Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,056,703 | C→A | 6.5% | R120S (CGC→AGC) | argK → | membrane ATPase/protein kinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,056,703 | 0 | C | A | 6.5% | 1217.9 / 39.8 | 331 | R120S (CGC→AGC) | argK | membrane ATPase/protein kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (146/160); new base A (18/7); total (164/167) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.23e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 335 total aligned reads displayed.
TTGAGGCCTTTGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAACGGTTGGCGTCGGGCAGTCGGAAACAGAAGTCGCCCGCATGGTGGA > CP009273/3056557‑3056851 | ttGAGGCCTTTGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGc > 2:1405543/1‑149 (MQ=255) tGAGGCCTTTGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGGTTATTCGcc > 1:4156163/1‑149 (MQ=255) ggCCTTTGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCgg > 2:4035320/1‑149 (MQ=255) ccTTTGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTa > 1:1308541/1‑149 (MQ=255) cTTTGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTAc < 1:4864533/149‑1 (MQ=255) gCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCAtcc < 1:3857282/149‑1 (MQ=255) ttgATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCa > 1:4166258/1‑149 (MQ=255) ttgATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCACCGGTCa > 1:3585677/1‑149 (MQ=255) aTTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTAGCCCGGTACCATCCACCGGTCATCt > 1:1052364/1‑149 (MQ=255) ttCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTAGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTg > 2:5009745/1‑149 (MQ=255) tCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTgg < 1:2389828/149‑1 (MQ=255) agagGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCg > 1:4487625/1‑149 (MQ=255) agagGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCg > 1:2782082/1‑149 (MQ=255) ggATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGc < 2:5092860/149‑1 (MQ=255) gATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGcc > 2:2778117/1‑149 (MQ=255) gATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCAACCTCCGGTCATCTGGGCGGTGcc > 1:4257150/1‑149 (MQ=255) tAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTAGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGt < 2:4901037/149‑1 (MQ=255) aaGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCa < 1:2428276/149‑1 (MQ=255) aaGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCa > 2:453258/1‑149 (MQ=255) aGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCag > 2:1956963/1‑149 (MQ=255) ggTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCagc < 1:373363/149‑1 (MQ=255) gTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCagcg > 2:3485167/1‑149 (MQ=255) gTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCCGTACCAACCACCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCagcg > 2:887723/1‑149 (MQ=255) tCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCagcga > 2:745659/1‑149 (MQ=255) gTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGcgcg > 2:3240922/1‑149 (MQ=255) tATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCggg < 2:5042024/149‑1 (MQ=255) ttGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGaa < 2:2132983/149‑1 (MQ=255) tGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCTTGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAAt < 1:4654129/149‑1 (MQ=255) ggTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTaa > 1:1664946/1‑149 (MQ=255) gTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCTCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTAGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAaataat > 1:2529874/1‑149 (MQ=255) gTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAAt > 2:2389499/1‑149 (MQ=255) gTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAAt < 2:2286721/149‑1 (MQ=255) gTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAAt > 2:3820456/1‑149 (MQ=255) gTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAAt > 2:3820425/1‑149 (MQ=255) tCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATg > 2:4216908/1‑149 (MQ=255) cGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGc < 2:551447/149‑1 (MQ=255) gATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCt < 2:4768075/149‑1 (MQ=255) aTCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTg > 1:4579198/1‑149 (MQ=255) aTCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTg < 2:3356508/149‑1 (MQ=255) aTCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTg > 1:1546012/1‑149 (MQ=255) aTCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTAGCCCGGTACCATCCTCCGGTCAACTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTg > 1:4819964/1‑149 (MQ=255) tCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGt < 1:2613005/149‑1 (MQ=255) cccAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGtt < 1:2955777/149‑1 (MQ=255) ccAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTa > 1:3139099/1‑149 (MQ=255) gcCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGCGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGaa > 1:776705/1‑149 (MQ=255) gcCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGaa < 2:265823/149‑1 (MQ=255) cGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAagca < 2:1441824/149‑1 (MQ=255) ggTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAagcag < 1:5195653/149‑1 (MQ=255) ggTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAagcag < 2:4647029/149‑1 (MQ=255) gTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAagcagc < 1:806827/149‑1 (MQ=255) gTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAagcagc < 1:4773795/149‑1 (MQ=255) tCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCg < 1:2376242/149‑1 (MQ=255) cTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGt < 1:1710301/149‑1 (MQ=255) cTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTAGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGt > 2:3580075/1‑149 (MQ=255) tGGCGGTAGCAGTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGtt < 2:5160189/149‑1 (MQ=255) ggCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTa > 1:1259713/1‑149 (MQ=255) gCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTAt < 2:1781361/149‑1 (MQ=255) ggTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGa < 2:40608/149‑1 (MQ=255) gTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGAc < 2:1218103/149‑1 (MQ=255) gCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTa < 1:2003019/149‑1 (MQ=255) gCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTa > 2:3096131/1‑149 (MQ=255) ttCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTTATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTg < 2:4849890/149‑1 (MQ=255) tctcGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGa < 1:5020979/149‑1 (MQ=255) tcGGGGATAACACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGAtt < 2:1585158/149‑1 (MQ=255) tcGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGAtt < 2:1935026/149‑1 (MQ=255) tcGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGAtt < 2:4732919/149‑1 (MQ=255) ggggATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGt < 2:438898/149‑1 (MQ=255) tAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGaaa < 2:3719183/149‑1 (MQ=255) tAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGaaa < 2:1123004/149‑1 (MQ=255) aaaaCCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAAc < 1:145325/149‑1 (MQ=255) aaaaCCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAAc < 2:3801408/149‑1 (MQ=255) aaCCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAACgg < 2:4943719/149‑1 (MQ=255) aaCCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAACgg > 2:2726009/1‑149 (MQ=255) aCCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAACGGt > 2:2498772/1‑149 (MQ=255) aCCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAACGGt < 1:745659/149‑1 (MQ=255) aCCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTAGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAACGGt > 1:1814668/1‑149 (MQ=255) ccacATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAACGGTTg < 2:365681/146‑1 (MQ=255) cATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTAGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAACGGTTGGCg > 1:3300088/1‑149 (MQ=255) tgaatgaCCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAACGGTTGGCGTc < 2:4259115/149‑1 (MQ=255) tgaatgaCCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAACGGTTGGCGTc > 2:1704441/1‑149 (MQ=255) tgaatgaCCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAACGGTTGGCGTc > 1:2102158/1‑149 (MQ=255) atgaCCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAACGGTTGGCGTCggg > 2:230350/1‑149 (MQ=255) ccTGGTGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAACGGTTGGCGTCGGGCAGt < 1:2880180/149‑1 (MQ=255) cTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAACGGTTGGCGTCGGGCAGTc > 2:2951928/1‑149 (MQ=255) tGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATTACGTAGTGATTGTCGAAACGGTTGGCGTCGGGCAGTCg > 1:327648/1‑149 (MQ=255) ggCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCAACCTACGGTCATCATGGCGGTGCCAGTCACCGAGCGCGGGAAATAATGCTGTTATAAGAAACAGCGGGTTAATACATAGTTATTTTACAAACGCTTTGCGTCGGGCACTCgg > 1:2674869/1‑149 (MQ=255) ggCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTAGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAACGGTTGGCGTCGGGCAGTCgg > 1:4202181/1‑149 (MQ=255) gcgcGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAACGGTTGGCGTCGGGCAGTCGGa < 2:216869/149‑1 (MQ=255) gCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAACGGTTGGCGTCGGGCAGTCGGAAACAGa > 2:773932/1‑149 (MQ=255) cGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAACGGTTGGCGTCGGGCAGTCGGAAACAGAAg < 1:1599785/149‑1 (MQ=255) gAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATTCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAACGGTTGGCGTCGGGCAGTCGGAAACAGAAGt > 2:470220/1‑149 (MQ=255) gAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAACGGTTGGCGTCGGGCAGTCGGAAACAGAAGt > 2:3384858/1‑149 (MQ=255) aGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAACGGTTGGCGTCGGGCAGTCGGAAACAGAAGTCg < 1:896618/149‑1 (MQ=255) ggcgTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAACGGTTGGCGTCGGGCAGTCGGAAACAGAAGTCGccc < 2:5105942/149‑1 (MQ=255) ggcgTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAACGGTTGGCGTCGGGCAGTCGGAAACAGAAGTCGccc > 2:1369393/1‑149 (MQ=255) tttATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGACTTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAACGGTTGGCGTCGGGCAGTCGGAAACAGAAGTCGCCCGCAt > 2:300722/1‑149 (MQ=255) tttATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAACGGTTGGCGTCGGGCAGTCGGAAACAGAAGTCGCCCGCAt < 1:4035320/149‑1 (MQ=255) tttATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAACGGTTGGCGTCGGGCAGTCGGAAACAGAAGTCGCCCGCAt > 1:4216572/1‑149 (MQ=255) tATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAACGGTTGGCGTCGGGCAGTCGGAAACAGAAGTCGCCCGCAtgg > 2:3231188/1‑149 (MQ=255) aTTAGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAACGGTTGGCGTCGGGCAGTCGGAAACAGAAGTCGCCCGCAtggt < 2:3079022/149‑1 (MQ=255) | TTGAGGCCTTTGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACGTAGTGATTGTCGAAACGGTTGGCGTCGGGCAGTCGGAAACAGAAGTCGCCCGCATGGTGGA > CP009273/3056557‑3056851 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |