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aggGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGtcatc > 1:3274433/1‑150 (MQ=255) aggGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGtcatc > 1:5162586/1‑150 (MQ=255) gggggTCGGCTGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGtcatca < 2:2537560/150‑1 (MQ=255) ggggTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcgaatcctgcacgacccaccaatgtaaaaaagcgccctaaaggcgcttttttgctat < 1:5303719‑M2/150‑114 (MQ=255) ggcggTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcgaatcctgcacgacccaccaatttaaaggtggttactggtagagaaagtgaaggataacgttg < 2:4183386‑M2/150‑120 (MQ=255) ggcggTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACccacca > 1:4134451/1‑150 (MQ=255) gcggTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcgaatcctgcacgacccaccaatttaaaggtggttactggtagagaacgtgaagga < 2:1476262‑M2/141‑112 (MQ=255) gATCCCGTCATCACCCACCACTTcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaagtggtcgcaggttcgaatcctgcacgacccaccaatgtaaaaaagcgccctacaggcgcttgtttcctatctgcgatactcgaa < 2:3869557‑M2/150‑128 (MQ=255) tCCCGTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCg > 1:2183293/1‑150 (MQ=255) cccGTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGt > 1:5155916/1‑150 (MQ=255) cGTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAACTTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGTTa < 1:2040038/150‑1 (MQ=255) gTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGTTAg > 1:4778369/1‑150 (MQ=255) gTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGTTAg > 2:2641872/1‑150 (MQ=255) tcatcaCCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGTTAGc > 2:5062909/1‑150 (MQ=255) acccaccACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGTTAGCTCAGt > 2:144000/1‑150 (MQ=255) ccaccaCTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTg < 1:4016142/150‑1 (MQ=255) caccacTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTgg > 1:3890326/1‑150 (MQ=255) caccacTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTgg > 1:1882953/1‑150 (MQ=255) ccacTTTCCCGCCAGCTAAATTTCATGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTa < 2:315382/150‑1 (MQ=255) acTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAATATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTaga < 2:409781/150‑1 (MQ=255) tttCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGc < 2:1622579/150‑1 (MQ=255) ttCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTACAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGAGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCa < 1:4615923/150‑1 (MQ=255) | AACGAACAATTTCTTTAGAAAATGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCA > CP009273/2514339‑2514637 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |