| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 3,378,591 | G→A | 5.1% | intergenic (+59/‑306) | argR → / → yhcN | l‑arginine‑responsive arginine metabolism regulon transcriptional regulator/cadmium and peroxide resistance protein, stress‑induced |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,378,591 | 0 | G | A | 5.1% | 1283.1 / 33.1 | 349 | intergenic (+59/‑306) | argR/yhcN | l‑arginine‑responsive arginine metabolism regulon transcriptional regulator/cadmium and peroxide resistance protein, stress‑induced |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (148/183); new base A (7/11); total (155/194) | |||||||||||
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Only 100 of 350 total aligned reads displayed.
GATGACACCATCTTTACCACCCCTGCTAACGGTTTCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATGTCATTCACACAATGAATACATAAGGTAAAAAAAGCACATTATGCAAAATTCATTATCTAATTGAAAAAACTAGAATTAACGATAAATAACCGTATTTT > CP009273/3378443‑3378737 | gATGACACCATCTTTACCACCCCTGCTAACGGTTTCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTg > 2:2044391/1‑149 (MQ=255) aTGACACCATCTTTACCACCCCTGCTAACGGTTTCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGc > 1:2654031/1‑149 (MQ=255) tGACACCATCTTTACCACCCCTGCTAACGGTTTCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCt > 1:2964751/1‑149 (MQ=255) acacCATCTTTACCACCCCTGCTAACGGTTTCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCttt < 2:2744693/149‑1 (MQ=255) acCATCTTTACCACCCCTGCTAACGGTTTCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTcc > 2:4186703/1‑149 (MQ=255) acCATCTTTACCACCCCTGCTAACGGTTTCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTcc < 1:3804113/149‑1 (MQ=255) cATCTTTACCACCCCTGCTAACGGTTTCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTcccc < 2:421812/149‑1 (MQ=255) tCTTTACCACCCCTGCTAACGGTTTCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTg > 2:1274596/1‑149 (MQ=255) tCTTTACCACCCCTGCTAACGGTTTCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCAGCTTTCCCCTg > 1:4352502/1‑149 (MQ=255) cTTTACCACCCCTGCTAACGGTTTCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGc < 2:3353000/149‑1 (MQ=255) tACCACCCCTGCTAACGGTTTCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGAt < 2:3510548/149‑1 (MQ=255) accaccCCTGCTAACGGTTTCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGAtt < 2:3147621/149‑1 (MQ=255) caccCCTGCTAACGGTTTCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTaa < 2:4561247/149‑1 (MQ=255) ccccTGCTAACGGTTTCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAAtt > 1:4983074/1‑149 (MQ=255) ccccTGCTAACGGTTTCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAAtt < 1:2222902/149‑1 (MQ=255) cccTGCTAACGGTTTCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAAttt < 2:3032952/149‑1 (MQ=255) cTGCTAACGGTTTCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTaa > 1:1205159/1‑149 (MQ=255) cTGCTAACGGTTTCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTACTTTCCCCTGCGATTAATTTaa < 2:3979371/149‑1 (MQ=255) 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ccTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATGTCATTCACACAATGAATACATAAGGTAAAAAAAGCACATTATGCAAAATTCATTATCTAATTGAAAAAACTAGAATTAACGataaa > 2:3307871/1‑149 (MQ=255) ccTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATGTCATTCACACAATGAATACATAAGGTAAAAAAAGCACATTATGCAAAATTCATTATCTAATTGAAAAAACTAGAATTAACGataaa > 2:4422381/1‑149 (MQ=255) tctcAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATGTCATTCACACAATGAATACATAAGGTAAAAAAAGCACATTATGCAAAATTCATTATCTAATTGAAAAAACTAGAATTAACGataaata > 2:2840884/1‑149 (MQ=255) tctcAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATGTCATTCACACAATGAATACATAAGGTAAAAAAAGCACATTATGCAAAATTCATTATCTAATTGAAAAAACTAGAATTAACGataaata > 1:1275043/1‑149 (MQ=255) ccaCCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATGTCATTCACACAATGAATACATAAGGTAAAAAAAGCACATTATGCAAAATTCATTATCTAATTGAAAAAACTAGAATTAACGATAAATAAcc < 1:79511/147‑1 (MQ=255) 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ccTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATGTCATTCACACAATGAATACATAAGGTAAAAAAAGCACATTATGCAAAATTCATTATCTAATTGAAAAAACTAGAATTAACGATAAATAACCGTAttt > 1:5058331/1‑149 (MQ=255) cTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATGTCATTCACACAATGAATACATAAGGTAAAAAAAGCACATTATGCAAAATTCATTATCTAATTGAAAAAACTAGAATTAACGATAAATAACCGTAtttt < 2:1411041/149‑1 (MQ=255) | GATGACACCATCTTTACCACCCCTGCTAACGGTTTCACAGTCAAAGACCTGTACGAAGCGATTTTAGAGCTGTTCGACCAGGAGCTTTAATCTCTGCCCCGTCGTTTCTGACGGCGGGGAAAATGTTGCTTATCCCTCTCAACCCCCTGCTTTCCCCTGCGATTAATTTAACGAATAGTGCGTTTTACTGCGACATGTCATTCACACAATGAATACATAAGGTAAAAAAAGCACATTATGCAAAATTCATTATCTAATTGAAAAAACTAGAATTAACGATAAATAACCGTATTTT > CP009273/3378443‑3378737 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |