Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,921,101 | C→A | 100% | intergenic (+70/‑487) | ygdH → / → sdaC | UPF0717 family protein/putative serine transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,921,101 | 0 | C | A | 98.4% | 1002.6 / 5.1 | 314 | intergenic (+70/‑487) | ygdH/sdaC | UPF0717 family protein/putative serine transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/4); new base A (132/177); total (133/181) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.00e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.51e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 337 total aligned reads displayed.
CTACAGGGTTTTGTTGCCCAGCATCGTATGAAGTTGCCAGGCTCAGCCTACATCCCTTGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGAT > CP009273/2920954‑2921247 | cTACAGGGTTTTGTTGCCCAGCATCGTATGAAGTTGCCAGGCTCAGCCTACATCCCTTGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACtcatttaat > 1:1777065/1‑150 (MQ=255) tACAGGGTTTTGTTGCCCAGCATCGTATGAAGTTGCCAGGCTCAGCCTACATCCCTTGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACtcatttaatt > 1:204820/1‑150 (MQ=255) cAGGGTTTTGTTGCCCAGCATCGTATGAAGTTGCCAGGCTCAGCCTACATCCCTTGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTg > 1:4860352/1‑150 (MQ=255) gTTTTGTTGCCCAGCATCGTATGAAGTTGCCAGGCTCAGCCTACATCCCTTGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTtat < 2:4441608/150‑1 (MQ=255) ttgttgCCCAGCATCGTATGAAGTTGCCAGGCTCAGCCTACATCCCTTGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATg < 1:3269159/150‑1 (MQ=255) tgttgCCCAGCATCGTATGAAGTTGCCAGGCTCAGCCTACATCCCTTGCCACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGa < 2:1491143/150‑1 (MQ=255) ttgCCCAGCATCGTATGAAGTTGCCAGGCTCAGCCTACATCCCTTGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAAt < 2:3198949/150‑1 (MQ=255) ccAGCATCGTATGAAGTTGCCAGGCTCAGCCTACATCCCTTGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATtttt > 1:783291/1‑150 (MQ=255) cAGCATCGTATGAAGTTGCCAGGCTCAGCCTACATCCCTTGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTc < 2:559334/150‑1 (MQ=255) cATCGTATGAAGTTGCCAGGCTCAGCCTACATCCCTTGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTa < 2:1389814/150‑1 (MQ=255) aTCGTATGAAGTTGCCAGGCTCAGCCTACATCCCTTGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTac > 2:267457/1‑150 (MQ=255) aTCGTATGAAGTTGCCAGGCTCAGCCTACATCCCTTGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTac < 2:1597840/150‑1 (MQ=255) gTATGAAGTTGCCAGGCTCAGCCTACATCCCTTGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTaccac > 1:111978/1‑150 (MQ=255) tGAAGTTGCCAGGCTCAGCCTACATCCCTTGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCt > 1:3666198/1‑150 (MQ=255) tGAAGTTGCCAGGCTCAGCCTACATCCCTTGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCt < 1:1516602/150‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCAGGCTCAGCCTACATCCCTAGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCt > 1:3000978/1‑150 (MQ=255) gAAGTTGCCAGGCTCAGCCTACATCCCTTGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTc < 1:675692/150‑1 (MQ=255) aGTTGCCAGGCTCAGCCTACATCCCTTGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCAc < 2:664558/150‑1 (MQ=255) cAGGCTCAGCCTACATCCCTTGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACa < 2:3462578/150‑1 (MQ=255) tCAGCCTACATCCCTTGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAatat < 1:2808230/150‑1 (MQ=255) aGCCTACATCCCTTGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATatca > 1:5311138/1‑150 (MQ=255) gCCTACATCCCGTGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATatcat < 2:3145826/150‑1 (MQ=255) ccTACATCCCTTGCTAAGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCACCCGGTGACGTGTGATGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATatcatc > 2:1656280/1‑150 (MQ=255) cTACATCCCTTGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATAtcatca > 2:2449516/1‑150 (MQ=255) cATCCCTTGCTTCGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAg < 2:5258463/150‑1 (MQ=255) aTCCCTTGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGt > 2:1052045/1‑150 (MQ=255) aTCCCTTGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGt > 2:3936995/1‑150 (MQ=255) aTCCCTTGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCACCCTGTGACGTTTGTTGCAGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATAATCACAGt < 2:3989162/150‑1 (MQ=255) tCCCTTGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGtt > 1:2086033/1‑150 (MQ=255) cTTGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAat < 2:4997919/150‑1 (MQ=255) tGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAatat < 1:267457/150‑1 (MQ=255) gCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATg < 1:5029667/150‑1 (MQ=255) cTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTTAAGTTTGTTGCCGGGTTTTCTAGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTAAATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCAGCACAGTTAATATGt > 1:2170049/1‑150 (MQ=255) aCGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTcg < 2:4239249/150‑2 (MQ=255) aCGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCa > 2:3628438/1‑150 (MQ=255) aCGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATGTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCa > 1:584412/1‑150 (MQ=255) gAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATa < 2:954251/150‑1 (MQ=255) aaaTCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATAc > 2:5223149/1‑150 (MQ=255) aTCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACaa < 2:3355453/150‑1 (MQ=255) cTGCTCGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAAtt < 1:3511210/150‑1 (MQ=255) tGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAAttt > 1:2497403/1‑150 (MQ=255) cACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAATTTAt < 1:2238021/150‑1 (MQ=255) cGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAATTTATGt < 2:4613076/150‑1 (MQ=255) gTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAATTTATGtt > 1:2933685/1‑150 (MQ=255) gTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAATTTATGtt > 1:1732495/1‑150 (MQ=255) tAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAATTTATGTTg < 2:4736670/150‑1 (MQ=255) caTCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAATTTATGTTGc < 2:1311130/149‑1 (MQ=255) aTCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATAATCACAGTTAATATGTCATACAATTTATGTTGCa > 2:3311886/1‑150 (MQ=255) ctcCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAATTTATGTTGCAAc < 2:4781366/150‑1 (MQ=255) tcCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAATTTATGTTGCAACg < 1:5221308/150‑1 (MQ=255) tcCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAATTTATGTTGCAACg < 2:1114285/150‑1 (MQ=255) gCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCaa > 1:4336485/1‑150 (MQ=255) tCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAAc < 2:5086676/150‑1 (MQ=255) tCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAAc < 1:1477512/150‑1 (MQ=255) tCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAAc < 1:4750050/150‑1 (MQ=255) tCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAAc < 2:3088432/150‑1 (MQ=255) tCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAAc < 2:1865652/150‑1 (MQ=255) cccccGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACg > 2:74128/1‑150 (MQ=255) 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tttGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTAtttt < 1:1915308/150‑1 (MQ=255) ttgttgCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTc < 2:1818675/150‑1 (MQ=255) tgttgCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCa < 1:4356871/150‑1 (MQ=255) tgCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATaa < 2:733733/150‑1 (MQ=255) gCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTAATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATaaa < 2:3738109/150‑1 (MQ=255) 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catttaatttGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCAtt > 1:3303180/1‑149 (MQ=255) atttaatttGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCAtta > 1:1576142/1‑148 (MQ=255) | CTACAGGGTTTTGTTGCCCAGCATCGTATGAAGTTGCCAGGCTCAGCCTACATCCCTTGCTACGAAATCTGCACGTAATCTCCGCTCCCCCGGTGACGTTTGTTGCCGGGTTTTCTCGTTTTTGGTCACTTACTCATCAACTCATTTCATTTGTTATATGAATGTTTCTTACCACCCTCACGCGACAAATATCATCACAGTTAATATGTCATACAATTTATGTTGCAACGCAAACGTTTCCCTATTTTCATAAACCGTATTTTATCGCTATGAAAAAGAAATTATCGCCATGAT > CP009273/2920954‑2921247 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |