATTAAATTGCTGCGACATGTCGTTATGTGATGGATATTCCAATTTTCAAATTAAGTTGAATTATTGAGATTATTATTAACCACCTAATTTTACAGCAGATAAAATTCATAAAGTTCATTAATTGATAATTAATATGGATTATTTCATAACCATGATATGGATTATGATGATCTACAGGTATAAAAAACCCTGCCATGCGGCAGGGTCATAAAAGTAAGAAGAATGAATTAACGCGCCAGCCAACCGCCATCCACGGCAATGGTATAACCATTCA > CP009273/2975606‑2975902 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |