Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,539,825 | G→T | 5.0% | intergenic (+267/‑93) | nfuA → / → gntT | Fe/S biogenesis protein; putative scaffold/chaperone for damaged Fe/S proteins/gluconate transporter, high‑affinity GNT I system |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,539,825 | 0 | G | T | 5.0% | 1166.1 / 30.8 | 298 | intergenic (+267/‑93) | nfuA/gntT | Fe/S biogenesis protein; putative scaffold/chaperone for damaged Fe/S proteins/gluconate transporter, high‑affinity GNT I system |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (131/151); new base T (7/8); total (139/159) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.65e-01 |
Only 100 of 308 total aligned reads displayed.
CGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCTTGTTGTTGCTCCTGATGATC > CP009273/3539677‑3539971 | gcgATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCgtgg > 1:1108039/1‑149 (MQ=255) gcgATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCgtgg < 1:670538/149‑1 (MQ=255) gATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCgtggtg > 2:188500/1‑149 (MQ=255) ataataTGACCAACCTCTAATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGc < 1:807624/149‑1 (MQ=255) taataTGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGcc < 1:3932072/149‑1 (MQ=255) tGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAat < 2:1455380/149‑1 (MQ=255) gACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTTGTGCCGCAata > 2:1713286/1‑149 (MQ=255) gACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAata < 1:2059474/149‑1 (MQ=255) cAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATAtct < 1:873767/149‑1 (MQ=255) aaCCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATAtctc > 1:4455579/1‑149 (MQ=255) aCCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATctct < 2:4215869/149‑1 (MQ=255) ctctCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGt > 2:2010110/1‑149 (MQ=255) ctcATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTc < 1:708641/149‑1 (MQ=255) tcATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTcc < 1:2616121/149‑1 (MQ=255) atttaaatttaCCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGAtt > 2:4760035/1‑149 (MQ=255) ttaaatttaCCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTgg < 2:2322450/149‑1 (MQ=255) ttaaatttaCCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTgg < 2:3582508/149‑1 (MQ=255) taaatttaCCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTggg < 2:3236364/149‑1 (MQ=255) aaatttaCCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTTGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGa < 1:3289325/149‑1 (MQ=255) aatttaCCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTTGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGAt > 2:49867/1‑149 (MQ=255) aatttaCCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGAt > 1:4418476/1‑149 (MQ=255) tttaCCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGAGTGGGATaa > 1:3522828/1‑149 (MQ=255) aCCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTa > 1:3459841/1‑149 (MQ=255) ccccGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTag > 1:4600223/1‑149 (MQ=255) cccGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTaga > 1:2550018/1‑149 (MQ=255) cccGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTaga > 2:4944177/1‑149 (MQ=255) tctGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTg < 2:2345176/149‑1 (MQ=255) ctGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTgt < 1:560659/149‑1 (MQ=255) ctGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTgt > 2:4484129/1‑149 (MQ=255) gATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCa < 1:3902101/149‑1 (MQ=255) cAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAAt < 1:3148900/149‑1 (MQ=255) aaaCGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAAtt > 2:3673574/1‑149 (MQ=255) aaaCGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAAtt > 1:2141609/1‑149 (MQ=255) cGCCAGATGTTACCCGTCTCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACACTAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGCTTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGAc < 1:4526540/149‑1 (MQ=255) cGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGAc < 2:4754894/149‑1 (MQ=255) cGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGAc < 2:788183/149‑1 (MQ=255) gCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACg < 1:2968596/149‑1 (MQ=255) ccAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGt > 1:1236531/1‑149 (MQ=255) ccAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGt < 2:4329669/149‑1 (MQ=255) gTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCa < 2:1838199/149‑1 (MQ=255) ttACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCAt > 1:1788895/1‑149 (MQ=255) tACCCGTATCAGTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATa < 2:4524754/149‑1 (MQ=255) aCCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATaa < 1:3588460/149‑1 (MQ=255) cGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACaa > 2:4068950/1‑149 (MQ=255) gTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACaaa > 2:4817474/1‑149 (MQ=255) gTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACaaa > 1:3376012/1‑149 (MQ=255) gTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACaaa > 2:1497986/1‑149 (MQ=255) tATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAAt > 2:4909761/1‑149 (MQ=255) tATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAAt > 2:220146/1‑149 (MQ=255) tATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAAt < 2:1142536/149‑1 (MQ=255) tCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGa < 1:653944/149‑1 (MQ=255) cATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGaa < 2:2236970/149‑1 (MQ=255) cATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGaa < 2:1182278/149‑1 (MQ=255) aTTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGaaa > 2:1581326/1‑149 (MQ=255) cacaTGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGc < 2:2405034/149‑1 (MQ=255) caTGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCa < 1:3702959/149‑1 (MQ=255) caTGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCa < 2:1108039/149‑1 (MQ=255) caTGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCa > 1:3847616/1‑149 (MQ=255) tGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAgg > 1:1958370/1‑149 (MQ=255) tGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAgg < 1:4594935/149‑1 (MQ=255) tGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAgg > 1:563461/1‑149 (MQ=255) gggTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGt < 2:3876725/149‑1 (MQ=255) tACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTaaa < 1:4160913/149‑1 (MQ=255) tACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTaaa > 2:4166800/1‑149 (MQ=255) aCCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAAt > 1:1568322/1‑149 (MQ=255) cAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCa < 2:3606812/149‑1 (MQ=255) aaCATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATg > 2:1648969/1‑149 (MQ=255) aaCATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATg > 2:4012021/1‑149 (MQ=255) aCATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGc < 2:1388314/149‑1 (MQ=255) cATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGcc < 2:2550851/149‑1 (MQ=255) aTACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCa > 1:2239169/1‑149 (MQ=255) tACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCAt < 2:3061303/149‑1 (MQ=255) tGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCa > 1:43373/1‑149 (MQ=255) gACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCAt > 1:5056116/1‑149 (MQ=255) aCATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCAtt < 2:549892/149‑1 (MQ=255) aCATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCAtt > 1:174027/1‑149 (MQ=255) aTCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCAttgt < 1:3064219/149‑1 (MQ=255) tGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGc > 2:5118082/1‑149 (MQ=255) tGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGc < 2:1060697/149‑1 (MQ=255) tGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGc > 2:2120905/1‑149 (MQ=255) tGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGc < 1:3996707/149‑1 (MQ=255) aCTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTa > 1:1333662/1‑149 (MQ=255) aCTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTa > 1:4087667/1‑149 (MQ=255) tACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTTGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATc < 1:4135159/149‑1 (MQ=255) cAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCgg < 2:3424497/149‑1 (MQ=255) aataatTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGgt < 1:988903/149‑1 (MQ=255) aataatTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGgt > 1:2734830/1‑149 (MQ=255) aataatTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGGTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGgt < 1:4030265/149‑1 (MQ=255) taatTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGgtgt > 2:4342905/1‑149 (MQ=255) atTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTaa > 2:2921862/1‑149 (MQ=255) ttAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAAt < 1:1783820/149‑1 (MQ=255) ttAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAAt < 1:1022751/149‑1 (MQ=255) gTTTTAGTGGGTATCAGTCGTTGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCtt > 2:4399067/1‑149 (MQ=255) ttttAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCttg > 2:471563/1‑149 (MQ=255) ttAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCttgtt < 2:2785982/149‑1 (MQ=255) tAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCttgttg < 1:159327/149‑1 (MQ=255) aGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCttgttgt > 1:3218181/1‑149 (MQ=255) gTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCTTGTTGTTGCTc < 1:2629983/149‑1 (MQ=255) gTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCTTGTTGTTGCTc > 1:3469531/1‑149 (MQ=255) cGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCTTGTTGTTGCTCCTgatgat < 1:299659/149‑1 (MQ=255) | CGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCTTGTTGTTGCTCCTGATGATC > CP009273/3539677‑3539971 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |