| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,519,657 | G→T | 100% | intergenic (‑149/‑171) | nudE ← / → yrfF | adenosine nucleotide hydrolase; substrates include Ap3A, Ap2A, ADP‑ribose, NADH/inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,519,657 | 0 | G | T | 100.0% | 1173.5 / ‑6.7 | 299 | intergenic (‑149/‑171) | nudE/yrfF | adenosine nucleotide hydrolase; substrates include Ap3A, Ap2A, ADP‑ribose, NADH/inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base T (153/145); total (154/145) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 299 total aligned reads displayed.
TGGGATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCAGGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCTG > CP009273/3519511‑3519802 | gggATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGaa > 2:1111105/1‑149 (MQ=255) gggATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGaa < 2:363008/149‑1 (MQ=255) ggATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAAt > 1:2866495/1‑149 (MQ=255) gATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAAtt < 1:2064298/149‑1 (MQ=255) tCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTg < 2:1757780/149‑1 (MQ=255) cTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGc < 1:83953/149‑1 (MQ=255) cTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGc < 2:603093/149‑1 (MQ=255) cTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGc < 1:1658154/149‑1 (MQ=255) tATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCt < 2:864927/149‑1 (MQ=255) aTGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTg > 1:1759526/1‑149 (MQ=255) tGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGa > 2:4261062/1‑149 (MQ=255) cTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGata > 2:3080320/1‑149 (MQ=255) cTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGata < 1:1372230/149‑1 (MQ=255) tgtgAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGatat < 1:129770/149‑1 (MQ=255) aaTCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGc < 2:713074/149‑1 (MQ=255) aGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTc < 2:3173089/149‑1 (MQ=255) gCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCa < 2:4532420/149‑1 (MQ=255) gTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCagag > 2:1453675/1‑149 (MQ=255) gTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCagag < 2:4600012/149‑1 (MQ=255) gTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCAGGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCagag > 2:4394939/1‑149 (MQ=255) ttATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAgg > 1:1452059/1‑149 (MQ=255) ttATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAgg > 2:406882/1‑149 (MQ=255) ttATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTAAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAgg > 2:5073812/1‑149 (MQ=255) ttGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGtt > 1:703464/1‑149 (MQ=255) ttGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGtt > 2:4850976/1‑149 (MQ=255) tgCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGc > 2:3498926/1‑149 (MQ=255) cGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTa < 2:3216616/149‑1 (MQ=255) tatCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGa < 2:1255449/149‑1 (MQ=255) tatCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGa > 1:2706555/1‑149 (MQ=255) atCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGAt > 1:1815096/1‑149 (MQ=255) tCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATc < 1:1502803/149‑1 (MQ=255) tCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATc < 1:4440188/149‑1 (MQ=255) cGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCa < 2:1436878/149‑1 (MQ=255) cGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCa < 1:252184/149‑1 (MQ=255) gACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGc < 1:3392195/149‑1 (MQ=255) acGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGt > 2:4907177/1‑149 (MQ=255) cGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGtt < 1:4967968/149‑1 (MQ=255) cTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTAc < 1:41106/149‑1 (MQ=255) cTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTAc < 2:2332395/149‑1 (MQ=255) tttCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACt < 2:3141078/149‑1 (MQ=255) tCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACtgt < 1:678859/149‑1 (MQ=255) cGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACtgtg > 2:4918034/1‑149 (MQ=255) ggCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGa < 2:55218/149‑1 (MQ=255) aTGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGAtgtg > 1:3527761/1‑149 (MQ=255) gAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTa > 1:2205880/1‑149 (MQ=255) aTTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAat < 1:13862/149‑1 (MQ=255) gCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAatgat > 2:1609892/1‑149 (MQ=255) gTTATTTACATTTATTTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTc < 1:5013239/149‑1 (MQ=255) gTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTc > 1:231611/1‑149 (MQ=255) gTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTc > 2:3332430/1‑149 (MQ=255) ttATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCa > 2:2234600/1‑149 (MQ=255) tATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCaa > 1:4435331/1‑149 (MQ=255) tACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTa > 2:3954879/1‑149 (MQ=255) cATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTaaa < 2:2868336/149‑1 (MQ=255) cATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTaaa < 2:2766448/149‑1 (MQ=255) aTTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAAc > 1:4551575/1‑149 (MQ=255) aTTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAAc < 2:3663379/149‑1 (MQ=255) aTTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAAc > 1:1926297/1‑149 (MQ=255) aTTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCAGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAAc > 1:135968/1‑149 (MQ=255) aTGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCa < 2:952430/149‑1 (MQ=255) tGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCAc < 2:272874/149‑1 (MQ=255) tAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGc < 1:335634/149‑1 (MQ=255) taataaATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGcc < 2:2166272/149‑1 (MQ=255) aataaataATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCg > 1:1525564/1‑149 (MQ=255) taatCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGcc > 1:4278881/1‑149 (MQ=255) atCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCaa < 1:1088234/149‑1 (MQ=255) atCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCaa < 1:1088198/149‑1 (MQ=255) gTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCg > 2:2584524/1‑149 (MQ=255) cTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAg > 2:2663539/1‑149 (MQ=255) cTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAg > 1:3883331/1‑149 (MQ=255) tcaaatcaaaTTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGa > 1:1575930/1‑149 (MQ=255) atcaaatTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGACTCa > 1:4559761/1‑149 (MQ=255) tcaaatTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCAt < 2:2680492/149‑1 (MQ=255) caaatTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATg > 2:3755744/1‑149 (MQ=255) aaatTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGt < 1:3603816/149‑1 (MQ=255) aaatTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGt > 1:3164901/1‑149 (MQ=255) aaatTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGt > 1:965544/1‑149 (MQ=255) atTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTCAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTAt > 2:1206743/1‑149 (MQ=255) atTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTAt > 2:4776754/1‑149 (MQ=255) ttAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTAtt < 1:4738542/149‑1 (MQ=255) aaaGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATtgtg < 2:1481334/149‑1 (MQ=255) aaaGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATtgtg > 2:2028681/1‑149 (MQ=255) aaGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTgtgt > 1:5069373/1‑149 (MQ=255) aaGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTgtgt > 1:547631/1‑149 (MQ=255) aaGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTgtgt < 1:3275643/149‑1 (MQ=255) tCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCg > 2:243351/1‑149 (MQ=255) cAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCgg > 2:1493323/1‑149 (MQ=255) aTAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTg > 1:2999156/1‑149 (MQ=255) aTAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTg > 2:3889254/1‑149 (MQ=255) aGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCg > 1:3863845/1‑149 (MQ=255) aGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCg > 2:2985816/1‑149 (MQ=255) aGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCg > 1:1004020/1‑149 (MQ=255) ggTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGa > 2:4131863/1‑149 (MQ=255) ggTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGa > 2:64638/1‑149 (MQ=255) gTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATTTATTGTGTCCGGTGCGAc < 2:2511544/149‑1 (MQ=255) ttGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACt < 1:1453693/149‑1 (MQ=255) aTAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCa > 1:4051883/1‑149 (MQ=255) tAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCAc > 2:3276326/1‑149 (MQ=255) tCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCt < 1:3704532/149‑1 (MQ=255) ccATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCTg > 2:5051066/1‑149 (MQ=255) | TGGGATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCAGGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCTG > CP009273/3519511‑3519802 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |